| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-27页 |
| 第一节 生长激素的结构、生理与功能 | 第11-13页 |
| 一、 生长激素的结构 | 第11页 |
| 二、 生长激素生理 | 第11-12页 |
| 三、 生长激素的功能 | 第12-13页 |
| (一) 生长激素与蛋白质代谢 | 第12页 |
| (二) 生长激素与脂肪代谢 | 第12页 |
| (三) 生长激素与糖代谢 | 第12-13页 |
| 第二节 生长激素基因定位、结构及表达与调控 | 第13-19页 |
| 一、 生长激素基因定位 | 第13-14页 |
| 二、 生长激素基因的结构 | 第14-18页 |
| (一) 生长激素基因拷贝数与编码区的一级结构 | 第14-17页 |
| (二) GH基因5′端与3′端非编码区的结构 | 第17-18页 |
| 三、 禽类GH基因cDNA的结构 | 第18页 |
| 四、 生长激素基因的表达与调控 | 第18-19页 |
| 第三节 猪生长激素(pGH)基因多态性及其与生产性能相关的研究动态 | 第19-24页 |
| 一、 序列多态性 | 第19-20页 |
| 二、 限制性片段长度多态性(RFLP) | 第20页 |
| 三、 PCR-RFLP | 第20-21页 |
| 四、 PCR-SSCP和PCR-DSCP | 第21-22页 |
| 五、 pGH基因多态性与生产性能之间的关系 | 第22页 |
| 六、 其它畜禽GH基因多态性及其与生产性能关系的研究动态 | 第22-24页 |
| (一) 牛生长激素(bGH)基因多态性及其与生产性能相关研究动态 | 第22-23页 |
| (二) 羊GH基因多态性及其与生产性能的相关研究动态 | 第23页 |
| (三) 鸡生长激素(cGH)多态性及其与生产性能相关的研究动态 | 第23-24页 |
| 第四节 猪遗传多样性分子进化研究现状 | 第24-25页 |
| 一、 染色体遗传多样性与猪的进化 | 第24页 |
| 二、 mtDNA遗传多样性与猪的进化 | 第24-25页 |
| 第五节 研究内容与目的、意义 | 第25-27页 |
| 第二章 材料与方法 | 第27-35页 |
| 一、 材料来源 | 第27-28页 |
| 二、 所用仪器设备与试剂 | 第28-35页 |
| (一) 主要仪器设备 | 第28页 |
| (二) 主要试剂 | 第28-29页 |
| 三、 实验方法 | 第29-32页 |
| (一) 基因组DNA的提取 | 第29页 |
| (二) 目的基因的扩增与PCR产物的纯化 | 第29-30页 |
| (三) 测序反应及目的基因序列测定 | 第30-31页 |
| (四) PCR-RFLP检测 | 第31-32页 |
| 四、 数据分析方法 | 第32-35页 |
| (一) pGH基因序列多态性分析 | 第32-33页 |
| (二) pGH基因系统发育关系分析 | 第33页 |
| (三) 分子系统树准确性分析 | 第33-34页 |
| (四) RFLP及其与生长性状的相关分析 | 第34-35页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第35-101页 |
| 第一节 基因组DNA抽提、pGH基因PCR扩增及pGH基因PCR产物纯化 | 第35-36页 |
| 一、 基因组DNA抽提结果 | 第35页 |
| 二、 PCR扩增结果 | 第35页 |
| 三、 pGH基因PCR产物纯化效果 | 第35-36页 |
| 第二节 pGH基因序列多态性分析 | 第36-58页 |
| 一、 全序列多态性分析 | 第36-41页 |
| (一) 变异位点分析 | 第36-40页 |
| (二) 单倍型与核苷酸多样度分析 | 第40页 |
| (三) 分子方差分析(AMOVA) | 第40-41页 |
| 二、 外显子核苷酸多态性分析 | 第41-47页 |
| (一) 单倍型与核苷酸多样度分析 | 第41-43页 |
| (二) 核苷酸组成分析 | 第43-46页 |
| (三) 核苷酸分子方差分析 | 第46-47页 |
| 三、 外显子氨基酸多态性分析 | 第47-56页 |
| (一) 氨基酸组成与含量分析 | 第47-51页 |
| (二) 密码子使用频率与偏爱性分析 | 第51页 |
| (三) 氨基酸变异位点分析 | 第51-56页 |
| 四、 内含子序列多态性分析 | 第56-57页 |
| (一) 单倍型与核苷酸多样度分析 | 第56页 |
| (二) 核苷酸分子方差分析 | 第56-57页 |
| 五、 小结 | 第57-58页 |
| 第三节 pGH基因分子进化分析 | 第58-76页 |
| 一、 核苷酸变异模式分析 | 第58-61页 |
| 二、 核苷酸位点重组与连锁不平衡分析 | 第61-62页 |
| 三、 外显子区同义替代率与异义替代率比较 | 第62-63页 |
| 四、 氨基酸序列的进化分析 | 第63-64页 |
| 五、 GH基因系统发育分析 | 第64-76页 |
| (一) GH基因树的构建 | 第64页 |
| (二) GH基因树分析 | 第64-76页 |
| 第四节 pGH基因RFLPs及其与生长性状的相关分析 | 第76-101页 |
| 一、 GH基因Apa Ⅰ、Bst Ⅺ、Hha Ⅰ和Msp Ⅰ四种内切酶位点分析 | 第76-82页 |
| 二、 pGH基因RFLP分析 | 第82-89页 |
| (一) ApaⅠ酶RFLP | 第82-84页 |
| (二) Bst Ⅺ酶RFLP分析 | 第84-86页 |
| (三) Hha Ⅰ酶RFLP分析 | 第86-87页 |
| (四) Msp Ⅰ酶RFLP分析 | 第87-89页 |
| 三、 RFLP与生产性能的相关分析 | 第89-101页 |
| (一) Apa Ⅰ酶RFLP与生产性能的相关分析 | 第89-93页 |
| (二) Hha Ⅰ酶RFLP与生产性能的相关分析 | 第93-99页 |
| (三) Msp Ⅰ酶RFLP与生产性能的相关分析 | 第99-101页 |
| 第四章 讨论 | 第101-111页 |
| 第一节 影响pGH基因PCR扩增成功率的因素 | 第101-102页 |
| 一、 引物 | 第101页 |
| 二、 PCR反应条件 | 第101-102页 |
| 第二节 pGH基因遗传多样性与密码子偏爱性产生的原因 | 第102-104页 |
| 一、 pGH基因遗传多样性产生的原因 | 第102-103页 |
| 二、 产生密码子偏爱性的原因 | 第103-104页 |
| 第三节 pGH基因遗传多样性和分子进化与品种分化的关系 | 第104-107页 |
| 一、 pGH基因编码区同义替代和异义替代与品种分化 | 第104-105页 |
| 二、 pGH基因遗传多样性变异模式与品种分化 | 第105-106页 |
| 三、 pGH基因分子进化与品种分化 | 第106页 |
| 四、 从pGH基因分子进化树看品种分化 | 第106-107页 |
| 五、 藏猪(ZZ)与大河猪(DH)的品种地位 | 第107页 |
| 六、 大乌猪(Dw)的分枝地位 | 第107页 |
| 第四节 pGH基因PCR-RFLP作为遗传标记应用的可行性 | 第107-110页 |
| 一、 PCR-FRLP作为遗传标记的准确性 | 第107-108页 |
| 二、 pGH基因PCR-RFLP作为遗传标记应用的可行性 | 第108-110页 |
| 三、 对pGH基因多态性与生产性状关系的评价 | 第110页 |
| 第五节 pGH基因的应用前景 | 第110-111页 |
| 第五章 结论 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-123页 |
| 附录: 攻博期间发表的论著、论文及取得的科研成果 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
