差异表达蛋白质数据库与大规模蛋白质磷酸化化学定量的方法学研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-11页 |
| 第一章 定量蛋白质组学 | 第11-31页 |
| ·蛋白质组学的基本平台 | 第11-13页 |
| ·定量蛋白质组学的研究策略 | 第13-29页 |
| ·2DE-MS途径 | 第13-15页 |
| ·LC-MS和稳定同位素标记途径 | 第15-24页 |
| ·非标定量方法 | 第24-29页 |
| ·发展趋势与前景 | 第29-31页 |
| 第二章 差异表达蛋白质数据库(DEPD) | 第31-53页 |
| ·研究背景和目标 | 第31-37页 |
| ·数据库的构建 | 第37-43页 |
| ·数据搜集流程 | 第37-40页 |
| ·CPXS数据结构 | 第40-41页 |
| ·系统构架 | 第41-43页 |
| ·DEPD的应用 | 第43-52页 |
| ·数据查询 | 第44-48页 |
| ·数据展示 | 第48-49页 |
| ·数据分析 | 第49-51页 |
| ·数据下载 | 第51-52页 |
| ·小结 | 第52-53页 |
| 第三章 大规模蛋白质磷酸化化学定量的方法学研究 | 第53-123页 |
| ·研究背景 | 第53-64页 |
| ·蛋白质的磷酸化研究现状 | 第53-56页 |
| ·基本研究手段 | 第56-59页 |
| ·磷酸化蛋白质的研究热点 | 第59-64页 |
| ·试验设计 | 第64-66页 |
| ·试验目标 | 第64页 |
| ·试验策略 | 第64-66页 |
| ·样本与试剂 | 第66-69页 |
| ·实验材料 | 第66-67页 |
| ·主要试剂 | 第67页 |
| ·仪器 | 第67-68页 |
| ·软件开发工具 | 第68-69页 |
| ·试验方法 | 第69-95页 |
| ·样本处理 | 第70-74页 |
| ·基于质谱的磷酸化化学定量和肽段鉴定 | 第74-76页 |
| ·质谱数据的分析与整理 | 第76页 |
| ·数据处理软件的开发 | 第76-78页 |
| ·数据信号处理流程 | 第78-86页 |
| ·靶向性蛋白质组学与磷酸化肽段的优先鉴定 | 第86-87页 |
| ·整合不同路线的数据产出 | 第87-91页 |
| ·肽段的分类 | 第91页 |
| ·磷酸化位点数据库(Phospho DB)的构建 | 第91-93页 |
| ·数据的导出 | 第93-95页 |
| ·试验结果 | 第95-121页 |
| ·预备试验的方法学验证 | 第95-97页 |
| ·细胞器的分离和纯度鉴定 | 第97-98页 |
| ·质谱鉴定结果 | 第98-121页 |
| ·下一步研究设想 | 第121-123页 |
| 参考文献 | 第123-137页 |
| 附件 | 第137-174页 |
| 动物毒素数据库(ATDB)的构建 | 第137-157页 |
| 程序与代码 | 第157-172页 |
| 论文发表情况 | 第172-173页 |
| 参加学术会议情况 | 第173页 |
| 学术报告 | 第173-174页 |
| 致谢 | 第174-176页 |
| 基金项目资助 | 第176-177页 |
