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酿酒酵母耐乙醇特性的分析及代谢工程改造研究

摘要第1-16页
ABSTRACT第16-20页
缩略词表第20-22页
第一章 绪论第22-45页
   ·酿酒酵母介绍第22-23页
     ·酿酒酵母作为模式生物的作用第22-23页
     ·酿酒酵母在乙醇发酵的应用第23页
   ·乙醇压力对细胞的效应第23-28页
     ·乙醇对酵母的影响第23-25页
     ·压力响应的过程机制第25-28页
       ·压力响应信号传导第25-26页
       ·压力响应基因表达变化第26-27页
       ·压力适应第27-28页
   ·酵母细胞转录调控机制第28-34页
     ·转录前的准备——染色质的重建第29页
     ·转录调节第29-34页
       ·顺式作用元件第30-32页
       ·通用转录因子第32-33页
       ·转录调节因子第33-34页
     ·其他调节第34页
   ·高通量差异基因表达研究方法第34-38页
     ·差异基因表达谱分析第35-38页
       ·cDNA微阵列技术第35-37页
       ·基因表达系列分析(SAGE)第37-38页
     ·蛋白组学分析第38页
   ·代谢工程改造方法介绍第38-42页
     ·理性代谢工程第38-39页
     ·反向代谢工程第39页
     ·随机改造工程第39-40页
     ·全转录工程机制第40-42页
       ·SPT15及编码蛋白TBP介绍第41-42页
   ·本论文的工作内容第42-45页
第二章 gTME在酿酒酵母W303-1A中的应用研究第45-64页
   ·实验原理第45-46页
   ·实验材料与方法第46-56页
     ·实验材料第46-47页
       ·菌株和质粒第46页
       ·培养基第46-47页
     ·分子生物学常用工具酶第47页
     ·常用试剂盒第47页
     ·主要试剂第47-48页
     ·聚合酶链式反应(PCR)用试剂第48页
     ·仪器和设备第48-49页
     ·分子生物学常用溶液及缓冲液配制第49-51页
       ·琼脂糖凝胶电泳所用试剂第49页
       ·SDS碱裂解法质粒提取试剂第49-50页
       ·酵母基因组快速提取试剂第50-51页
       ·酿酒酵母电转化试剂第51页
     ·实验方法第51-56页
       ·菌种保存方法第51页
       ·细胞活化第51-52页
       ·分子生物学常规操作第52页
       ·大肠杆菌质粒的快速提取第52页
       ·酵母基因组的快速提取第52页
       ·PCR引物设计第52-53页
       ·PCR反应体系第53-54页
       ·PCR反应程序第54页
       ·双酶切反应体系第54页
       ·目的基因和载体连接反应第54-55页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第55页
       ·连接产物的大肠杆菌转化第55页
       ·阳性克隆的筛选与测序第55页
       ·酵母感受态细胞的制备第55-56页
       ·酵母细胞的电转化方法第56页
     ·细胞生长表型分析第56页
   ·实验结果第56-60页
     ·模板的准备——酿酒酵母W303-1A基因组与质粒pUG6的提取第56-57页
     ·点突变等位基因SPT15-300第57-59页
     ·重组质粒pRS41K-SPT15和pRS41K-SPT15-300的构建第59-60页
     ·生长表型比较第60页
   ·讨论第60-63页
   ·本章小结第63-64页
第三章 酿酒酵母W303-1A耐乙醇的定向驯化第64-89页
   ·实验流程第65-66页
   ·实验材料与方法第66-70页
     ·菌株和培养基第66页
     ·实验方法第66-67页
       ·细胞活化第66页
       ·定向驯化第66-67页
       ·细胞生长比较第67页
       ·细胞耐受醇击和热击能力比较第67页
     ·表达谱分析第67-70页
       ·细胞制备第67-68页
       ·RNA的提取及样品制备第68页
       ·数据分析第68-70页
   ·实验结果第70-84页
     ·定向驯化实验第70-71页
     ·驯化前后菌体生长比较第71-73页
     ·驯化前后细胞的耐醇和热击能力比较第73-74页
     ·表达谱分析第74-84页
       ·差异表达基因的聚类分析和PCA分析第74-76页
       ·差异基因比较分析第76-84页
   ·讨论第84-87页
   ·本章小结第87-89页
第四章 gTME改造啤酒酵母Qd001的分子构建及表型分析研究第89-106页
   ·实第89-91页
   ·实验流程第91-92页
   ·实验材料第92-93页
     ·菌株和质粒第92页
     ·培养基第92-93页
   ·实验方法第93-98页
     ·目的基因的扩增第93-95页
       ·引物设计(表4-1)第93-94页
       ·PCR反应体系第94-95页
       ·PCR反应程序第95页
     ·单酶切验证反应第95页
     ·目的基因和T载体连接反应第95-96页
     ·酿酒酵母的电转化第96页
     ·二倍体啤酒酵母Qd001的分子改造第96-97页
       ·Qd001基因组上一个SPT15拷贝的敲除第96页
       ·质粒pSH47/hphB的构建及电转化第96-97页
       ·CRE重组酶的诱导及KanMX基因丢失第97页
       ·质粒pSH47/hphB丢失第97页
     ·SPT15-300重组菌的构建第97-98页
       ·SPT15-300的基因组整合第97页
       ·质粒pSH47/hphB的电转化第97页
       ·CRE酶的诱导第97页
       ·质粒丢失第97-98页
     ·细胞表型生长比较第98页
   ·结果与讨论第98-105页
     ·酿酒酵母基因组上SPT15单拷贝敲除第98-102页
       ·KanMX敲除元件的获得第98-99页
       ·LFH-PCR敲除元件的电转化第99-100页
       ·质粒pSH47/hphB的构建及电转化第100页
       ·CRE重组酶的诱导及KanMX基因丢失第100-102页
       ·质粒pSH47/hphB的丢失第102页
     ·SPT15-300重组菌的构建第102-104页
       ·点突变等位基因SPT15-300第102-103页
       ·LFH-PCR SPT15-300-KanMX基因组整合元件的获得第103-104页
       ·LFH-PCR电转化及重组菌构建第104页
     ·细胞表型检测第104-105页
   ·本章小结第105-106页
第五章 啤酒酵母SPT15-300突变株的发酵研究第106-120页
   ·实验材料第106-107页
     ·实验菌株第106页
     ·培养基第106-107页
   ·实验方法第107-109页
     ·细胞生长曲线第107页
     ·短期定向驯化第107-108页
     ·细胞表型生长比较第108页
     ·发酵实验第108页
       ·以葡萄糖为底物的发酵第108页
       ·以麦芽糖葡萄糖混合糖为底物共发酵第108页
     ·高效液相色谱法(HPLC)测定残糖和产物乙醇第108-109页
   ·结果与讨论第109-118页
     ·细胞生长曲线测定第109-110页
     ·SPT15-300与SPT15的葡萄糖发酵第110-114页
       ·中密度葡萄糖发酵第110-112页
       ·高密度葡萄糖发酵第112-114页
     ·模拟啤酒发酵过程麦芽糖和葡萄糖混合低温发酵第114-115页
     ·短期驯化株的表型比较第115-116页
     ·SPT15-300与QA在30%葡萄糖发酵比较第116-118页
   ·讨论第118页
   ·本章小结第118-120页
全文总结第120-122页
参考文献第122-128页
致谢第128-130页
攻读学位期间发表的学术论文第130-131页
附录第131-155页
学位论文评阅及答辩情况表第155页

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