| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-33页 |
| ·植物 miRNA | 第15-21页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第15-16页 |
| ·植物miRNA的作用方式 | 第16-17页 |
| ·miRNA的起源与进化 | 第17-19页 |
| ·植物miRNA的调控模式 | 第19-20页 |
| ·植物miRNA鉴定标准 | 第20-21页 |
| ·植物 siRNA | 第21-22页 |
| ·新技术对植物小分子RNA研究的推动 | 第22-26页 |
| ·高通量测序技术对植物小分子RNA研究的促进 | 第22-25页 |
| ·激光显微切割技术对植物小分子RNA研究的促进 | 第25-26页 |
| ·植物小分子RNA合成路径重要酶的研究进展 | 第26-30页 |
| ·RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-Dependent RNA polymerase, RDR） | 第26-27页 |
| ·Argnaute蛋白（AGO） | 第27-29页 |
| ·III型核糖核酸酶（DICER-LIKE, DCL） | 第29-30页 |
| ·研究内容、意义和技术路线 | 第30-33页 |
| ·研究内容和意义 | 第30-31页 |
| ·技术路线 | 第31-33页 |
| 第二章 普通小麦小分子RNA的克隆和深度测序分析 | 第33-57页 |
| ·实验材料 | 第33页 |
| ·植物材料 | 第33页 |
| ·酶及其他实验耗材 | 第33页 |
| ·试剂盒 | 第33页 |
| ·引物 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-45页 |
| ·小麦小分子RNA提取 | 第33-34页 |
| ·小分子RNA文库构建 | 第34-38页 |
| ·生物信息学分析 | 第38-39页 |
| ·小分子RNA Northern杂交 | 第39-40页 |
| ·RNA连接酶介导的5′RACE（RNA ligase-mediated 5′RACE） | 第40-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-57页 |
| ·小麦小分子RNA序列分析 | 第45-46页 |
| ·小麦小分子RNA的组成和相似性 | 第46-47页 |
| ·小麦miRNA | 第47-52页 |
| ·小麦miRNA的表达分析 | 第52页 |
| ·小麦miRNA的靶基因预测及验证 | 第52-54页 |
| ·小麦中能够产生小分子RNA的编码基因 | 第54-57页 |
| 第三章 短柄草小分子RNA的克隆和深度测序分析 | 第57-71页 |
| ·材料与方法 | 第57-58页 |
| ·植物材料 | 第57页 |
| ·试剂 | 第57页 |
| ·菌株和载体 | 第57页 |
| ·实验方法 | 第57-58页 |
| ·结果与分析 | 第58-68页 |
| ·短柄草小分子RNA序列分析 | 第58-59页 |
| ·短柄草小分子RNA组成 | 第59-60页 |
| ·短柄草miRNA | 第60-63页 |
| ·短柄草miRNA的表达分析 | 第63页 |
| ·短柄草miRNA靶基因预测及验证 | 第63-64页 |
| ·短柄草miRNA在营养生长和生殖生长阶段的差异表达 | 第64-66页 |
| ·小分子RNA在小麦、短柄草和水稻基因组序列上的分布 | 第66-68页 |
| ·讨论 | 第68-71页 |
| ·小麦和短柄草的小分子RNA | 第68页 |
| ·小麦和短柄草中miRNA的保守和分化 | 第68-69页 |
| ·小麦和短柄草小分子RNA的基因组分布 | 第69-71页 |
| 第四章 番茄小分子 RNA 合成关键基因 RNA 依赖的 RNA 聚合 酶 1(RNA-Dependent RNA polymerase1, RDR1)的功能研究 | 第71-97页 |
| ·实验材料 | 第71-72页 |
| ·植物材料 | 第71页 |
| ·酶及其它试剂耗材 | 第71页 |
| ·载体和菌株 | 第71页 |
| ·试剂盒 | 第71页 |
| ·引物 | 第71-72页 |
| ·实验方法 | 第72-86页 |
| ·目标基因cDNA的获得及载体构建 | 第72-77页 |
| ·番茄转化 | 第77-79页 |
| ·RNAi转基因植株鉴定 | 第79-85页 |
| ·RNAi转基因植株小分子RNA鉴定 | 第85-86页 |
| ·结果与分析 | 第86-94页 |
| ·目标基因序列分析 | 第86-88页 |
| ·LeRDR1 基因的RNAi载体构建 | 第88-89页 |
| ·LeRDR1 基因RNAi植株的分子鉴定 | 第89-92页 |
| ·LeRDR1 基因RNAi植株的表型鉴定 | 第92-93页 |
| ·LeRDR1 RNAi植株中与表型相关基因的表达量的变化 | 第93-94页 |
| ·讨论 | 第94-97页 |
| 第五章 全文结论 | 第97-99页 |
| ·普通小麦小分子RNA的克隆和深度测序分析 | 第97页 |
| ·短柄草小分子RNA的克隆和深度测序分析 | 第97-98页 |
| ·番茄小分子RNA合成关键基因RNA依赖的RNA聚合酶的功能研究 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-115页 |
| 附录 | 第115-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
| 作者简历 | 第125-126页 |
