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细菌人工染色体(BAC)介导的突变人α-珠蛋白基因簇转基因小鼠的研究

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-15页
前言第15-27页
 一.珠蛋白基因是研究成簇基因表达调控的良好模型第15-17页
 二.α-珠蛋白基因簇位处于开放的染色质环境第17-18页
 三.序列比对确定人α-珠蛋白基因簇的染色质结构域第18-19页
 四.α-珠蛋白基因簇上游调控元件功能仍未定论第19-21页
 五.α-珠蛋白基因簇的组织特异性及发育阶段特异性表达第21-23页
  1.α-珠蛋白基因簇的发育阶段特异性表达是自主的第21-22页
  2.α-珠蛋白基因簇的组织特异性表达可能主要由αPCE介导第22-23页
 六.BAC介导的转基因鼠是研究人α-珠蛋白基因簇表达调控的良好模型第23-24页
 七.本研究的主要内容第24-27页
材料与方法第27-56页
 一.材料第27-29页
  1.含人α-珠蛋白基因簇BAC克隆第27页
  2.菌株与质粒第27-28页
  3.实验用小鼠第28页
  4.限制性内切酶与修饰酶第28页
  5.其它主要试剂第28页
  6.放射性核素第28-29页
  7.主要仪器设备第29页
 二.实验方法第29-56页
  1.利用突变BAC介导的转基因小鼠研究人α-类珠蛋白基因表达与调控的基本路线第29页
  2.含完整人的α-珠蛋白基因簇的BAC DNA的鉴定第29-31页
   ·BAC DNA的小量制备第29-31页
   ·BAC DNA的大量制备第31页
   ·BAC DNA的末端直接测序第31页
  3.利用同源重组从含完整人α-珠蛋白基因簇的BAC DNA中分别定位删除两种序列:包含HS-33、HS-10、HS-8和HS-4高敏位点31.7kb DNA序列(αMⅡ);包含HS-40、HS-33、HS-10、HS-8和HS-4高敏位点35.4kb DNA序列(αMⅢ)第31-43页
   ·利用缺陷型λ原噬菌体介导的同源重组方法修饰BAC DNA以得到αM Ⅱ(HS-4~33删除)第32-37页
     ·技术路线第32-33页
       ·用于重组的片段(A’box-Bsi WI-kanamycin-Bsi WI-B’box)的PCR扩增与PCR产物的回收第33-34页
     ·DY380电转感受态细胞的制备第34页
     ·DY380电转感受态细胞的BAC DNA转化第34页
     ·含α-BAC DNA的DY380电转感受态细胞的制备第34-35页
     ·缺陷型λ原噬菌体介导的同源重组第35页
     ·重组体(αM ⅡR1)的鉴定第35页
     ·重组体(αM Ⅱ R1)上抗性基因的去除第35-36页
     ·限制性内切酶切割及PFGE分析鉴定αM Ⅱ BAC突变体第36页
     ·序列分析鉴定αM Ⅱ BAC突变体接头第36页
     ·Southern杂交鉴定αM Ⅱ BAC突变体第36-37页
   ·利用温度敏感型穿梭载体介导的同源重组方法修饰BAC DNA以得到αM Ⅲ(HS-4~40删除)第37-43页
     ·技术路线第37-38页
     ·穿梭载体的构建第38页
     ·突变盒序列的PCR扩增与PCR产物的回收第38-40页
     ·连接反应第40页
     ·感受态细胞制备第40页
       ·感受态细胞的转化第40-41页
     ·克隆筛选第41页
     ·pSV-RecA温度敏感型穿梭载体质粒的酶切及脱磷酸化处理第41页
     ·温度敏感型穿梭载体pSV-RecA-AB的获得第41-42页
     ·含有BAC DNA的感受态细胞的制备第42页
     ·感受态细胞的转化及重组体的正-筛选第42页
     ·镰孢菌酸(FA)负筛选确定突变BAC克隆第42页
     ·酶切及PFGE分析鉴定αM Ⅲ BAC突变体第42页
     ·连接处序列测定分析鉴定αM Ⅲ BAC突变体第42-43页
     ·Southern杂交鉴定αM Ⅲ BAC突变体第43页
  4.显微注射用BAC DNA的制备与纯化第43页
  5.受精卵培养基的配制与保存第43-45页
   ·贮存液的成分及配制第43页
   ·M2和M16工作液的配制第43-45页
  6.小鼠的选择与处理第45-47页
  7.超排卵与取卵第47页
  8.显微注射第47-48页
   ·持卵针的制备第47页
   ·显微注射针的拉制第47页
   ·显微注射室的制备第47-48页
   ·显微注射第48页
  9.输卵管移卵第48-50页
  10.鼠尾基因组DNA的提取第50-51页
  11.利用PCR和Southern杂交鉴定转基因鼠第51页
   ·PCR法鉴定转基因鼠第51页
   ·Southern杂交鉴定转基因鼠第51页
  12.转基因鼠传代第51-52页
  13.胚胎小鼠器官组织的采集和保存第52页
  14.阳性胎鼠的PCR快速鉴定第52页
  15.组织RNA提取第52-53页
   ·12.5天孕期以后的组织RNA提取第52-53页
   ·10.5天孕期以前的红系组织(卵黄囊)RNA提取第53页
  16.RNase保护实验检测转基因小鼠中人α-类珠蛋白转基因的表达第53-56页
   ·RNA探针标记第53-54页
   ·RNA探针的纯化第54页
   ·RNA∶RNA杂交第54页
   ·RNase反应、变性胶电泳及放射自显影第54-56页
实验结果第56-84页
 一.α-BAC克隆的末端直接测序结果第56-57页
 二.αM Ⅱ BAC突变体(HS-4~33删除)的鉴定结果第57-60页
  1.重组体(αM Ⅱ R1)的酶切及PFGE分析鉴定结果第57页
  2.αM Ⅱ的酶切及PFGE分析鉴定结果第57-58页
  3.αM Ⅱ BAC删除点连接处测序结果第58-59页
  4.αM Ⅱ Southern杂交鉴定结果第59-60页
 三.αM Ⅲ BAC突变体(HS-4~40删除)的鉴定结果第60-66页
  1.温度敏感型穿梭载体pSV-RecA-AB的构建结果第60-62页
  2.重组体的正负筛选第62-63页
  3.αM Ⅲ的酶切及PFGE分析鉴定结果第63页
  4.αM Ⅲ删除点连接处测序结果第63-65页
  5.αM Ⅲ酶切和Southern杂交鉴定结果第65-66页
 四.显微注射用BAC DNA的制备与纯化第66-67页
 五.转基因鼠系的建立第67-68页
  1.转基因鼠PCR检测结果第67页
  2.转基因鼠Southern杂交检测结果第67-68页
 六.人α-珠蛋白在转基因鼠中的表达第68-84页
  1.αM Ⅰ转基因小鼠中人α-类珠蛋白基因表达分析第68-75页
  2.αM Ⅱ转基因小鼠中人α-类珠蛋白基因表达分析第75-81页
  3.αM Ⅲ转基因小鼠中人α-类珠蛋白基因表达分析第81-84页
讨论第84-99页
 一用于修饰BAC克隆的方法第84-86页
 二.人α-类珠蛋白基因在转基因鼠中的表达不干扰内源α-类珠蛋白基因的表达水平第86-87页
 三.人α-类珠蛋白基因的表达模式至少不依赖于某单一上游调控元件第87-89页
  1.HS-40的删除不影响人α-类珠蛋白基因的表达模式第87-88页
  2.HS-4~33的删除不影响人α-类珠蛋白基因的表达模式第88页
  3.人α-类珠蛋白基因的表达模式至少不依赖于某单一上游调控元件第88-89页
 四.上游调控元件以成环(loop)作用机制调控人α-珠蛋白基因簇的转录表达第89-96页
  1.HS-40对于人α-类珠蛋白基因的在转录水平上的表达具有重要作用第89-90页
  2.HS-4~33的删除对人ζ-和人α-珠蛋白基因表达水平影响不同第90-91页
  3.HS-4~40全部高敏位点删除后人α-类珠蛋白转基因不表达第91-92页
  4.任一高敏位点都不足以单独指导人α-珠蛋白基因簇的表达第92-94页
  5.上游调控元件以成环(loop)作用机制调控人α-珠蛋白基因簇的转录表达第94-96页
 五.不足及展望第96-99页
小结第99-100页
参考文献第100-110页
文献综述(一)第110-125页
文献综述(二)第125-136页
英文名词及缩写第136-138页
致谢第138-139页
个人简历第139页

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