| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 1. 文献综述 | 第13-27页 |
| 1.1 生物信息学的定义 | 第13-14页 |
| 1.2 生物信息学的发展历程 | 第14页 |
| 1.3 后基因组时代生物信息学的主要研究领域及其进展 | 第14-19页 |
| 1.3.1 测序技术 | 第14页 |
| 1.3.2 数据库 | 第14-16页 |
| 1.3.3 序列比对和分析 | 第16-17页 |
| 1.3.4 分子进化 | 第17页 |
| 1.3.5 组学研究 | 第17-19页 |
| 1.4 比较转录组分析的研究进展 | 第19-20页 |
| 1.5 NR超家族的概况 | 第20-25页 |
| 1.5.1 NR的结构 | 第20-21页 |
| 1.5.2 NR超家族的成员及其系统命名、分类 | 第21-24页 |
| 1.5.3 NR超家族成员的功能 | 第24-25页 |
| 1.6 本研究的立项依据和目的意义 | 第25-27页 |
| 2. 两种罗非鱼6月龄性腺转录组的比较分析 | 第27-41页 |
| 2.1 引言 | 第27-28页 |
| 2.2 材料、仪器与方法 | 第28-31页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第28页 |
| 2.2.2 实验试剂和仪器 | 第28页 |
| 2.2.3 实验方法 | 第28-31页 |
| 2.3 实验结果 | 第31-37页 |
| 2.3.1 两种罗非鱼雌、雄性腺转录组数据的比较 | 第31-33页 |
| 2.3.2 两种罗非鱼雌、雄性腺基因表达模式的比较 | 第33-36页 |
| 2.3.3 两种罗非鱼性腺中类固醇激素合成酶基因表达模式的比较 | 第36-37页 |
| 2.3.4 IHC验证4个基因在两种罗非鱼180 dah性腺中的表达水平 | 第37页 |
| 2.4 讨论 | 第37-41页 |
| 2.4.1 奥利亚罗非鱼6月龄性腺转录组 | 第38-39页 |
| 2.4.2 两种罗非鱼6月龄性腺转录组比较 | 第39-41页 |
| 3. NR超家族的生物信息学分析 | 第41-67页 |
| 3.1 引言 | 第41-42页 |
| 3.2 材料与方法 | 第42-48页 |
| 3.2.1 实验鱼 | 第42页 |
| 3.2.2 尼罗罗非鱼NR超家族成员的鉴定 | 第42-43页 |
| 3.2.3 NR超家族的系统发育分析以及基因定位 | 第43-45页 |
| 3.2.4 NR在尼罗罗非鱼中的时空表达模式分析 | 第45-46页 |
| 3.2.5 NR表达模式的验证 | 第46-48页 |
| 3.3 结果 | 第48-60页 |
| 3.3.1 尼罗罗非鱼及其它鱼类中NR基因的分离鉴定 | 第48页 |
| 3.3.2 NR超家族的系统进化分析 | 第48-51页 |
| 3.3.3 NR基因的基因组定位及其基因簇分析 | 第51-52页 |
| 3.3.4 NR在尼罗罗非鱼成鱼8个组织中的表达模式分析 | 第52-53页 |
| 3.3.5 NR在尼罗罗非鱼不同发育时期性腺转录组中的表达模式分析 | 第53-56页 |
| 3.3.6 两种罗非鱼180 dah性腺中NR基因表达模式的比较 | 第56-58页 |
| 3.3.7 通过qPCR和ISH对NR表达模式验证的结果分析 | 第58-60页 |
| 3.4 讨论 | 第60-67页 |
| 3.4.1 NR成员的分离、系统发生及共线性 | 第60-61页 |
| 3.4.2 NR成员的扩张和进化与基因组进化的关系 | 第61页 |
| 3.4.3 NR基因在8个成鱼组织中的表达及其意义 | 第61-62页 |
| 3.4.4 NR基因在不同发育时期性腺中的表达及其意义 | 第62-63页 |
| 3.4.5 NR复制基因在尼罗罗非鱼中的表达模式产生分歧 | 第63-64页 |
| 3.4.6 转录组中NR基因表达模式的实验验证 | 第64-67页 |
| 4. 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-83页 |
| 致谢 | 第83-85页 |
| 在读期间发表论文 | 第85页 |
| 在读期间参加科研情况 | 第85页 |
