摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第1章 绪论 | 第12-18页 |
1.1 研究背景及意义 | 第12-13页 |
1.2 国内外研究现状 | 第13-16页 |
1.3 主要研究内容 | 第16页 |
1.4 论文章节安排 | 第16-18页 |
第2章 关键蛋白质挖掘算法研究 | 第18-28页 |
2.1 蛋白质网络拓扑特性 | 第18-20页 |
2.1.1 蛋白质网络中节点度的分布特性与“中心-致死性” | 第18-20页 |
2.1.2 蛋白质网络中的介数中心性与其关键性的分析 | 第20页 |
2.2 六种经典的拓扑中心性方法 | 第20-22页 |
2.2.1 六种网络拓扑中心性与“中心-致死性”的拓展 | 第20-22页 |
2.3 基于拓扑特性与生物信息结合的关键蛋白质挖掘算法 | 第22-24页 |
2.3.1 拓扑-生物中心性的挖掘算法 | 第23页 |
2.3.2 拓扑-生物特征的机器学习挖掘算法 | 第23-24页 |
2.4 基于六种网络拓扑中心性的关键蛋白质挖掘算法 | 第24-27页 |
2.4.1 实验数据 | 第24页 |
2.4.2 实验方法 | 第24页 |
2.4.3 实验结果与分析 | 第24-27页 |
2.4.4 基于拓扑中心性挖掘算法的局限性 | 第27页 |
2.5 小结 | 第27-28页 |
第3章 基于蛋白质功能的关键蛋白质挖掘算法 | 第28-38页 |
3.1 蛋白质功能与其关键性的相关性 | 第28-32页 |
3.2 基于蛋白质功能的关键蛋白质挖掘算法FUN | 第32-34页 |
3.2.1 算法说明 | 第32-33页 |
3.2.2 算法描述 | 第33-34页 |
3.3 基于蛋白质功能挖掘关键蛋白质实验对比 | 第34-36页 |
3.4 基于蛋白质功能挖掘低度关键蛋白质准确性 | 第36-37页 |
3.5 小结 | 第37-38页 |
第4章 基于蛋白质功能和蛋白质网络度中心性的关键蛋白质挖掘算法 | 第38-45页 |
4.1 两种预测因子所挖掘的关键蛋白质集合的互补性 | 第38-39页 |
4.2 基于两种预测因子的关键蛋白质挖掘算法DC_FUN | 第39-41页 |
4.2.1 算法说明 | 第39页 |
4.2.2 算法描述 | 第39-41页 |
4.3 基于蛋白质网络与蛋白质功能挖掘关键蛋白质的实验对比 | 第41-43页 |
4.4 DC_FUN算法预测低度的关键蛋白质准确性 | 第43页 |
4.5 小结 | 第43-45页 |
结论 | 第45-47页 |
参考文献 | 第47-52页 |
致谢 | 第52页 |