| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 符号对照表 | 第12-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-32页 |
| 第一节 选题背景与意义 | 第14-15页 |
| 第二节 芳香烃硝化反应的应用与工业实现概况 | 第15-18页 |
| 第三节 细胞色素P450的研究概况 | 第18-28页 |
| ·CYPs的生理角色与底物识别特性的研究现状 | 第18-22页 |
| ·CYPs的催化反应机制简述 | 第22-24页 |
| ·CYPs的蛋白质工程改造及应用举例 | 第24-28页 |
| 第五节 TxtE在萨克多敏A(Thaxtomin A)合成链条中的硝基化作用 | 第28-31页 |
| 第六节 本课题的研究内容与意义 | 第31页 |
| 第七节 论文结构安排 | 第31-32页 |
| 第二章 TxtE酶的晶体学研究与结构解析 | 第32-82页 |
| 第一节 TxtE酶的基本理化性质及结构预测 | 第32-40页 |
| ·TxtE酶编码基因碱基序列稀有密码子含量及分布 | 第32-33页 |
| ·TxtE酶的理论分子量、等电点、吸光特性、半胱氨酸含量等理化特性的生物信息学计算与预测 | 第33-34页 |
| ·TxtE酶可能拥有的信号肽与跨膜区预测 | 第34-35页 |
| ·TxtE酶的家族同源性及功能域组成分析 | 第35-38页 |
| ·TxtE酶的二级结构分布及三维结构预测 | 第38-40页 |
| ·小结 | 第40页 |
| 第二节 TxtE酶基因的克隆与重组表达载体的构建 | 第40-48页 |
| ·现有实验室常用表达系统的局限 | 第41-42页 |
| ·利用Smt3p蛋白构建融合表达载体 | 第42-46页 |
| ·TxtE基因的克隆与原核融合表达质粒的构建 | 第46-48页 |
| 第三节 TxtE酶在原核系统中的异源重组表达与提纯 | 第48-55页 |
| ·TxtE酶的异源表达小试 | 第48-49页 |
| ·TxtE重组融合蛋白的大量表达 | 第49-50页 |
| ·TxtE蛋白的提纯 | 第50-55页 |
| 第四节 TxtE酶野生型母体晶体的培养与衍射数据收集 | 第55-66页 |
| ·蛋白质结晶的基本原理 | 第55-57页 |
| ·TxtE酶结晶条件的初步筛选 | 第57-58页 |
| ·TxtE酶晶体的优化 | 第58-60页 |
| ·TxtE酶晶体X射线衍射数据的收集 | 第60-65页 |
| ·小结 | 第65-66页 |
| 第五节 TxtE酶野生型母体晶体衍射数据的相位确定与结构解析 | 第66-82页 |
| ·蛋白质晶体结构解析中的相位问题及主要解决方案 | 第66-68页 |
| ·分子置换法解析蛋白质三维结构的具体理论基础和方法实现 | 第68-70页 |
| ·利用分子置换法解析TxtE酶母体晶体的三维结构 | 第70-82页 |
| 第三章 TxtE酶与底物复合体的晶体结构解析 | 第82-88页 |
| 第一节 TxtE酶与底物L-Trp复合体晶体的制备 | 第82-83页 |
| 第二节 TxtE与配体L-Trp复合体晶体衍射数据的收集与处理 | 第83-85页 |
| 第三节 TxtE与配体L-Trp复合体晶体结构的解析 | 第85-88页 |
| 第四章 TxtE酶的底物识别机制与功能分析 | 第88-96页 |
| 第一节 TxtE酶三维结构的组成与底物通道 | 第88-90页 |
| 第二节 TxtE酶活性位点与底物结合区的检视 | 第90-92页 |
| 第三节 TxtE酶质子和电子传递通道 | 第92-96页 |
| ·质子传递链 | 第92-95页 |
| ·电子传递途经 | 第95-96页 |
| 第五章 结论与讨论 | 第96-98页 |
| 附录A TxtE的编码碱基与氨基酸序列 | 第98-100页 |
| 第一节 TxtE基因碱基序列 | 第98-99页 |
| 第二节 TxtE氨基酸序列 | 第99-100页 |
| 附录B 攻读博士学位期间参与的其他研究课题 | 第100-121页 |
| 第一节 布尼维尔病毒核蛋白与核酸复合体结构与功能研究 | 第100-115页 |
| B.1.1 课题的研究背景与意义 | 第100-106页 |
| B.1.2 本课题的研究内容与意义 | 第106-107页 |
| B.1.3 主要工作内容与结果 | 第107-109页 |
| B.1.4 结论与讨论 | 第109-115页 |
| 第二节 面向天然产物混合物高通量药物筛选体系的建设 | 第115-121页 |
| B.2.1 选题背景 | 第115-116页 |
| B.2.2 技术方案 | 第116-118页 |
| B.2.3 工作内容与成果 | 第118-121页 |
| 参考文献 | 第121-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文及研究成果 | 第130页 |
