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干旱胁迫下玉米microRNA的差异表达

摘要第1-7页
Abstract第7-13页
文献综述第13-30页
 1 microRNA概述第13-16页
   ·microRNA的发现及研究第13-14页
   ·miRNA与siRNA的异同第14-16页
 2 microRNA的结构特征第16页
 3 microRNA的生物合成机制第16-18页
   ·动物microRNA的生物合成机制第16-17页
   ·植物microRNA的生物合成机制第17-18页
 4 microRNA的作用机理第18-19页
 5 microRNA表达检测技术第19-22页
   ·基于表面杂交的表达检测技术第19-21页
     ·Northern blotting第19-20页
     ·基因芯片第20页
     ·原位杂交第20-21页
   ·基于扩增技术的表达检测技术第21-22页
     ·滚环复制第21-22页
     ·实时定量PCR第22页
 6 植物microRNA与干旱胁迫响应第22页
 7 microRNA及其靶基因的预测方法第22-28页
   ·microRNA基因预测第23-24页
     ·同源片段搜索法第23页
     ·比较基因组搜索法第23-24页
     ·靶标序列反向搜索法第24页
     ·机器学习方法第24页
   ·microRNA靶基因预测第24-28页
     ·MiRanda第25页
     ·TargetScan(S)第25页
     ·DIANA-microT第25-26页
     ·RNAhybrid第26页
     ·PicTar第26-27页
     ·RNA22第27页
     ·WMD3第27-28页
 8 本研究的目的及意义第28-29页
 9 技术路线第29-30页
试验部分第30-77页
 1 材料和方法第30-41页
   ·耐旱性不同的玉米自交系模拟干旱处理第30页
   ·总RNA提取第30-32页
     ·除RNase处理第30页
     ·总RNA提取第30-32页
     ·RNA的检测与鉴定第32页
   ·microRNA芯片杂交第32-34页
     ·芯片制备第32-33页
     ·Poly(A)末端加尾第33页
     ·杂交反应第33页
     ·数据处理和分析第33-34页
   ·差异表达microRNA的靶基因预测第34页
   ·差异表达microRNA靶基因的数字化表达谱分析第34-37页
   ·LNA-Northern Blotting检测验证第37-41页
     ·RNA的提取和分离第37-39页
     ·SDS-PAGE电泳第39页
     ·转膜第39-40页
     ·固定第40页
     ·预杂交第40页
     ·探针变性第40页
     ·杂交第40页
     ·洗膜第40页
     ·显影第40-41页
     ·脱探针第41页
 2 结果与分析第41-70页
   ·RNA完整性及质量分析第41页
   ·干旱胁迫下4个玉米自交系中差异表达的microRNA第41-63页
     ·自交系“81565”中干旱胁迫差异表达microRNA第45-48页
     ·自交系“87-1”中干旱胁迫差异表达microRNA第48-52页
     ·自交系“21ES”中干旱胁迫差异表达microRNA第52-58页
     ·自交系“丹340”中干旱胁迫差异表达microRNA第58-61页
     ·干旱胁迫响应microRNA家族的差异表达谱第61-63页
   ·干旱胁迫响应microRNA的预测靶基因第63-68页
   ·差异表达microRNA靶基因的数字化表达谱第68-69页
   ·miR159和miR168差异表达的LNA-Northern Blotting检测验证第69-70页
 3 讨论第70-77页
   ·不同自交系microRNA表达对干旱胁迫响应不同第70-71页
   ·差异表达microRNA靶基因在干旱胁迫下的潜在作用第71-75页
     ·miR159和miR168与玉米的抗旱应答密切相关第71-72页
     ·miR164靶基因在干旱胁迫下的潜在作用第72-74页
     ·miR165和miR166靶基因在干旱胁迫下的潜在作用第74页
     ·其他microRNA靶基因在干旱胁迫下的潜在作用第74-75页
   ·关于microRNA对其靶基因调控第75-77页
参考文献第77-89页
攻读学位论文期间发表论文第89-90页
致谢第90页

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