| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 引言 | 第11-21页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第11页 |
| 1.2 植物抗旱生理生化研究进展 | 第11-13页 |
| 1.2.1 渗透调节物质、植物激素与植物的抗旱性 | 第11-12页 |
| 1.2.2 植物抗氧化系统应对干旱胁迫的研究 | 第12-13页 |
| 1.3 植物干旱胁分子机理研究 | 第13-14页 |
| 1.3.1 干旱胁迫信号的转导 | 第13页 |
| 1.3.2 植物通过干旱胁迫信号诱导基因进行表达 | 第13页 |
| 1.3.3 转录水平上干旱胁迫应答基因的调节和控制 | 第13-14页 |
| 1.4 甜高粱研究进展 | 第14-15页 |
| 1.4.1 甜高粱抗旱性研究进展 | 第14-15页 |
| 1.4.2 甜高粱作为能源作物的研究 | 第15页 |
| 1.5 转录组测序技术 | 第15-17页 |
| 1.5.1 转录组的定义 | 第16页 |
| 1.5.2 高通量测序 | 第16-17页 |
| 1.6 转录组测序研究进展 | 第17-19页 |
| 1.6.1 单细胞转录组分析 | 第18页 |
| 1.6.2 转录组测序确定RNA结构 | 第18-19页 |
| 1.6.3 高通量测序在植物抗逆方面的研究 | 第19页 |
| 1.7 高通量测序技术的前景 | 第19-20页 |
| 1.8 新一代测序技术 | 第20-21页 |
| 2 实验设计与方法 | 第21-25页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第21-22页 |
| 2.1.2 主要仪器设备和实验试剂 | 第22页 |
| 2.1.3 总RNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.1.4 总RNA的检测 | 第23页 |
| 2.2 RNA文库构建和HiSeq2500测序 | 第23-25页 |
| 2.2.1 RNA文库构建 | 第23页 |
| 2.2.2 文库质控 | 第23页 |
| 2.2.3 上机测序 | 第23-25页 |
| 3 结果分析 | 第25-63页 |
| 3.1 生物信息学分析 | 第25-40页 |
| 3.1.1 RNA样品及测序数据质量控制 | 第25-30页 |
| 3.1.2 甜高粱高通量转录组测序数据组装 | 第30-33页 |
| 3.1.3 评估甜高粱高通量转录组测序文库质量 | 第33-35页 |
| 3.1.4 Unigene功能注释 | 第35-36页 |
| 3.1.5 基因结构分析 | 第36-40页 |
| 3.2 干旱胁迫下甜高粱基因表达量分析 | 第40-42页 |
| 3.2.1 Unigene表达量计算 | 第40页 |
| 3.2.2 甜高粱基因表达量总体分布 | 第40-42页 |
| 3.3 干旱胁迫下甜高粱基因的差异表达分析 | 第42-51页 |
| 3.3.1 干旱胁迫下甜高粱差异表达基因筛选 | 第42-44页 |
| 3.3.2 干旱胁迫下甜高粱差异表达基因聚类分析 | 第44-51页 |
| 3.4 干旱胁迫下甜高粱DEG功能注释和富集分析 | 第51-61页 |
| 3.4.1 干旱胁迫下甜高粱差异表达基因GO功能富集 | 第52-55页 |
| 3.4.2 差异表达基因COG分类 | 第55-57页 |
| 3.4.3 差异表达基因KEGG注释 | 第57-58页 |
| 3.4.4 差异表达基因KEGG通路富集分析 | 第58-61页 |
| 3.5 qRT-PCR | 第61-63页 |
| 4 讨论 | 第63-79页 |
| 4.1 干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)的聚类结果分析 | 第63-65页 |
| 4.2 差异表达基因的GO富集分析 | 第65-67页 |
| 4.3 差异表达基因的COG富集分析 | 第67-68页 |
| 4.4 干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)干旱响应重要的Pathway | 第68-79页 |
| 5 结论 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-89页 |
| 附录 | 第89-91页 |
| 附录A 图3-15具体类目 | 第89-90页 |
| 附录B 软件列表 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
