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脊椎动物多倍体祖先二倍化的分子机制研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
第一章 引言第11-33页
   ·基因组进化与物种进化的关系第11-14页
   ·基因组加倍对物种的可能影响第14-21页
   ·基因组加倍后二倍化的机制研究进展第21-27页
   ·金鱼是研究脊椎动物基因组二倍化分子机制的合适古多倍体脊椎动物第27-31页
   ·本研究的目的和意义第31-33页
第二章:金鱼vsx1基因座位数目的确定第33-61页
   ·前言第33-34页
   ·材料与方法第34-48页
     ·实验材料第34-35页
     ·雌核发育二倍体和单倍体,以及正常二倍体金鱼胚胎的获得第35-38页
     ·金鱼基因组DNA的提取第38-41页
     ·基因组步行法获得vsxl基因上游启动子序列第41-46页
     ·目的片段克隆与测序第46-48页
     ·基因特异性PCR检验及单倍体基因组分析第48页
   ·结果第48-58页
     ·金鱼vsx1基因的基因组步行PCR扩增结果第48-54页
     ·金鱼不同vsx1基因座位的确定第54-58页
   ·小结第58-61页
第三章:金鱼vsx1基因加倍后二倍化的方式第61-92页
   ·前言第61-62页
   ·材料与方法第62-83页
     ·不同vsx1基因座位启动子序列的分析第62页
     ·RNA提取第62-65页
     ·5'RACE试剂盒扩增金鱼vsx1基因cDNA全长序列第65-72页
     ·vsx1不同基因座位RT-PCR分析第72-73页
     ·金鱼整胚原位杂交第73-79页
     ·金鱼vsx1 A1基因启动子控制的报告基因载体的构建第79-81页
     ·显微注射第81-82页
     ·金鱼及不同物种vsx1基因座位启动子序列的进化关系分析第82-83页
   ·结果第83-90页
     ·金鱼vsx1 mRNA非编码区5'RACE分析第83-85页
     ·金鱼不同vsx1基因转录能力的特异性PCR分析第85-86页
     ·金鱼vsx1 A2基因是已经沉默的假基因第86-87页
     ·金鱼vsx1 A1基因启动子组织特异性转录调节关键区域的确定第87-89页
     ·脊椎动物vsx1基因启动子近端区域是高度保守的第89-90页
   ·小结第90-92页
第四章:金鱼vsx1基因冗余座位沉默的分子机制第92-104页
   ·前言第92-94页
   ·材料与方法第94-98页
     ·金鱼vsx1 A1和A2基因CpG岛预测和亚硫酸氢盐测序引物设计第94-95页
     ·金鱼基因组DNA亚硫酸氢钠修饰第95-98页
   ·结果第98-102页
     ·金鱼vsx1 A基因座位启动子表达调控区域的表观遗传差异第98-99页
     ·金鱼vsx1 A2基因座位启动子区域突变序列分析第99-102页
   ·小结第102-104页
第五章 讨论与总结第104-114页
   ·金鱼vsx1基因加倍后二倍化的方式第104-105页
   ·金鱼vsx1基因的进化演变第105-107页
   ·金鱼基因组加倍后冗余基因座位沉默和丢失的可能分子机制第107-109页
   ·脊椎动物四倍体祖先基因组加倍后可能的最初适应机制第109-110页
   ·金鱼vsx1 B序列产生的可能机制第110-114页
参考文献第114-128页
博士学习期间论文发表情况第128-129页
致谢第129-131页

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