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中国铦囊蘑属分类学与分子系统学及生物地理演化研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 综述第9-15页
    1.1 铦囊蘑属的研究历史第9-11页
    1.2 铦囊蘑属的分子系统学的研究现状第11-12页
    1.3 大型真菌生物地理学的研究现状第12-14页
    1.4 拟解决的科学问题第14-15页
第二章 铦囊蘑属形态分类研究第15-36页
    2.1 材料第15页
        2.1.1 研究材料第15页
        2.1.2 设备与试剂第15页
    2.2 研究方法第15-17页
        2.2.1 标本采集与生境照片拍摄第15-16页
        2.2.2 宏观特征记录与研究第16页
        2.2.3 标本干制与分子材料制作第16页
        2.2.4 显微特征记录与研究第16-17页
    2.3 形态与结构第17-18页
        2.3.1 铦囊蘑属宏观特征及术语第17-18页
        2.3.2 铦囊蘑属微观特征及术语第18页
    2.4 铦囊蘑属形态分类第18-36页
第三章 铦囊蘑属分子系统学研究第36-81页
    3.1 研究材料第36-45页
    3.2 研究方法第45-50页
        3.2.1 基因提取第45页
        3.2.2 序列扩增、纯化及测序第45-47页
        3.2.3 克隆测序第47-48页
        3.2.4 矩阵构建第48页
        3.2.5 分子系统发育分析与物种识别第48-50页
    3.3 结果第50-78页
        3.3.1 基于ITS序列的系统发育树(Mrbayes和ML)第59页
        3.3.2 基于RPB2 序列的系统发育树(Mrbayes和ML)第59-78页
        3.3.3 基于LSU、SSU、RPB1、EF-1α的贝叶斯和ML系统发育分析第78页
        3.3.4 基于多基因贝叶斯法系统发育分析第78页
    3.4 讨论第78-79页
    3.5 小结第79-81页
第四章 铦囊蘑属的生物地理演化研究第81-98页
    4.1 研究材料第81-87页
    4.2 研究方法第87-93页
        4.2.1 总DNA的提取第87页
        4.2.2 PCR扩增、检测和测序第87页
        4.2.3 DNA序列的拼接、质控与序列收集第87页
        4.2.4 序列的收集与比对第87-88页
        4.2.5 保守区选择第88页
        4.2.6 饱和度检验第88页
        4.2.7 矩阵的构建第88-89页
        4.2.8 化石标定点(calibration point)的选择第89-90页
        4.2.9 分化时间树的构建和祖先区域的重建第90-91页
        4.2.10 进化树优化与历史生物地理学分析第91-93页
    4.3 结果第93-98页
        4.3.1 分化时间推断第93-96页
        4.3.2 Melanoleucua属的演化历史及扩散路线推测第96-98页
结论第98-99页
参考文献第99-106页
致谢第106-107页
附录第107-116页
在学期间公开发表论文和著作情况第116页

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