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三明野生蕉和天宝蕉WHIRLY基因克隆及其定量表达分析

縮写词第1-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-15页
第一章 引言第15-21页
 1 香蕉分子生物学研究进展第16-17页
 2 野生蕉研究进展第17-18页
 3 WHIRLY转录因子研究进展第18-20页
 4 本研究的目的及意义第20-21页
   ·本研究的意义第20页
   ·本研究的主要内容第20-21页
第二章 香蕉基因组WHIRLY家族基因基因结构和生物信息学分析第21-29页
 1 材料与方法第21页
   ·材料第21页
   ·方法第21页
 2 结果分析第21-28页
   ·香蕉全基因组WHIRLY家族基因分布及结构特点第21-22页
   ·香蕉全基因组WHIRLY基因家族生物信息学预测与分析第22-28页
     ·香蕉基因组Why1基因编码蛋白质基本理化性质的预测与分析第22-23页
     ·香蕉基因组Why1蛋白质亲疏水性预测第23-24页
     ·香蕉基因组Why1保守结构域的预测分析第24页
     ·香蕉基因组Why1蛋白质信号肽的预测分析第24-25页
     ·香蕉基因组Why1蛋白质亚细胞定位预测第25页
     ·香蕉基因组Why1磷酸化位点的预测与分析第25页
     ·香蕉基因组Why1蛋白二级结构和三级结构的预测分析第25-26页
     ·香蕉基因组Why1蛋白卷曲螺旋结构预测与分析第26-27页
     ·香蕉基因组Why1蛋白的跨膜结构预测分析第27-28页
 3 讨论第28-29页
第三章 三明野生蕉和天宝蕉WHIRLY基因克隆第29-60页
 第一节 三明野生蕉WHIRLY基因的克隆第29-48页
  1 材料与方法第29-32页
   ·材料第29页
   ·方法第29-32页
     ·总RNA提取以及cDNA第一链的合成第29-30页
     ·引物的设计合成第30页
     ·目的片段的扩增第30-31页
     ·目的片段的回收、克隆和测序第31页
     ·三明野生蕉Whyl基因生物信息学分析第31-32页
  2 结果与分析第32-48页
   ·三明野生蕉叶片总RNA的提取及质量检测第32页
   ·三明野生蕉WHIRLY基因的保守区序列的克隆第32-35页
     ·三明野生蕉Why1基因ORF的克隆和3端核酸序列的获得第32-33页
     ·三明野生蕉Why2基因保守区的克隆第33-34页
     ·三明野生蕉Why3基因保守区的克隆第34页
     ·三明野生蕉Why1基因3端核酸序列的克隆第34-35页
     ·三明野生蕉Why2基因3端核酸序列的克隆第35页
     ·三明野生蕉Why3基因3端核酸序列的克隆第35页
   ·三明野生蕉与马来西亚小果野蕉WHIRLY基因核酸多序列比对结果第35-40页
     ·三明野生蕉Why1基因与马来西亚小果野蕉Whyl(GSMUA_Achr6P29060_001)ORF核酸序列多序列比对结果第35-37页
     ·三明野生蕉Why2基因与马来西亚小果野蕉Why2(GSMUA_Achr9P08300_001)ORF核酸序列多序列比对结果第37-38页
     ·三明野生蕉Why3基因与马来西亚小果野蕉Why2(GSMUA_Achr9P08300_001)ORF核酸序列多序列比对结果第38-39页
     ·三明野生蕉Why2基因与三明野生蕉Why3核酸序列多序列比对结果第39-40页
   ·三明野生蕉WHIRLY基因生物信息学分析第40-48页
     ·三明野生蕉Why1基因编码蛋白质基本理化性质的预测与分析第40-41页
     ·三明野生蕉Why1基因编码蛋白质亲疏水性预测第41页
     ·三明野生蕉Why1基因编码蛋白质亲疏水性预测第41-42页
     ·三明野生蕉Why1蛋白质信号肽的预测分析第42页
     ·三明野生蕉Why1亚细胞定位预测第42页
     ·三明野生蕉Why1质跨膜结构的预测第42-43页
     ·三明野生蕉Why1卷曲螺旋结构预测与分析第43-44页
     ·三明野生蕉Why1磷酸化位点的预测与分析第44-45页
     ·三明野生蕉Why1蛋白二级结构的预测分析第45-46页
     ·三明野生蕉Why1蛋白三级结构的预测分析第46-47页
     ·三明野生蕉Why1与其他植物WHIRLY蛋白的同源性和分子系统进化分析第47-48页
  3 讨论第48页
 第二节 天宝蕉WHIRLY基因克隆及生物信息学分析第48-60页
  1 材料与方法第49-50页
   ·材料第49页
   ·方法第49-50页
     ·总RNA提取以及cDNA第一链的合成第49页
     ·引物的设计合成第49页
     ·天宝蕉WHIRLY基因生物信息学分析第49-50页
  2 结果与分析第50-59页
   ·天宝蕉总RNA的提取及质量检测第50页
   ·天宝蕉Why1基因ORF的克隆第50-54页
     ·天宝蕉Why1基因ORF的克隆第50-51页
     ·天宝蕉Why1基因与马来西亚小果野蕉Why1(GSMUA_Achr6P29060_001)ORF核酸序列多序列比对结果第51-52页
     ·天宝蕉Why1基因与三明野生蕉Whyl的ORF核酸序列多序列比对结果第52-54页
   ·天宝蕉Why1的生物信息学预测与分析第54-59页
     ·天宝蕉Why1蛋白基本理化性质的预测与分析第54页
     ·天宝蕉Why1亲疏水性预测第54-55页
     ·天宝蕉Why1蛋白保守结构域预测第55页
     ·天宝蕉Why1蛋白质信号肽的预测分析第55页
     ·天宝蕉Why1亚细胞定位预测第55-56页
     ·天宝蕉Why1跨膜结构的预测第56页
     ·天宝蕉Why1蛋白卷曲螺旋结构预测与分析第56-57页
     ·天宝蕉Why1磷酸化位点的预测与分析第57-58页
     ·天宝蕉Why1蛋白二级结构的预测分析第58页
     ·天宝蕉Why1蛋白三级结构的预测分析第58-59页
  3 讨论第59-60页
第四章 三明野生蕉WHIRLY基因定量表达分析第60-73页
 1 材料与方法第60-63页
   ·材料第60页
   ·不同胁迫处理第60-62页
     ·不同温度低温胁迫处理第60-61页
     ·8℃低温胁迫处理第61页
     ·水杨酸处理第61-62页
   ·引物设计及qPCR第62-63页
 2 结果与分析第63-71页
   ·三明野生蕉WHIRLY基因qPCR扩增引物的扩增效率和特异性分析第63页
   ·三明野生蕉WHIRLY基因的定量表达分析第63-71页
     ·三明野生蕉Why1基因低温胁迫下的定量表达分析第63-64页
     ·三明野生蕉Why2基因低温胁迫下的定量表达分析第64-65页
     ·三明野生蕉Why1基因8℃低温胁迫下的定量表达分析第65-66页
     ·三明野生蕉Why2基因8℃低温胁迫下的定量表达分析第66页
     ·三明野生蕉Why1基因SA处理下的定量表达分析第66-69页
     ·三明野生蕉Why2基因SA处理下的定量表达分析第69-71页
 3 讨论第71-73页
   ·三明野生蕉WHIRLY基因可能在参与低温胁迫中起主要作用第71页
   ·三明野生蕉WHIRLY基因可能在参与SA处理中起主要作用第71-73页
第五章 天宝蕉WHIRLY基因的定量表达分析第73-78页
 1 材料与方法第73-74页
   ·材料第73页
   ·不同处理第73页
   ·引物设计及qPCR第73-74页
 2 结果与分析第74-76页
   ·天宝蕉Why1基因qPCR扩增引物的扩增效率和特异性分析第74页
   ·天宝蕉Why1基因的定量表达分析第74-76页
     ·天宝蕉Why1基因4℃的定量表达分析第74-75页
     ·天宝蕉Why1基因SA处理下的定量表达分析第75页
     ·天宝蕉Why1基因NaCl处理下的定量表达分析第75-76页
 3 讨论第76-78页
   ·天宝蕉Why1基因可能在参与响应低温处理中起主要作用第76页
   ·天宝蕉Why1基因可能在参与响应SA处理和NaCl处理中起主要作用第76-78页
第六章 小结第78-80页
参考文献第80-86页
附录 WHIRLY基因(cDNA)序列登录第86-94页
攻读硕士期间发表论文情况与参加学术会议情况第94-95页
致谢第95页

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