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利用中高度重复序列和分子标记对栽培稻与几个野生稻基因组的比较分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第1章 前言第12-36页
   ·野生稻资源的研究概况第12-13页
   ·野生稻种的分类和进化关系研究概况第13-20页
     ·野生稻分类研究的现状第13-16页
       ·亚洲栽培稻O. sativa 和非洲栽培稻O. glaberrima 及其祖先种的分类第15页
       ·含BB,CC 和BBCC 基因组物种的分类第15页
       ·O. latifolia , O. alta 和O. grandiglumis 的分类处理第15-16页
     ·稻属种间亲缘关系第16-20页
       ·药用复合系种间的亲缘关系第16-18页
       ·栽培稻与我国三种野生稻种间亲缘关系第18-19页
       ·稻属其它复合体的进化关系关系第19-20页
   ·稻属比较基因组学研究进展第20-21页
   ·植物基因组重复序列的研究概况第21-29页
     ·植物重复序列主要类型和特点第21-26页
       ·串联重复序列第22-24页
       ·分散重复序列第24-26页
     ·重复序列的起源第26-27页
     ·重复序列的应用第27-29页
       ·研究物种的起源和进化第27-28页
       ·分子标记辅助选择和染色体操作第28-29页
   ·原位杂交技术的发展及其在植物中的应用第29-34页
     ·GISH 技术第29-30页
     ·C_0t-1 DNA-FISH 技术第30-31页
     ·FISH 技术在比较物理作图中的应用第31-34页
     ·结语第34页
   ·本研究的目的和意义第34-36页
第2章 材料和方法第36-49页
   ·实验材料和供试探针第36页
   ·主要试剂第36-40页
   ·实验方法第40-49页
     ·质粒DNA 的提取第40-41页
       ·BAC 质粒的提取第40页
       ·RFLP 质粒的提取第40-41页
     ·植物总 DNA 的提取第41-42页
     ·C_0t-1 DNA 的制备第42-43页
     ·PCR 扩增RFLP 探针第43-46页
     ·染色体的制备第46页
     ·探针的标记、纯化和标记效果的检测第46-47页
     ·染色体原位杂交及信号检测第47-49页
       ·原位杂交第47-48页
       ·信号检测第48-49页
第3章 利用GISH 和C_0t-1DNA-FISH 对稻属B,C,G 基因组的比较分析第49-57页
   ·实验材料第51页
   ·结果与分析第51-53页
     ·药用野生稻、斑点野生稻和疣粒野生稻CGH 分析第51页
     ·药用野生稻、斑点野生稻和疣粒野生稻C_0t-1DNA –FISH 分析第51-52页
     ·基于GISH 图像和C_0t-1DNA FISH 图像的核型分析第52-53页
   ·讨论第53-57页
     ·通过信号覆盖率探讨三种野生稻的基因组成分和相互关系第53-54页
     ·重复序列在进化中的作用第54-55页
     ·C_0t-1 DNA-FISH 的研究意义第55-57页
第4章 栽培稻与药用野生稻第1,2,4,6,7,8,10,12 染色体比较核型分析第57-69页
   ·实验材料第58-59页
     ·植物材料第58页
     ·探针第58-59页
   ·结果与分析第59-66页
     ·药用野生稻第1 染色体比较核型分析第59-60页
     ·药用野生稻第2 染色体比较核型分析第60-61页
     ·药用野生稻第4 染色体比较核型分析第61页
     ·药用野生稻第6 染色体比较核型分析第61-62页
     ·药用野生稻第7 染色体比较核型分析第62-63页
     ·药用野生稻第8 染色体比较核型分析第63页
     ·药用野生稻第10 染色体比较核型分析第63-64页
     ·药用野生稻第12 染色体比较核型分析第64-66页
   ·讨论第66-69页
     ·药用野生稻与栽培稻的比较核型分析第66页
     ·结合比较核型分析和药用野生稻与栽培稻的C_0t-1 DNA 带型分析两种野生稻基因组进化特点第66-67页
     ·RFLP-FISH 技术的研究意义第67-68页
     ·结论第68-69页
第5章 利用BAC-FISH 对药用野生稻第1 染色体比较核型分析第69-73页
   ·实验材料第70页
   ·结果分析第70-71页
   ·讨论第71-73页
第6章 利用栽培稻1 号染色体RFLP 分子标记C112 对斑点野生稻的比较分析第73-77页
   ·实验材料第74页
   ·结果分析第74页
   ·讨论第74-77页
     ·斑点野生稻与栽培稻的第1 染色体比较核型分析第74-75页
     ·RFLP C112 在斑点野生稻基因组中拷贝数的确定第75页
     ·根据C_0t-1 DNA 带型分析两种野生稻第1 染色体重复序列的进化特点第75-77页
总结第77-78页
图版及其说明第78-102页
参考文献第102-119页
致谢第119-120页
附录 A 攻读学位期间已完成或发表的论文第120页

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