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基于SSR标记的菲律宾蛤仔DNA指纹图谱构建及软件开发

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 文献综述第8-18页
    1 分子标记在水产动物遗传学中的种类、应用与研究第8-11页
        1.1 RFLP第8页
        1.2 RAPD第8-9页
        1.3 AFLP第9页
        1.4 SSR第9-10页
        1.5 SNP第10-11页
    2 微卫星的应用第11-15页
        2.1 微卫星标记的优点与不足第11-12页
        2.2 微卫星标记的开发方法第12-14页
        2.3 微卫星标记在贝类遗传育种中的应用第14-15页
    3 DNA指纹图谱的构建及应用第15-16页
        3.1 微卫星DNA指纹图谱的构建第15页
        3.2 微卫星DNA指纹计算机化鉴定第15-16页
    4.本研究的目的与意义第16-18页
        4.1 筛选微卫星标记构建指纹图谱第16页
        4.2 菲律宾蛤仔不同群体的遗传结构分析第16-17页
        4.3 计算机化种质资源鉴定技术的开发第17-18页
第二章 菲律宾蛤仔不同群体微卫星DNA指纹图谱的构建和遗传结构分析第18-38页
    1 实验材料第18-19页
        1.1 实验样品第18页
        1.2 实验试剂第18-19页
        1.3 实验仪器第19页
    2 实验方法第19-23页
        2.1 菲律宾蛤仔基因组DNA提取第19-21页
        2.2 微卫星引物筛选第21-23页
    3 数据统计与分析第23-26页
        3.1 等位基因和有效等位基因(Observednumberofalleles,NaandEffectivenumberofalleles,Ne)第23-24页
        3.2 杂合度(Heterozygosity,H)第24页
        3.3 遗传距离(Geneticdistance,D)第24页
        3.4 遗传相似系数(Geneticidentity,I)第24页
        3.5 固定指数(Fixationindex,F)第24页
        3.6 Shannon's指数(Shannon'sindexofphenotypicdiversity,S)第24-25页
        3.7 多态信息含量(PolymorphismInformationContent,PIC)第25页
        3.8 Hardy-Weinberg平衡偏离指数第25-26页
    4 结果第26-36页
        4.1 DNA的提取及定量第26页
        4.2 6个群体菲律宾蛤仔的SSR扩增结果第26-33页
        4.3 6个菲律宾蛤仔群体SSR-DNA指纹模式图第33-35页
        4.4 不同菲律宾蛤仔群体间的遗传距离和聚类分析第35-36页
    5 讨论第36-38页
        5.1 六个群体的杂合度和遗传多样性第36页
        5.2 6个菲律宾蛤仔群体DNA指纹图谱及分子标记和Hardy-Weinberg平衡检验第36-37页
        5.3 遗传距离和聚类分析第37-38页
第三章 菲律宾蛤仔微卫星DNA指纹的计算机化鉴定第38-50页
    1 菲律宾蛤仔SSR-DNA指纹图谱软件关键技术第38页
    2 SSR-DNA指纹图谱相似度的计算方法第38-39页
    3 SSR-DNA指纹图谱鉴别软件的开发与实现第39-40页
        3.1 实验材料及方法第39-40页
    4 结果第40-48页
    5 讨论第48-50页
结论第50-51页
参考文献第51-59页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第59-61页
致谢第61页

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