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用于毕赤酵母组成型表达的白斑综合征病毒(WSSV)VAP1基因的优化、克隆及大规模简易发酵技术初探

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-11页
第一章引言第11-23页
 第一节 白斑综合征病毒(WSSV)及基因组和结构蛋白研究概况第11-14页
  1 白斑综合征病毒(WSSV)概述第11-12页
   ·白斑综合征病毒(WSSV)结构第11页
   ·白斑综合征病毒(W SSV)生物学特点第11-12页
  2 白斑综合征病毒(WSSV)基因组学及结构蛋白的研究第12-14页
   ·白斑综合征病毒(WSSV)基因组第12页
   ·白斑综合征病毒(WSSV)结构蛋白研究第12-14页
 第二节 毕赤酵母表达系统及影响其表达外源基因的因素第14-19页
  1 巴氏毕赤酵母表达系统第14-16页
   ·巴氏毕赤酵母表达外源蛋白的优势第14-15页
   ·巴氏毕赤酵母表达宿主菌第15页
   ·巴氏毕赤酵母表达载体第15-16页
  2 影响毕赤酵母表达外源基因的因素第16-19页
   ·表达载体的影响第17-18页
     ·启动子影响第17页
     ·信号肽第17-18页
     ·表达框的染色体整合位点和方式第18页
   ·目的基因的影响第18-19页
     ·基因密码子偏好性第18页
     ·基因A+T含量第18页
     ·目的基因拷贝数第18-19页
   ·外部条件影响第19页
 参考文献第19-23页
第二章 白斑综合征病毒VAP1基因的改造及合成第23-34页
 第一节 VAP1氨基酸序列功能和结构分析第23-27页
  1 方法第23页
  2 结果第23-25页
   ·基序(模序)位点分析第23-24页
   ·结构信息第24-25页
     ·氨基酸组成分析第24页
     ·二级结构组成分析第24页
     ·二硫键分析第24页
     ·跨膜分析第24-25页
     ·同源建模第25页
  3 讨论第25-27页
 第二节 VAP1part基因序列分析和改造及人工合成第27-32页
  1 VAP1part基因序列的分析和改造第27-30页
   ·毕赤酵母偏好密码子分析和基因的改造第27-28页
     ·依据第27页
     ·改造及结果第27-28页
   ·碱基含量分析和基因的改造第28页
     ·依据第28页
     ·改造及结果第28页
   ·酶切位点分析和基因的改造第28-29页
     ·依据第28-29页
     ·改造及结果第29页
   ·mRNA二级结构分析第29页
   ·星号活性分析和基因的改造第29页
     ·依据第29页
     ·改造及结果第29页
   ·内含子分析和基因的改造1.6内含子分析和基因的改造第29-30页
     ·依据第29-30页
     ·改造及结果第30页
  2 基因修改序列验证第30-31页
   ·G+C含量第30页
   ·VAP1part基因的氨基酸序列验证第30-31页
  3 VAP1part基因的人工合成第31页
  4 讨论第31-32页
 参考文献第32-34页
第三章 白斑综合征病毒(WSSV) VAP1part基因的克隆及毕赤酵母工程菌的构建第34-56页
 第一节白斑综合征病毒(WSSV) vAP1part基因的亚克隆第34-45页
  1 材料方法第34-40页
   ·材料和试剂第34页
     ·质粒与菌种第34页
     ·主要仪器与化学试剂第34页
     ·引物第34页
   ·方法第34-40页
     ·pUC57CS一VAP1part的获得第35页
     ·表达质粒pGAPZ α A的获得第35-36页
     ·质粒 DNA的定量第36页
     ·质粒pUCS了CS-VAP1part和质粒 pGAPZαA的双酶切第36页
     ·质粒pUC57CS-VAP1Part和质粒pGAPZ αA的双酶切产物分析定量及胶回收纯化第36-38页
     ·pGAPZ αA一VAP1part的构建第38页
     ·大肠杆菌 DH5α超级感受态细胞制备及pGAPZ αA一VAP1Part的转化.第38-39页
     ·重组质粒的菌落 PCR鉴定第39-40页
     ·重组质粒的双酶切鉴定第40页
     ·重组质粒pGAPZαA-VAP1part测序第40页
  2 结果第40-44页
   ·VAP1Part基因的亚克隆第40-43页
     ·质粒 DNA的定量及分析第40-42页
     ·连接产物转化大肠杆菌 DH5α第42-43页
   ·重组质粒的筛选鉴定第43-44页
     ·菌落 PCR 筛选含有重组子菌落第43页
     ·重组质粒的双酶切分析鉴定第43页
     ·重组质粒的 DNA 序列测定.第43-44页
  3 讨论第44-45页
 第二节 白斑综合征病毒(WSSV)VAP1part基因在毕赤酵母中的分泌表达第45-56页
  1 材料方法第45-50页
   ·材料试剂第45页
     ·质粒与菌株第45页
     ·主要仪器与化学试剂第45页
     ·引物第45页
   ·方法第45-50页
     ·重组质粒的扩增与酶切第45-46页
     ·重组质粒转化毕赤酵母第46页
     ·重组毕赤酵母的 PCR 鉴定第46-48页
     ·重组毕赤酵母表达产物检测第48-50页
     ·重组毕赤酵母的快速筛选第50页
  2. 结果第50-54页
   ·重组毕赤酵母的 PCR 鉴定第50-51页
     ·重组毕赤酵母的菌落 PCR 鉴定第50-51页
     ·重组毕赤酵母的基因组 PCR 鉴定第51页
   ·表达产物的 SDS一PAGE 分析第51-52页
   ·表达产物的 Western 分析第52页
   ·表达产物的 ELISA 分析第52-53页
   ·重组毕赤酵母的快速筛选第53-54页
  3 讨论第54-56页
第四章 毕赤酵母实验室规模简易扩大培养装置及发酵效果初探第56-66页
 第一节 发酵装置设计及基本操作第56-59页
  1 设计构思第56页
  2 解决方案第56页
   ·发酵体积第56页
   ·培养方式第56页
     ·充气及空气除菌第56页
     ·控温第56页
     ·设备灭菌第56页
  3 基本结构流程第56-57页
  4 操作流程第57-58页
  5 结果第58页
  6 讨论第58-59页
 第二节毕赤酵母实验室简易扩大培养第59-65页
  1 材料设备第59页
  2 方法第59-60页
   ·简易扩大培养基本流程第59-60页
   ·消泡剂使用效果比较研究第60页
   ·酸碱度、吸光度、菌体湿重的测定第60页
   ·计算毕赤酵母生长速率第60页
  3 结果第60-64页
   ·消泡剂使用效果比较第60-61页
   ·菌体生长过吸收值变化(生长曲线)第61-62页
   ·菌体湿重变化第62-63页
   ·菌液吸光值与菌体湿重相关性分析第63页
   ·培养液 pH变化第63-64页
   ·毕赤酵母生长速率第64页
  4 讨论第64-65页
 参考文献第65-66页
附录一 本论文所使用的培养基和试剂配制第66-70页
附录二 发酵常用消泡剂及特点第70-71页
附录三 重组质粒的构建第71-72页
致谢第72页

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