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辣椒疫霉(Phytophthora capsici)5个果胶甲基酯酶基因克隆及pcpme1的功能研究

中文摘要第1-19页
Abstract第19-25页
第一章 文献综述第25-65页
 引言第25页
 1 辣椒疫病的研究进展第25-29页
   ·辣椒疫病的发生危害情况第25-26页
   ·辣椒疫病发生规律和发病条件第26页
   ·辣椒疫霉及其生物学特性第26-27页
   ·辣椒疫霉的生理分化第27-28页
   ·辣椒疫病的防治第28-29页
     ·农业防治第28页
     ·化学防治第28-29页
     ·生物防治第29页
 2 植物病原真菌致病基因的研究进展第29-35页
   ·与侵染结构产生有关的基因第30页
   ·与细胞壁降解有关的基因第30-32页
   ·与寄主代谢反应产物有关的基因第32-33页
   ·毒素基因第33-34页
   ·与信号传导有关的基因第34页
   ·其它功能的致病基因第34-35页
 3 植物病原菌细胞壁降解酶的研究现状第35-38页
   ·细胞壁降解酶的分类第36-38页
   ·植物细胞壁降解酶的抑制子第38页
 4 果胶酶的研究进展第38-42页
   ·果胶酶的分类第39-40页
     ·原果胶酶(protopectinases)第39页
     ·多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonases)第39-40页
     ·果胶裂解酶(pectate lyases)第40页
     ·果胶甲基酯酶( Pectin methylesterases)第40页
   ·果胶酶在致病过程中的作用第40-41页
   ·微生物果胶酶基因第41-42页
   ·果胶酶活力的检测方法第42页
     ·滴定法第42页
     ·黏度下降法第42页
     ·脱胶作用时间法第42页
     ·还原糖测定法第42页
     ·235nm 处紫外吸收测定法第42页
 5 果胶甲基酯酶的研究进展第42-52页
   ·果胶甲基酯酶的存在与来源第43页
   ·果胶甲基酯酶的基本生物学特征第43-46页
     ·果胶甲基酯酶的分子量及分子组成第43-44页
     ·果胶甲基酯酶的初级结构第44-45页
     ·果胶甲基酯酶的三级结构第45-46页
   ·果胶甲基酯酶的性质与作用机理第46-47页
   ·果胶甲基酯酶的活性第47-48页
     ·果胶甲基酯酶活性的调节第47页
     ·果胶甲基酯酶活性测定方法与分析第47-48页
   ·植物中果胶甲基酯酶的研究进展第48-50页
     ·植物果胶甲基酯酶特性第48-49页
     ·果胶甲基酯酶在植物发育过程中的功能第49页
     ·植物果胶甲基酯酶的基因克隆第49-50页
   ·果胶甲基酯酶在植物病原菌中的研究第50-52页
     ·果胶甲基酯酶在植物病原细菌中的研究第50-51页
     ·果胶甲基酯酶在植物病原卵菌及真菌中的研究第51页
     ·果胶甲基酯酶突变体的研究第51-52页
   ·果胶甲基酯酶异源表达的研究第52页
 6 蛋白糖基化的研究进展第52-55页
   ·糖基化位点的功能第52-53页
   ·糖基化位点的识别方法第53页
   ·糖基化蛋白的去糖基化第53-55页
     ·外切型糖苷酶(Exo- glycosidase)第54页
     ·内切型糖苷酶(Endo- glycosidase)第54页
     ·糖胺酶(Glycoam idase, N - 糖苷酶)第54-55页
 7 利用酵母体系表达异源蛋白的研究进展第55-60页
   ·酵母表达体系的优点第55页
   ·毕赤酵母表达体系第55-60页
     ·巴斯德毕赤酵母的生物学特性第56-57页
     ·毕赤酵母宿主菌和表达载体的类型第57-58页
     ·表达载体在毕赤酵母中的整合第58-59页
     ·巴斯德毕赤酵母中信号肽的剪切过程第59-60页
 8 重组蛋白纯化的研究进展第60-64页
   ·多聚精氨酸一标签(Arg-tag)第60-61页
   ·多聚组氨酸一标签(His-tag)第61-62页
   ·FLAG-标签第62页
   ·谷胱甘肽S-转移酶标签第62-63页
   ·s-标签第63页
   ·SBP-标签第63-64页
 选题目的及意义第64-65页
第二章 强致病辣椒疫霉菌多聚半乳糖醛酸酶、果胶甲基酯酶、果胶裂解酶活性测定第65-72页
 1 材料与方法第65-67页
   ·材料第65-66页
   ·方法第66-67页
     ·辣椒疫霉菌果胶酶粗酶液的提取第66页
     ·多聚半乳糖醛酸酶的活性测定第66页
     ·果胶甲基酯酶的活性测定第66页
     ·果胶裂解酶的活性测定第66页
     ·粗酶液接种辣椒发病第66-67页
 2 结果与分析第67-69页
   ·强致病辣椒疫霉菌多聚半乳糖醛酸酶活性比较第67页
   ·强致病辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶活性比较第67-68页
   ·强致病辣椒疫霉菌果胶裂解酶活性比较第68-69页
   ·粗酶液接种辣椒后发病面积比较第69页
 3 讨论第69-72页
第三章 辣椒疫霉果胶甲基酯酶基因克隆及序列分析第72-112页
 1 材料与方法第72-79页
   ·材料第72-74页
     ·供试菌株第72页
     ·菌株与质粒第72页
     ·酶和生化试剂第72页
     ·仪器第72页
     ·培养基第72-73页
     ·溶液配制第73页
     ·引物设计第73-74页
   ·实验方法第74-79页
     ·96 个克隆总质粒DNA 的大量提取(碱裂解法)第74-75页
     ·16 个克隆总质粒DNA 的提取第75页
     ·单个克隆质粒DNA 的提取第75页
     ·Pool PCR 法筛选基因组文库第75-76页
     ·全长序列基因的生物信息学分析第76-79页
 2 结果与分析第79-109页
   ·辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶PCPME1 基因的克隆及其序列分析第80-85页
     ·pcpme1 基因的克隆第80页
     ·pcpme1 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第80-82页
     ·PCPME1 的氨基酸组成第82-83页
     ·PCPME1 的二级结构预测第83-85页
   ·辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶PCPME2 基因的序列及结构分析第85-91页
     ·pcpme2 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第85-87页
     ·PCPME2 的氨基酸组成第87-88页
     ·PCPME2 的二级结构预测第88-91页
   ·辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶PCPME3 基因的序列及结构分析第91-96页
     ·pcpme3 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第91-92页
     ·PCPME3 的氨基酸组成第92-93页
     ·PCPME3 的二级结构预测第93-96页
   ·辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶PCPME4 基因的序列及结构分析第96-101页
     ·pcpme4 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第96-98页
     ·PCPME4 的氨基酸组成第98页
     ·PCPME4 的二级结构预测第98-101页
   ·辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶PCPME5 基因的序列及结构分析第101-107页
     ·pcpme5 基因的核苷酸序列和氨基酸序列分析第102-103页
     ·PCPME4 的氨基酸组成第103-104页
     ·PCPME5 的二级结构预测第104-107页
   ·辣椒疫霉5 个果胶甲基酯酶基因的比较第107-108页
   ·辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶基因在自然界中的进化分析第108-109页
 3 讨论第109-112页
   ·辣椒疫霉果胶甲基酯酶基因的序列特征第109-110页
   ·辣椒疫霉果胶甲基酯酶酶基因家族的生物学意义第110-111页
   ·辣椒疫霉果胶甲基酯酶基因与其它 PMEs 的关系第111-112页
第四章 辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶基因在寄主体内的表达第112-122页
 1 材料与方法第112-118页
   ·材料第112页
   ·方法第112-118页
     ·接种辣椒叶片第112页
     ·受试辣椒叶片总RNA 的提取和cDNA 的合成第112-113页
     ·RT-PCR第113-114页
     ·Northern Blot第114-118页
     ·Western Blot 检测pcpme1 在辣椒寄主内的表达情况第118页
 2 结果与分析第118-121页
   ·RT-PCR 扩增结果第118-119页
   ·Northern Blot 分析第119-121页
     ·探针的制备第119页
     ·Northern Blot 分析第119-120页
     ·Western Blot 检测第120-121页
 3 讨论第121-122页
第五章 辣椒疫霉菌果胶甲基酯酶 pcpme1 基因的体外表达、纯化及其活性位点的定点突变第122-154页
 1 pcpme1 基因的体外表达、纯化第122-136页
   ·材料第122-124页
     ·菌株和质粒第122页
     ·酶和生化试剂第122-123页
     ·培养基及有关溶液的配制第123-124页
     ·主要仪器设备第124页
   ·实验方法第124-136页
     ·果胶甲基酯酶基因pcpme1 成熟肽基因序列的分离第124-126页
     ·果胶甲基酯酶基因在毕赤酵母中的表达第126-134页
     ·果胶甲基酯酶融合蛋白的纯化及活性测定第134-135页
     ·纯化PCPME1 的去糖基化第135-136页
     ·特异性抗血清的制备第136页
 2 pcpme1 基因活性位点的定点突变第136-138页
   ·试剂材料第136页
   ·pcpme1 基因活性位点的确定第136页
   ·定点突变第136-138页
 3 结果与分析第138-148页
   ·果胶甲基酯酶基因 pcpme1 在毕赤酵母中的表达第138-145页
     ·pcpme1 成熟肽基因序列的分离第138页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第138-142页
     ·重组表达载体pPIC9K/pcpme1 转化 Pichia pastaris GS115 及酵母转化子的筛选第142-145页
   ·PCPME1 融合蛋白的纯化及活性测定第145-146页
   ·纯化蛋白的去糖基化第146页
     ·去糖基化PCPME1 的SDS-PAGE 分析第146页
     ·去糖基化PCPME1 的活性测定第146页
   ·兔抗血清的制备第146-147页
   ·pcpme1 的定点突变第147-148页
     ·突变后基因序列分析第147页
     ·突变后表达蛋白的纯化第147-148页
     ·突变后蛋白的活性测定第148页
 4 讨论第148-154页
   ·表达系统的选择第148-149页
   ·外源基因在 Pichia pastoris 中的分泌表达的必要性第149页
   ·影响外源基因表达量的因素第149-154页
第六章 辣椒疫霉果胶甲基酯酶PCPME1 及其突变体对辣椒细胞壁的降解第154-163页
 1 材料与方法第154-155页
   ·材料第154页
   ·方法第154-155页
     ·辣椒幼苗叶片的接种第154页
     ·透射电镜观察第154-155页
 2 结果与分析第155-162页
 3 讨论第162-163页
结论与建议第163-166页
 1 结论第163-164页
 2 建议第164-166页
参考文献第166-185页
致谢第185-186页
攻读学位期间发表论文情况第186页

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