家蚕基因组数据库的构建及应用
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-31页 |
| ·概述 | 第17页 |
| ·模式生物基因组测序 | 第17-21页 |
| ·人类基因组计划的提出与实施 | 第17-19页 |
| ·昆虫基因组测序进展 | 第19-21页 |
| ·功能基因组学研究 | 第21-24页 |
| ·高通量的基因功能注释方法 | 第21-23页 |
| ·高通量的基因表达研究方法 | 第23-24页 |
| ·C2H2型锌指蛋白研究 | 第24-27页 |
| ·C2H2型锌指蛋白结构和功能 | 第25-27页 |
| ·人工锌指蛋白 | 第27页 |
| ·家蚕基因组及功能基因组研究进展 | 第27-31页 |
| ·家蚕的基因组测序进展 | 第27-28页 |
| ·高通量的家蚕基因表达研究 | 第28-30页 |
| ·家蚕相关数据库资源 | 第30-31页 |
| 第二章 引言 | 第31-33页 |
| ·家蚕功能基因组研究对蚕业科学发展的作用 | 第31页 |
| ·家蚕功能基因组研究对农林业害虫防治的意义 | 第31页 |
| ·主要研究内容 | 第31-32页 |
| ·研究思路与技术路线 | 第32-33页 |
| 第三章 家蚕基因功能注释 | 第33-51页 |
| ·材料和方法 | 第33-35页 |
| ·序列来源 | 第33页 |
| ·序列比对 | 第33页 |
| ·蛋白质结构域预测 | 第33-34页 |
| ·基于直系同源数据库的基因功能预测 | 第34-35页 |
| ·结果与分析 | 第35-47页 |
| ·基于序列相似性的基因功能预测 | 第35-39页 |
| ·基于蛋白质结构域的基因功能预测 | 第39-44页 |
| ·基于直系同源数据库的家蚕基因功能预测 | 第44-47页 |
| ·讨论 | 第47-51页 |
| 第四章 家蚕基因芯片数据分析和数据库构建 | 第51-67页 |
| ·材料和方法 | 第51-55页 |
| ·基因芯片数据来源 | 第51页 |
| ·基因芯片数据的特征及数据量 | 第51-53页 |
| ·芯片数据处理及分析 | 第53-54页 |
| ·芯片数据处理 | 第53页 |
| ·芯片数据分析 | 第53-54页 |
| ·芯片数据库构建 | 第54-55页 |
| ·结果与分析 | 第55-65页 |
| ·家蚕不同组织中表达基因的鉴定 | 第55-56页 |
| ·家蚕中的组织特异表达基因分析 | 第56-60页 |
| ·组织间共表达基因鉴定 | 第60-61页 |
| ·芯片数据可靠性检验 | 第61-64页 |
| ·家蚕芯片数据库BmMDB的构建 | 第64-65页 |
| ·讨论 | 第65-67页 |
| 第五章 家蚕基因组数据库构建 | 第67-89页 |
| ·材料和方法 | 第67-74页 |
| ·硬件平台 | 第67页 |
| ·Linux集群系统构建 | 第67-70页 |
| ·网络服务器及数据库管理系统 | 第70-71页 |
| ·家蚕基因组数据库构建 | 第71-74页 |
| ·结果 | 第74-86页 |
| ·家蚕基因组及相关数据资源整理 | 第74-77页 |
| ·家蚕基因组数据库的浏览与检索 | 第77-81页 |
| ·家蚕基因组数据库中的基因页面 | 第81-86页 |
| ·家蚕生物信息分析平台 | 第86页 |
| ·讨论 | 第86-89页 |
| 第六章 家蚕C2H2型锌指蛋白的鉴定 | 第89-105页 |
| ·材料和方法 | 第89-91页 |
| ·基因数据集 | 第89页 |
| ·C2H2型锌指蛋白的鉴定 | 第89-90页 |
| ·C2H2型锌指蛋白的基因家族分析 | 第90页 |
| ·进化分析 | 第90-91页 |
| ·基因表达分析 | 第91页 |
| ·结果与分析 | 第91-102页 |
| ·家蚕C2H2型锌指蛋白的鉴定 | 第91-92页 |
| ·锌指偶联结构域分析 | 第92-95页 |
| ·家蚕C2H2型锌指蛋白基因的染色体分布 | 第95-96页 |
| ·家蚕C2H2型锌指蛋白的基因家族分析 | 第96-100页 |
| ·家蚕C2H2型锌指蛋白基因的表达谱分析 | 第100-102页 |
| ·讨论 | 第102-105页 |
| 第七章 综合与结论 | 第105-109页 |
| ·家蚕基因功能注释 | 第105页 |
| ·家蚕基因芯片数据分析和数据库构建 | 第105页 |
| ·家蚕基因组数据库构建 | 第105-106页 |
| ·家蚕C2H2型锌指蛋白的鉴定 | 第106-109页 |
| 参考文献 | 第109-117页 |
| 附录 | 第117-123页 |
| 博士在读期间发表文章和参研课题情况 | 第123-125页 |
| 致谢 | 第125页 |
