| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-9页 |
| 引 言 | 第9-11页 |
| 第一章 鱼类遗传多样性和种群分子遗传学的最新进展 | 第11-47页 |
| 1．1 鱼类遗传多样性研究的重要性及其内涵 | 第11-17页 |
| 1．1．1 形态学变异 | 第13页 |
| 1．1．2 细胞水平—染色体多态性 | 第13-15页 |
| 1．1．3 蛋白质水平 | 第15页 |
| 1．1．4 DNA水平 | 第15-17页 |
| 1．2 分子遗传标记的内容和现状 | 第17-42页 |
| 1．2．1 同工酶（Isozyme） | 第17-22页 |
| 1．2．2 线粒体DNA（mtDNA）的多态性 | 第22-29页 |
| 1．2．3 随机扩增多态性DNA（Random Amplified Polymorphic DNA，RAPD） | 第29-32页 |
| 1．2．4 DNA重复数可变串联重复标记（Variable Number of Tanderm Repeat loci，VNTRs） | 第32-35页 |
| 1．2．5 限制性片段长度多态性（RFLP） | 第35-36页 |
| 1．2．6 特异引物的PCR标记 | 第36-37页 |
| 1．2．7 扩增片段长度多态性技术（AFLP）的应用 | 第37-38页 |
| 1．2．8 SNP标记 | 第38-42页 |
| 1．3 分子标记在渔业中的应用及前景展望 | 第42-47页 |
| 1．3．1 分子遗传信息在海水渔业研究和管理中的应用 | 第42-43页 |
| 1．3．2 加强种质资源调查研究、辅助选育优质抗逆新品种 | 第43-44页 |
| 1．3．3 种群和群体的准确鉴别与渔业资源有序和可持续利用 | 第44-45页 |
| 1．3．4 在保护生物学中的应用 | 第45-47页 |
| 第二章 山东近海牙鲆野生和养殖群体同工酶及其遗传多样性研究 | 第47-71页 |
| 2．1 材料与方法 | 第47-51页 |
| 2．1．1 实验材料 | 第47-48页 |
| 2．1．2 实验方法 | 第48-50页 |
| 2．1．3 遗传变异数据的统计分析 | 第50-51页 |
| 2．2 结果 | 第51-66页 |
| 2．2．1 4种缓冲系统对25种同工酶筛选 | 第51-52页 |
| 2．2．2 牙鲆同工酶的组织表达特异性 | 第52-53页 |
| 2．2．3 牙鲆同工酶基本酶谱及其生化遗传分析 | 第53-62页 |
| 2．2．4 群体内的遗传变异 | 第62-65页 |
| 2．2．5 群体间的遗传变异 | 第65-66页 |
| 2．3 讨论 | 第66-71页 |
| 2．3．1 关于牙鲆LDH的表达 | 第66页 |
| 2．3．2 山东近海牙鲆自然与养殖群体遗传结构及其遗传变异的比较 | 第66-68页 |
| 2．3．3 中日牙鲆野生群体生化遗传变异的比较 | 第68-69页 |
| 2．3．4 酶蛋白的活性与样品的保存 | 第69页 |
| 2．3．5 筛选有效的遗传标记 | 第69-71页 |
| 第三章： 山东近海牙鲆野生和养殖群体的RAPD分析 | 第71-90页 |
| 3．1 材料与方法 | 第71-73页 |
| 3．1．1 实验材料 | 第71页 |
| 3．1．2 基因组DNA的提取与浓度测定 | 第71页 |
| 3．1．3 PCR | 第71-73页 |
| 3．1．4 数据统计与分析 | 第73页 |
| 3．2 实验结果 | 第73-80页 |
| 3．2．1 牙鲆基因组DNA | 第73-74页 |
| 3．2．2 PCR参数的优化结果 | 第74-76页 |
| 3．2．3 引物的筛选 | 第76-78页 |
| 3．2．4 RAPD结果 | 第78-80页 |
| 3．3 讨论 | 第80-90页 |
| 3．3．1 野生和养殖牙鲆RAPD遗传变异的比较 | 第80页 |
| 3．3．2 RAPD反应参数的优化和反应条件对实验结果的影响 | 第80-82页 |
| 3．3．3 RAPD是群体遗传分析的实用标记 | 第82页 |
| 3．3．4 牙鲆同工酶与RAPD标记群体遗传变异分析结果的比较 | 第82-85页 |
| 3．3．5 养殖群体对天然群体的影响及其种质资源的保护 | 第85-90页 |
| 第四章 4种鲽形目鱼类MTDNA 16S RDNA序列分析及鲽形目鱼类分子系统学初步研究 | 第90-121页 |
| 4．1 实验材料和方法 | 第91-98页 |
| 4．1．1 实验材料 | 第91页 |
| 4．1．2 研究方法 | 第91-98页 |
| 4．2 实验结果 | 第98-114页 |
| 4．2．1 4种鱼类的全DNA | 第98-99页 |
| 4．2．2 4种鱼类mtDNA 16S DNA目的片段的获得 | 第99-100页 |
| 4．2．3 白斑菌落所提质粒的PCR检测结果 | 第100页 |
| 4．2．4 目的片段的测序结果 | 第100-105页 |
| 4．2．5 4种鲽形目鱼类16S rRNA基因的变异 | 第105-110页 |
| 4．2．6 鲽形目鱼类的分子系统分析 | 第110-114页 |
| 4．3 讨论 | 第114-121页 |
| 4．3．1 引物的筛选及扩增片段同源性的确定 | 第114页 |
| 4．3．2 鲽形目鱼类的DNA水平上的遗传分化 | 第114-115页 |
| 4．3．3 鲽形目的系统树 | 第115-119页 |
| 4．3．4 mtDNA各区的特点及应用 | 第119-120页 |
| 4．3．5 生物信息学在分子系统学研究中的关键作用 | 第120-121页 |
| 结 论 | 第121-123页 |
| 参 考 文 献 | 第123-143页 |
| 发表完成文章目录 | 第143-145页 |
| 致 谢 | 第145-146页 |
