| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-21页 |
| 1 植物胁迫应答基因的调控方式与mRNA结构 | 第11-12页 |
| 2 真核生物中的转录后调控与3’UTR | 第12-15页 |
| ·3 ’UTR区与mRNA末端信号加工 | 第12页 |
| ·3 ’UTR区与mRNA在细胞质内的正确定位 | 第12-13页 |
| ·3 ’UTR区与mRNA的翻译 | 第13页 |
| ·3 ’UTR区与mRNA的稳定性 | 第13-14页 |
| ·3 ’UTR区与5’UTR区的分子内互作 | 第14-15页 |
| ·3 ’UTR区与miRNA | 第15页 |
| 3 植物miRNA与植物胁迫应答机制 | 第15-21页 |
| ·植物miRNA的合成 | 第16页 |
| ·植物miRNA的特点 | 第16-17页 |
| ·植物miRNA的作用机制 | 第17页 |
| ·miRNA与植物生物胁迫应答机制 | 第17-18页 |
| ·miRNA与植物非生物胁迫应答机制 | 第18-19页 |
| ·植物胁迫应答机制研究与miRNA的研究展望 | 第19-21页 |
| 第二章 水稻胁迫应答基因3’UTR模体的计算识别 | 第21-67页 |
| 1 前言 | 第21-26页 |
| ·胁迫种类与基因调控方式 | 第21-23页 |
| ·植物胁迫应答调控模体的研究现状 | 第23-25页 |
| ·植物胁迫应答基因3’UTR模体研究与农业发展 | 第25-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-29页 |
| ·水稻Unigene数据、成熟miRNA数据与miRNA功能注释数据 | 第26页 |
| ·水稻Unigene数据的解析与筛选 | 第26页 |
| ·水稻基因CDS和3’UTR序列与胁迫关系的判定和提取 | 第26-27页 |
| ·水稻基因CDS数据库的构建 | 第27页 |
| ·水稻基因3’UTR数据库的构建 | 第27页 |
| ·水稻基因3’UTR序列中的motif预测与初选 | 第27-28页 |
| ·水稻胁迫应答基因3’UTR调控motif的复选 | 第28页 |
| ·水稻胁迫应答基因3’UTR调控motif的功能分类 | 第28页 |
| ·水稻寒胁迫应答基因3’UTR调控motif数据库的构建 | 第28-29页 |
| ·水稻基因3’UTR调控motif数据库的构建 | 第29页 |
| 3 结果与讨论 | 第29-67页 |
| ·水稻基因CDS序列数据库建立 | 第29-31页 |
| ·水稻基因3’UTR序列数据库建立 | 第31页 |
| ·水稻基因3’UTR调控motif数据库建立 | 第31-32页 |
| ·水稻寒胁迫应答基因3’UTR调控motif数据库建立 | 第32-33页 |
| ·水稻胁迫应答基因3’UTR候选motif的解析 | 第33-58页 |
| ·水稻胁迫应答基因3’UTR候选motif的解析与功能分类 | 第58-67页 |
| 第三章 水稻microRNA的SNP多态性分析 | 第67-86页 |
| 1 前言 | 第67-68页 |
| 2 材料与方法 | 第68-70页 |
| ·pre-miRNA数据、SNP数据、水稻染色体数据 | 第68-69页 |
| ·Pre-miRNA在水稻染色体上的定位 | 第69页 |
| ·Pre-miRNA及其侧翼区,蛋白编码基因及侧翼区SNP分布 | 第69页 |
| ·Pre-miRNA二级结构分区及SNP分布 | 第69页 |
| ·SNP位点、pre-miRNA和蛋白编码基因在染色体上的分布 | 第69-70页 |
| ·SNP分布的显著性检验 | 第70页 |
| 3 结果 | 第70-78页 |
| ·水稻pre-miRNA及其侧翼区SNP频率无显著性差异 | 第70-72页 |
| ·水稻蛋白编码基因及基因侧翼区SNP分布 | 第72-73页 |
| ·水稻中SNP位点、miRNA基因及蛋白编码基因在染色体上的分布 | 第73-77页 |
| ·水稻SNP在pre-miRNA二级结构不同区间的分布 | 第77-78页 |
| 4 讨论 | 第78-86页 |
| 参考文献 | 第86-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第95页 |
