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ABC转运蛋白超家族中致病性SNPs的研究

摘要第1-4页
Abstract第4-10页
第一章 文献综述第10-66页
   ·SNP 定义、检测方法及相关数据库第11-15页
     ·SNP 及致病性 SNP 的定义第11页
     ·SNPs 的检测方法第11-13页
     ·SNPs 数据库第13-14页
     ·SNPs 与疾病的关系第14-15页
   ·ABC 超家族转运蛋白基因多态性的研究现状第15-36页
     ·人类ABC 转运蛋白超家族第15-22页
       ·ABCA第19-20页
       ·ABCB第20页
       ·ABCC第20-21页
       ·ABCD第21页
       ·ABCE第21页
       ·ABCF第21-22页
       ·ABCG第22页
     ·ABC 蛋白家族中发生的SNPs 与疾病的相关性第22-29页
     ·ABC81/MDR1 基因多态性及其致病性的研究第29-36页
   ·致病性nsSNPs 的理论预测和研究现状第36-41页
     ·基于蛋白质三维结构的预测模型的构建第36-38页
     ·基于蛋白质序列保守性预测模型的构建第38-39页
     ·同时基于蛋白质三维结构和序列保守性模型的构建第39-41页
   ·ABC转运蛋白中致病性SNPs的研究难点和论文的设计思路第41-43页
 参考文献第43-66页
第二章 ABCB 亚家族中致病性nsSNPs 的理论研究第66-107页
   ·氨基酸残基延展态可及表面积的预测第66-81页
     ·前言第66-67页
     ·数据和方法第67-77页
       ·氨基酸理化参数数据集第68-74页
       ·建模方法第74-77页
     ·结果与讨论第77-81页
     ·结论第81页
   ·ABCB 亚家族中致病性nsSNPs 的理论预测第81-101页
     ·前言第81-83页
     ·数据和方法第83-91页
       ·转运蛋白数据集第83-84页
       ·候选参数第84-87页
       ·算法第87-90页
       ·模型评估第90-91页
     ·结果第91-95页
       ·RPLS 和LDA 模型第91-92页
       ·模型评估第92-94页
       ·ABCB 转运蛋白第94-95页
     ·讨论第95-100页
       ·参数评估第96-97页
       ·参数分析第97-100页
     ·小结第100-101页
 参考文献第101-107页
第三章 ABC 转运蛋白家族中致病性错义突变的计算分析第107-130页
   ·前言第107-111页
   ·数据和方法第111-125页
     ·数据库建立第111-112页
     ·预测参数第112-115页
     ·建模方法第115-122页
     ·模型评价指标第122-125页
   ·结果第125页
   ·讨论第125-127页
 参考文献第127-130页
第四章 致病性MDR1~(C3435T)多态性在中国汉族人群中分布的研究第130-156页
   ·前言第130页
   ·实验材料第130-134页
     ·研究样本第130-131页
     ·工具酶及主要试剂第131-132页
     ·主要仪器设备第132-133页
     ·有关试剂和溶液的配制第133-134页
   ·实验方法第134-143页
     ·基因组DNA 抽提-NaI 法快速抽提第134-135页
     ·基因组DNA 抽提-蛋白酶K 法第135-136页
     ·DNA 浓度和纯度的检测第136-137页
     ·PCR 扩增目的片段第137-138页
     ·目的片段的回收第138-139页
     ·RFLP 酶切反应第139-143页
   ·遗传学分析第143-145页
     ·基因频率和基因型频率的计算第143页
     ·MDR1 基因的Hardy-Weinberg 平衡状态的检验第143-144页
     ·不同种族之间基因型分布的差异显著性检验第144-145页
   ·结果第145-147页
   ·讨论第147-150页
 参考文献第150-156页
第五章 结论与展望第156-160页
   ·结论第156-157页
   ·创新点第157-158页
   ·后续工作建议第158页
   ·展望第158-160页
作者简介第160页
攻读博士学位期间撰写和发表的文章如下第160-162页
致谢第162页

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