| 英文缩写中英文全称对照表 | 第1-7页 |
| 中文摘要 | 第7-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 第一部分 引言 | 第12-22页 |
| 一 创新药物研发面临的困境 | 第12-14页 |
| 二 创新药物研发在上市前终止的原因分析 | 第14-15页 |
| 三 基于化学基因组学的药物研发 | 第15-20页 |
| 四 讨论 | 第20-22页 |
| 第二部分 化学基因组学数据库的建立 | 第22-37页 |
| 第一节 本实验室的实验数据 | 第22-31页 |
| 一、实验方法 | 第22-28页 |
| 二、实验结果 | 第28-31页 |
| 第二节 网络公共数据库中的数据 | 第31-35页 |
| 一、数据收集和整理 | 第31-33页 |
| 二、数据整理结果 | 第33-35页 |
| 第三节 讨论 | 第35-37页 |
| 第三部分 用于化学基因组学分析的方法学比较 | 第37-66页 |
| 第一节 化学基因组学分析方法的选择 | 第37-40页 |
| 一、分析算法 | 第37-38页 |
| 二 数据准备和化合物生物特征的标志基因(signature)的选择 | 第38页 |
| 三、讨论 | 第38-40页 |
| 第二节 用PPAR激动剂化学结构相关活性评估进行方法比较 | 第40-52页 |
| 一、PPAR激动剂化学结构相关Signature选择 | 第40-47页 |
| 二、不同方法学的评估结果科学性比较 | 第47页 |
| 三、不同方法学的评估结果稳定性比较 | 第47-50页 |
| 四、讨论 | 第50-52页 |
| 第三节 用PPAR激动剂的功能相关活性评估进行方法比较 | 第52-62页 |
| 一、PPAR激动剂糖脂代谢相关Signature选择 | 第52-57页 |
| 二、不同方法学的评估结果科学性比较 | 第57页 |
| 三、不同方法学的评估结果稳定性比较 | 第57页 |
| 四、讨论 | 第57-62页 |
| 第四节 用PPAR激动剂靶点相关活性评估进行方法比较 | 第62-66页 |
| 一、PPAR靶点相关Signature选择 | 第62-64页 |
| 二、不同方法学的评估结果科学性比较 | 第64-65页 |
| 三、讨论 | 第65-66页 |
| 第四部分 化学基因组学用于新合成PPAR激动剂的评估 | 第66-78页 |
| 第一节 化合物的PPARα活性评估 | 第66-70页 |
| 一、PPARα活性相关Signature基因的选择 | 第66-67页 |
| 二、新合成化合物的PPARα活性评估 | 第67-68页 |
| 三、讨论 | 第68-70页 |
| 第二节 化合物的PPARγ活性评估 | 第70-74页 |
| 一、PPARγ活性相关Signature基因的选择 | 第70-71页 |
| 二、新合成化合物的PPARγ活性评估 | 第71-72页 |
| 三、讨论 | 第72-74页 |
| 第三节 化合物的双或全亚型PPAR活性评估 | 第74-78页 |
| 一、PPAR双或全亚型活性相关Signature基因的选择 | 第74-75页 |
| 二、新合成化合物的PPAR双或全亚型活性评估 | 第75-76页 |
| 三、讨论 | 第76-78页 |
| 第五部分 化学基因组学用于新合成HDAC抑制剂的评估 | 第78-82页 |
| 一、HDAC抑制活性相关Signature基因的选择 | 第78-79页 |
| 二、新合成化合物C555的HDAC抑制活性评估 | 第79-80页 |
| 三、讨论 | 第80-82页 |
| 全文结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-94页 |
| 致谢 | 第94-95页 |
| 附录 | 第95-101页 |
| 博士期间文章列表 | 第101页 |
