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玉米柱头全基因组表达谱分析及花粉—柱头互作相关基因的鉴定

中文摘要第1-11页
Abstract第11-13页
1 前言第13-39页
   ·植物花粉与雌蕊相互作用的研究进展第13-26页
     ·花粉的黏附第15-16页
     ·花粉的水合第16-18页
     ·花粉在柱头表面萌发并进入柱头组织第18-20页
     ·花粉管在柱头和花柱中进行极性生长并到达胚珠第20-22页
     ·玉米花粉与柱头组织的相互作用第22-26页
       ·玉米花粉在柱头上的黏附、水合和萌发第22-24页
       ·玉米花粉管在柱头中的极性生长第24-26页
   ·植物花粉和柱头的转录组学研究进展第26-37页
     ·基因芯片技术第27-29页
     ·转录组测序技术第29-33页
     ·花粉转录组学第33-35页
     ·柱头/花柱的转录组学第35-37页
   ·本研究的目的和意义第37-39页
2 实验材料与方法第39-47页
   ·植物材料的培养及收集方法第39-40页
   ·实验方法第40-41页
     ·RNA 的提取和纯化第40-41页
   ·测序文库的构建和 Illumina 测序第41-42页
     ·测序文库的构建第41页
     ·Illumina 测序第41页
     ·样品间皮尔逊相关系数分析第41-42页
   ·基因芯片样品的制备、杂交和数据分析第42页
   ·实时定量 PCR 分析第42-45页
   ·RNA-seq 数据与基因芯片数据之间的比较分析第45-46页
   ·GO 分析第46页
   ·基因注释、分类和亚细胞定位预测第46页
   ·玉米柱头特异/优势表达基因及授粉前后柱头差异表达基因中编码富含半胱氨酸蛋白基因的预测第46-47页
3 结果与分析第47-78页
   ·玉米成熟柱头中特异表达和优势表达基因的鉴定和分析第47-64页
     ·玉米成熟柱头、成熟花粉、成熟子房和幼苗的 Illumina 测序分析第47-49页
     ·玉米成熟花粉、成熟柱头、成熟子房和幼苗中基因表达分析第49-50页
     ·Illumina 测序分析结果的验证第50-53页
     ·玉米成熟柱头中特异表达和优势表达基因的鉴定第53页
     ·玉米成熟柱头中特异表达和优势表达基因的分析第53-60页
       ·玉米成熟柱头中特异表达和优势表达基因的功能分类第53-56页
       ·玉米成熟柱头中特异表达和优势表达基因的生物信息学分析第56-60页
         ·GO 分析第56-58页
         ·编码富含半胱氨酸蛋白的基因在玉米成熟柱头特异和优势表达基因中的分布第58-60页
     ·玉米、水稻和拟南芥柱头特异和优势表达基因的比较第60-64页
       ·玉米、水稻、拟南芥特异和优势表达基因中保守基因的鉴定第61-62页
       ·玉米和水稻柱头特异和优势表达基因之间的同源性比较第62-63页
       ·玉米柱头特异基因的分析第63-64页
   ·授粉前后玉米柱头差异表达基因的鉴定第64-78页
     ·授粉前后玉米柱头的 Illumina 测序结果第64-66页
     ·授粉前后玉米柱头基因表达谱的比较第66-67页
     ·授粉前后玉米柱头差异表达基因的鉴定第67页
     ·玉米和拟南芥柱头授粉前后差异基因的比较第67-68页
     ·实时定量 PCR 对授粉前后玉米柱头差异表达基因表达模式的验证第68-69页
     ·授粉诱导表达基因的分析第69-71页
     ·授粉前后玉米柱头差异表达基因的聚类和 GO 分析第71-72页
       ·授粉前后玉米柱头差异表达基因的聚类分析第71-72页
       ·授粉前后玉米柱头差异表达基因的 GO 分析第72页
     ·幼嫩柱头中与细胞分裂和分化相关基因的表达分析第72-73页
     ·微管在柱头发育及授粉识别过程中功能分析第73页
     ·引导组织中泛素化介导的蛋白质降解在玉米花粉-柱头互作过程中的作用分析第73-74页
     ·编码转运蛋白的基因在授粉过程中的作用分析第74-75页
     ·富含半胱氨酸蛋白在玉米柱头授粉前后差异表达基因中的分布第75-78页
4 讨论第78-88页
   ·玉米柱头转录组学与其它物种柱头转录组学的关系第78页
   ·LRR 类受体激酶可能介导了玉米花粉和柱头的互作第78-80页
   ·转运相关基因可能在玉米花粉-柱头互作过程中发挥重要作用第80-82页
   ·蛋白质的泛素化可能与亲和反应中柱头对花粉选择机制有关第82-86页
   ·富含半胱氨酸的蛋白在玉米花粉-柱头互作过程中可能具有重要作用第86-87页
   ·玉米花粉-柱头互作的工作模型第87-88页
5 结论第88-89页
参考文献第89-105页
致谢第105-106页
攻读学位期间发表论文情况第106页

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