| 致谢 | 第1-11页 |
| 摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-16页 |
| 第一章 海参消化道再生研究进展 | 第16-28页 |
| ·海参消化道的组织学特征 | 第16-17页 |
| ·海参消化道再生的组织细胞学研究进展 | 第17-22页 |
| ·海参吐脏 | 第17-18页 |
| ·海参消化道再生的基本模式 | 第18-19页 |
| ·肠系膜为消化道再生的中心 | 第19页 |
| ·再生组织细胞的起源 | 第19-21页 |
| ·细胞分裂与细胞死亡对再生的作用 | 第21-22页 |
| ·海参消化道再生的分子机制研究进展 | 第22-25页 |
| ·原基形成相关基因 | 第23页 |
| ·肌细胞生成相关基因 | 第23-24页 |
| ·再生中的癌症相关基因 | 第24-25页 |
| ·本研究的目的、意义及研究思路 | 第25-27页 |
| ·研究的目的与意义 | 第25页 |
| ·研究思路 | 第25-26页 |
| ·预期成果 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第二章 仿刺参消化道再生的组织学和细胞学特征 | 第28-48页 |
| ·前言 | 第28-29页 |
| ·材料与方法 | 第29-31页 |
| ·样品的采集 | 第29页 |
| ·组织学观察 | 第29-30页 |
| ·免疫组化双标记 | 第30页 |
| ·透射电镜观察 | 第30页 |
| ·数据分析 | 第30-31页 |
| ·实验结果 | 第31-43页 |
| ·仿刺参消化道再生的形态学观察 | 第31-33页 |
| ·仿刺参消化道再生的组织结构变化 | 第33-38页 |
| ·仿刺参消化道再生的细胞增殖 | 第38-41页 |
| ·仿刺参消化道再生的超微结构 | 第41-43页 |
| ·讨论 | 第43-46页 |
| ·仿刺参消化道再生模式 | 第43页 |
| ·消化道原基的形成 | 第43-44页 |
| ·细胞增殖与组织层分化 | 第44-45页 |
| ·再生机制 | 第45-46页 |
| ·本章小结 | 第46-48页 |
| 第三章 仿刺参再生转录组的构建 | 第48-66页 |
| ·前言 | 第48-49页 |
| ·材料与方法 | 第49-54页 |
| ·样品的采集 | 第49页 |
| ·RNA 提取与 cDNA 文库构建 | 第49-51页 |
| ·454 高通量测序 | 第51页 |
| ·454 高通量数据分析 | 第51页 |
| ·Real-time PCR 验证差异表达基因 | 第51-54页 |
| ·实验结果 | 第54-63页 |
| ·454 测序、拼接与统计分析 | 第54-56页 |
| ·GO 功能分类注释与 pathway 分析 | 第56-58页 |
| ·差异表达基因分析 | 第58-61页 |
| ·Real time PCR 验证 | 第61-63页 |
| ·讨论 | 第63-65页 |
| ·发育类基因 | 第64页 |
| ·细胞外基质基因 | 第64-65页 |
| ·细胞骨架基因 | 第65页 |
| ·本章小结 | 第65-66页 |
| 第四章 仿刺参消化道再生表达谱的构建 | 第66-92页 |
| ·前言 | 第66-67页 |
| ·材料与方法 | 第67-70页 |
| ·样品的采集 | 第67页 |
| ·RNA 提取与 cDNA 文库构建 | 第67-68页 |
| ·序列注释、测序评估与基因表达量计算 | 第68页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第68页 |
| ·GO (Gene ontology)和通路（Pathway）富集分析 | 第68页 |
| ·Real-time PCR 验证 | 第68-70页 |
| ·实验结果 | 第70-86页 |
| ·RNA-Seq 测序结果统计 | 第70-72页 |
| ·测序饱和度分析 | 第72页 |
| ·差异表达基因（Differentially expressed genes， DEGs） | 第72-76页 |
| ·仿刺参消化道再生表达谱的 Real-time PCR 验证 | 第76-79页 |
| ·差异表达基因的 GO 功能富集分析 | 第79-82页 |
| ·差异表达基因的 Pathway 富集分析 | 第82-83页 |
| ·个别基因的表达模式 | 第83-86页 |
| ·讨论 | 第86-89页 |
| ·DGEs 的 GO 功能分析 | 第87页 |
| ·再生相关的通路 | 第87-88页 |
| ·三类重要再生相关基因 | 第88-89页 |
| ·本章小结 | 第89-92页 |
| 第五章 仿刺参 wnt6 及 Hox6 的克隆与表达分析 | 第92-108页 |
| ·前言 | 第92-93页 |
| ·材料与方法 | 第93-96页 |
| ·样品的采集 | 第93页 |
| ·RNA 提取和 cDNA 全长克隆 | 第93-95页 |
| ·序列的生物信息学分析 | 第95页 |
| ·Real-time PCR 基因表达与定量 | 第95-96页 |
| ·数据分析 | 第96页 |
| ·实验结果 | 第96-105页 |
| ·仿刺参 Wnt6 全长 cDNA 克隆及序列分析 | 第96-98页 |
| ·仿刺参 Wnt6 序列同源性与进化分析 | 第98-100页 |
| ·仿刺参 AjHBOX6(Hox6) 全长 cDNA 克隆及序列分析 | 第100-102页 |
| ·仿刺参 AjHBOX6 序列同源性与进化分析 | 第102-104页 |
| ·消化道再生过程中 Wnt6 和 AjHBOX6 (Hox6) mRNA 的表达分析 | 第104-105页 |
| ·讨论 | 第105-107页 |
| ·本章小结 | 第107-108页 |
| 第六章 仿刺参 RAP 与 HMG 基因的克隆与表达分析 | 第108-118页 |
| ·前言 | 第108页 |
| ·材料与方法 | 第108-110页 |
| ·样品的采集 | 第108-109页 |
| ·RNA 提取和 cDNA 全长克隆 | 第109页 |
| ·序列的生物信息学分析 | 第109页 |
| ·Real-time PCR 基因表达与定量 | 第109-110页 |
| ·数据分析 | 第110页 |
| ·实验结果 | 第110-116页 |
| ·仿刺参 Regeneration associated protein(RAP) 全长 cDNA 克隆及序列、同源性分析 | 第110-112页 |
| ·仿刺参 High-mobility group box protein（HMG）全长 cDNA克隆及序列分析 | 第112页 |
| ·仿刺参 HMG 同源性分析与进化分析 | 第112-115页 |
| ·消化道再生过程中 RAP 和 HMG mRNA 的表达分析 | 第115-116页 |
| ·讨论 | 第116-117页 |
| ·本章小结 | 第117-118页 |
| 第七章 总结与展望 | 第118-120页 |
| ·总结 | 第118-119页 |
| ·创新性 | 第119页 |
| ·存在问题 | 第119页 |
| ·研究展望 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-131页 |
| 作者简介 | 第131-132页 |
| 攻读学位期间撰写与发表的学术论文 | 第132页 |
