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猪PNLIPRP2基因的克隆、原核表达、启动子调控及其与生产性状的关联分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
资源家系测定性状的英文缩写第12-13页
第一章 文献综述第13-22页
 1.前言第13页
 2.影响脂肪代谢的重要候选基因第13-15页
 3.拟分离基因的研究现状第15-17页
   ·胰脂肪酶基因家族概述第15-16页
   ·PNLIPRP2基因的研究现状第16页
   ·PNLIPRP2基因与脂肪代谢第16-17页
 4.基于EST的新基因克隆策略第17-18页
   ·EST的概念及技术原理第17页
   ·基因的电子克隆第17-18页
 5.单核苷酸多态概述第18-19页
   ·SNPs的概念第18页
   ·猪分子育种中SNPs常用的检测方法第18-19页
 6.启动子的研究方法第19-22页
   ·启动子克隆方法第19-20页
   ·本研究采用的启动子扩增方法第20-21页
   ·启动子结构和功能的研究方法第21-22页
第二章 本研究的目的和意义第22-23页
第三章 材料与方法第23-40页
 1.试验材料第23-26页
   ·试验样品和性状测定第23页
     ·DNA样品第23页
     ·组织样品第23页
     ·性状测定第23页
   ·主要仪器和设备第23-24页
   ·载体和菌株第24-25页
   ·主要药品及试剂第25页
   ·主要试剂的配制第25-26页
 2.试验方法第26-40页
   ·猪基因组DNA的提取第26-27页
   ·基因组DNA的浓度测定和质量检测第27页
   ·猪PNLIPRP2基因cDNA序列的克隆、测序第27-30页
     ·引物设计及合成第27-28页
     ·猪个组织总RNA的提取及cDNA的制备第28-29页
     ·PCR产物的回收、纯化和克隆测序第29-30页
   ·常用的分子生物学软件第30-31页
   ·猪PNLIPRP2基因基因组序列的克隆测序第31-33页
     ·引物设计第31页
     ·PCR反应体系及条件第31-32页
     ·基因多态性扫描和遗传方式分析第32页
     ·多态性与性状的关联分析方法第32-33页
   ·猪PNLIPRP2基因组织表达谱研究第33页
     ·总RNA的提取及RNA浓度与质量的检测第33页
     ·RT-PCR扩增体系第33页
   ·猪PNLIPRP2蛋白保守结构域的原核表达第33-36页
     ·猪PNLIPRP2蛋白保守结构域原核表达载体的构建第33-35页
     ·诱导表达第35页
     ·SDS-PAGE电泳检测第35-36页
   ·猪PNLIPRP2基因启动子的研究第36-40页
     ·基因组DNA的提取第36-37页
     ·基因组步移库的构建第37-38页
     ·基因组PCR步移第38-39页
     ·步移产物的回收和克隆第39-40页
第四章 结果与分析第40-57页
 1.猪PNLIPRP2基因cDNA序列的分离与克隆测序结果第40-43页
   ·总RNA的提取与质量检测结果第40页
   ·猪PNLIPRP2基因cDNA扩增结果第40-41页
   ·猪PNLIPRP2基因cDNA序列的生物信息学分析第41-43页
 2.猪PNLIPRP2基因部分基因组序列的克隆第43-44页
 3.猪PNLIPRP2基因的SNPs研究第44-48页
   ·猪PNLIPRP2基因的SNPs检测第44-45页
   ·不同猪种中基因型频率的检测结果第45-46页
   ·猪PNLIPRP2基因Ecol30Ⅰ—RFLP基因型与性状的统计分析第46-48页
 4.猪PNLIPRP2基因的半定量组织表达谱分析第48-49页
 5.猪PNLIPRP2蛋白保守结构域的原核表达结果第49-52页
   ·猪PNLIPRP2蛋白保守结构域PLAT_PL的扩增结果第49-50页
   ·猪PNLIPRP2蛋白保守结构域原核表达载体的构建第50页
   ·重组原核表达载体的鉴定第50-51页
     ·重组子的菌液PCR鉴定结果第50页
     ·重组子的酶切鉴定结果第50-51页
     ·重组子中插入片断的测序鉴定结果第51页
   ·IPTG诱导重组原核表达载体表达PLAT_PL蛋白第51-52页
 6.猪PNLIPRP2基因启动子的克隆及生物信息学分析第52-57页
   ·基因组步移库的构建第52页
   ·猪PNLIPRP2基因启动子的获得第52-54页
   ·生物信息学预测PNLIPRP2核心启动子区及转录因子结合位点第54-57页
第五章 讨论第57-62页
 1.关于候选基因的选择第57页
 2.关于猪PNLIPRP2基因结构的分析第57-58页
 3.关于基因的组织表达谱分析第58-59页
 4.关于基因的SNPs检测及性状的关联分析第59-60页
   ·基因的SNPs检测第59页
   ·性状关联分析第59-60页
 5.关于启动子序列的克隆及分析第60-62页
   ·关于启动子序列的克隆第60页
   ·关于启动子序列的生物信息学分析第60-62页
第六章 小结第62-63页
 1.本研究获得的结果及创新点第62页
 2.下一步工作第62-63页
参考文献第63-67页
致谢第67页

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