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林麝、马麝SRY基因的克隆与编码蛋白质的结构、功能预测及其在系统进化分析中的应用

一、论文第1-48页
 中文摘要第6-8页
 英文摘要第8-10页
 前言第10-11页
 1 材料和方法第11-18页
  1.1 试剂和仪器第11-13页
   1.1.1 实验样品第11页
   1.1.2 菌株和质粒第11页
   1.1.3 试剂第11-12页
   1.1.4 培养基第12页
   1.1.5 缓冲液第12-13页
   1.1.6 仪器第13页
  1.2 方法第13-18页
   1.2.1 林麝及马麝总DNA的提取第13页
   1.2.2 简并引物的设计第13-14页
   1.2.3 林麝及马麝SRY基因片段的扩增第14页
   1.2.4 PCR扩增片段的回收、连接第14-15页
   1.2.5 PCR扩增片段的转化和鉴定第15-16页
   1.2.6 单克隆重组子菌落筛选第16-17页
   1.2.7 测序、蛋白质结构预测与分析第17-18页
   1.2.8 进化分析第18页
 2 结果与分析第18-40页
  2.1 林麝及马麝总DNA的提取第18-19页
  2.2 目的基因的扩增与克隆第19-20页
   2.2.1 SRY基因HMG—box区片断的扩增第19页
   2.2.2 SRY基因CDS区片断的扩增第19-20页
   2.2.3 目的基因片断的连接、转化、克隆第20页
  2.3 目标质粒的提取和酶切鉴定第20-22页
   2.3.1 对插入200bp左右片段质粒的酶切鉴定第20页
   2.3.2 对插入700bp左右片段重组质粒的PCR鉴定第20-22页
  2.4 目标质粒测序及序列分析第22页
  2.5 蛋白质结构预测与分析第22-36页
   2.5.1 SRY CDS区推导出的氨基酸序列第22-26页
   2.5.2 氨基酸组成分析第26-27页
   2.5.3 编码蛋白疏水区的预测第27-29页
   2.5.4 信号肽结构和跨膜区域的分析第29-30页
   2.5.5 SRY CDS区编码蛋白氨基酸序列中结构域的分析第30-31页
   2.5.6 蛋白质二级结构的预测第31-34页
   2.5.7 蛋白质三维结构预测第34-36页
  2.6 系统进化分析第36-40页
   2.6.1 以偶蹄目部分动物SRY基因HMG-box区序列构建的系统发育树第36页
   2.6.2 以偶蹄目部分动物SRY基因CDS区序列构建的系统发育树第36-40页
 3 讨论第40-43页
  3.1 SRY基因编码蛋白的结构预测分析第40页
  3.2 从父系遗传角度对麝及鹿科、牛科系统进化分析第40-42页
  3.3 分子水平研究系统发育时基因的选择第42-43页
 4 参考文献第43-48页
二、综述第48-77页
 1 引言第48-52页
  1.1 TDF的寻找历程第49-51页
   1.1.1 H-Y抗原性别决定假说第49页
   1.1.2 Bkm序列性别决定假说第49页
   1.1.3 ZFY基因性别决定假说第49-50页
   1.1.4 SRY/Sry基因性别决定假说第50-51页
  1.2 SRY基因作为TDF的证据第51-52页
   1.2.1 同源保守第51页
   1.2.2 SRY基因的定位符合作为TDF的要求第51页
   1.2.3 SRY基因表达具有时间特异性和空间特异性第51页
   1.2.4 遗传学证据也表明SRY基因是TDF的最佳候选基因第51-52页
 2 SRY基因的结构与表达第52-58页
  2.1 SRY基因的结构第52-55页
  2.2 SRY基因的表达第55-56页
  2.3 SRY蛋白第56-58页
   2.3.1 SRY蛋白的功能区第56-57页
   2.3.2 mSRY和hSRY的HMG-box结合DNA性质的差异第57页
   2.3.3 SRY基因编码蛋白质的作用机理第57-58页
 3 SRY基因与性别分化调控第58-65页
  3.1 哺乳动物性别分化的层次调控体系第58-59页
  3.2 SRY基因作用的几种模式第59-61页
   3.2.1 SRY激活穆勒氏抑制因子的表达第59-60页
   3.2.2 SRY抑制睾丸形成的负调节因子第60-61页
   3.2.3 DaX1和SRY相互拮抗的性别决定机制第61页
  3.3 SRY的其它相关基因第61-63页
  3.4 SRY基因与SOX基因家族第63-65页
   3.4.1 SOX3第63-64页
   3.4.2 SOX9第64-65页
 4 SRY基因关联的疾病第65-66页
 5 SRY基因的进化第66-69页
  5.1 SRY基因与SOX基因的分子进化第67页
  5.2 SRY基因的序列变异第67-69页
 6 展望第69-70页
 7 参考文献第70-77页
三、研究生期间发表的论文第77-78页
四、声明第78-79页
五、致谢第79页

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