摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
第一章 引言 | 第11-25页 |
1 湖泊水体细菌的生态功能 | 第11-13页 |
·湖泊细菌的生产力 | 第11页 |
·湖泊细菌参与的生物地球化学过程 | 第11-13页 |
2 细菌群落结构与多样性 | 第13-16页 |
·不同湖泊生境细菌多样性的研究概况 | 第13-16页 |
·细菌群落多样性的空间分布及季节性特征 | 第16页 |
3 湖泊细菌群落结构和多样性的研究方法 | 第16-24页 |
·传统的微生物学技术 | 第17-18页 |
·分子生物学技术 | 第18-24页 |
4 本论文的研究内容、目的和意义 | 第24-25页 |
第二章 左海湖水体细菌群落的时空演替 | 第25-54页 |
1 材料与方法 | 第25-32页 |
·样品采集与处理 | 第25页 |
·供试载体 | 第25页 |
·培养基 | 第25页 |
·生化试剂 | 第25-26页 |
·PCR引物 | 第26页 |
·水体环境因子的测定 | 第26页 |
·水体细菌的收集 | 第26-27页 |
·水体细菌丰度的测定 | 第27页 |
·水体细菌基因组DNA的提取 | 第27-28页 |
·水体细菌16S rRNA基因V3区片段的扩增 | 第28页 |
·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第28-29页 |
·细菌16S rRNA基因V3区片段的回收及克隆 | 第29-31页 |
·数据分析 | 第31-32页 |
2 实验结果 | 第32-50页 |
·左海湖环境因子分析 | 第32-35页 |
·左海湖细菌丰度的时空分布变化 | 第35-38页 |
·DGGE图谱分析 | 第38-40页 |
·DGGE图谱的聚类分析 | 第40-42页 |
·左海湖细菌多样性分析 | 第42-44页 |
·16S rRNA基因序列及系统发育分析 | 第44-46页 |
·左海湖细菌群落的时空变化分析 | 第46-47页 |
·左海湖细菌群落组成与环境因子的相关性分析 | 第47-50页 |
3 讨论 | 第50-54页 |
·左海湖细菌丰度的时空分布变化 | 第50-51页 |
·左海湖细菌群落结构的时空分布变化 | 第51-52页 |
·左海湖细菌群落结构与水质环境因子的相关性 | 第52-54页 |
第三章 左海湖水体细菌16S rRNA基因克隆文库构建及多样性分析 | 第54-71页 |
1 材料与方法 | 第54-58页 |
·实验材料 | 第54页 |
·样品的选择 | 第54页 |
·水体样品细菌基因组DNA的提取 | 第54页 |
·细菌16S rRNA基因全长片段的扩增 | 第54-55页 |
·克隆文库的构建 | 第55页 |
·细菌16S rRNA基因扩增片段的限制性酶切分析 | 第55-56页 |
·细菌16S rRNA基因序列测定及相关分析 | 第56-58页 |
2 实验结果 | 第58-68页 |
·细菌16S rRNA基因全长序列的扩增 | 第58页 |
·16S rRNA基因克隆文库构建及ARDRA分型分析 | 第58-59页 |
·水体细菌多样性分析 | 第59-60页 |
·克隆文库的群落组成分析 | 第60-62页 |
·系统发育分析 | 第62-68页 |
3 讨论 | 第68-71页 |
·左海湖水体细菌多样性 | 第68页 |
·左海湖水体细菌群落结构 | 第68-69页 |
·克隆文库与DGGE实验结果的比较 | 第69-71页 |
小结 | 第71-72页 |
参考文献 | 第72-80页 |
附录A | 第80-83页 |
附录B | 第83-84页 |
附录C 攻读学位期间所发表论文情况 | 第84-85页 |
致谢 | 第85页 |