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Retromer复合体在稻瘟病菌和禾谷镰刀菌中的功能分析

摘要第10-12页
Abstract第12-14页
第一章 文献综述第15-47页
    1 Retromer的研究概述第15-20页
        1.1 Retromer的发现和鉴定第15-16页
        1.2 Retromer复合体的组成和结构特征第16-17页
            1.2.1 分拣连接蛋白亚单位第16页
            1.2.2 受体识别亚单位第16-17页
        1.3 Retromer的生物学功能第17-19页
            1.3.1 酵母中的功能第17-18页
            1.3.2 哺乳动物中的功能第18-19页
            1.3.3 植物中的功能第19页
        1.4 Retromer和自噬的关系第19-20页
    2 稻瘟病与稻瘟病菌第20-26页
        2.1 稻瘟病概况第20页
        2.2 稻瘟病菌的侵染循环第20-21页
        2.3 稻瘟病菌附着胞的形成第21-24页
            2.3.1 界面硬度和疏水性影响附着胞的形成第22页
            2.3.2 疏水蛋白Mpg1和Mph1调控附着胞的形成第22页
            2.3.3 跨膜蛋白Pth11调控附着胞形成第22页
            2.3.4 信号途径调控附着胞的形成第22-24页
        2.4 稻瘟病菌附着胞膨压的形成第24-25页
            2.4.1 海藻糖代谢第24页
            2.4.2 脂质代谢第24-25页
            2.4.3 糖原代谢第25页
        2.5 稻瘟病菌和自噬的关系第25-26页
    3 禾谷镰刀菌研究概况第26-29页
        3.1 禾谷镰刀菌引起严重的小麦赤霉病第26页
        3.2 禾谷镰刀菌的特征和生活史第26-27页
        3.3 禾谷镰刀菌分子遗传学的研究进展第27-29页
            3.3.1 毒素合成过程中的分子生物学研究第27-28页
            3.3.2 各类组学的研究第28-29页
    4 本研究的目的和所要解决的问题第29-30页
    参考文献第30-47页
第二章 Vps35/retromer对稻瘟病菌附着胞介导的侵染起至关重要的作用第47-103页
    1 材料与方法第48-62页
        1.1 供试菌株第48页
        1.2 培养基和培养条件第48-50页
        1.3 致病性鉴定材料第50页
        1.4 质粒载体第50-53页
        1.5 生化试剂第53-54页
        1.6 常规分子操作方法第54页
        1.7 稻瘟病菌DNA、RNA的提取和cDNA的合成第54页
        1.8 基因敲除突变体的获得第54-56页
            1.8.1 敲除载体的构建第54-55页
            1.8.2 稻瘟病菌原生质体制备及转化第55页
            1.8.3 敲除突变体的筛选和验证第55-56页
        1.9 Gene-GFP融合载体的构建及互补转化第56页
        1.10 基因敲除突变体的表型分析第56-60页
            1.10.1 菌落形态和生长速度测定第56页
            1.10.2 稻瘟病菌细胞壁敏感性测定第56-57页
            1.10.3 产孢过程观察量及产量统计第57页
            1.10.4 致病性分析第57页
            1.10.5 孢子萌发及附着胞形成分析第57-58页
            1.10.6 洋葱表皮内侵染结构的观察第58页
            1.10.7 大麦表皮内侵染结构的观察和侵染情况分析第58页
            1.10.8 附着胞膨压的测定第58页
            1.10.9 糖原染色第58-59页
            1.10.10 脂肪粒染色第59页
            1.10.11 孢子的自噬性死亡分析第59页
            1.10.12 自噬体(RFP-ATG8)在附着胞形成过程中的定位分析第59页
            1.10.13 实时荧光定量PCR第59-60页
            1.10.14 Western blot检测自噬体的累积第60页
        1.11 MoVps35-GFP和RFP-ATG8的共定位分析第60页
        1.12 Co-IP分析第60页
        1.13 MoVps35的定位观察第60-61页
        1.14 荧光染色及细胞学分析第61页
        1.15 动态电影的制作第61页
        1.16 酵母双杂交分析retromer复合体互作关系第61-62页
    2 结果与分析第62-94页
        2.1 稻瘟病菌中含有Vps35的同源物第62页
        2.2 MoVPS35基因的敲除及突变体的获得第62-64页
        2.3 MoVPS35基因敲除突变体的表型分析第64-81页
            2.3.1 MoVps35调控菌丝的营养生长第64-66页
            2.3.2 △Movps35突变体对细胞壁抑制剂敏感第66-67页
            2.3.3 MoVps35通过调控分生孢子梗的分化进而调控分生孢子的产量第67-68页
            2.3.4 MoVps35对稻瘟病菌的致病性是必须的第68-69页
            2.3.5 MoVps35调控附着胞介导的侵染第69-71页
            2.3.6 MoVps35参与附着孢膨压的产生第71-73页
            2.3.7 MoVps35调控糖原和脂肪粒的转运和代谢第73-76页
            2.3.9 MoVps35调控孢子的自噬性死亡第76-77页
            2.3.10 MoVps35调控自噬体的形成第77-80页
            2.3.11 MoVps35调控ATGs基因的转录第80-81页
        2.4 MoVps35能够和MoAtg8部分共定位并与剪切修饰后的MoATG互作第81-83页
        2.5 MoVps35以小点状定位于液泡膜第83-85页
        2.6 MoVps35-GFP在液泡上具有分选功能第85-88页
        2.7 MoVps26-MoVps29-MoVps35组成retromer货物选择复合体第88-89页
        2.8 基因敲除MoVPS26和MoVPS29产生△Movps35相似的表型缺陷第89-94页
    3 总结与讨论第94-97页
    参考文献第97-103页
第三章 retromer介导的转运对禾谷镰刀菌的生长发育及致病性起至关重要的作用第103-142页
    1 材料与方法第105-111页
        1.1 供试菌株第105页
        1.2 培养基和培养条件第105-106页
        1.3 致病性鉴定材料第106页
        1.4 质粒载体第106页
        1.5 生化试剂第106页
        1.6 常规分子操作方法第106-107页
        1.7 禾谷镰刀菌DNA、RNA的提取和cDNA的合成第107页
        1.8 基因敲除突变体的获得第107页
            1.8.1 敲除载体的构建第107页
            1.8.2 禾谷镰刀菌原生质体制备及转化第107页
            1.8.3 敲除突变体的筛选和验证第107页
        1.9 Gene-GFP融合载体的构建及互补转化第107-108页
        1.10 FgVps35的定位观察第108页
        1.11 FgVps35-GFP和FgKex2-mCherry的共定位分析第108页
        1.12 荧光染色及细胞学分析第108-109页
        1.13 动态电影的制作第109页
        1.14 基因敲除突变体的表型分析第109-110页
            1.14.1 菌落形态和生长速度测定第109页
            1.14.2 产孢量统计第109页
            1.14.3 禾谷镰刀菌有性交配第109-110页
            1.14.4 致病性分析第110页
            1.14.5 禾谷镰刀菌DON毒素含量的测定第110页
        1.15 实时荧光定量PCR第110-111页
        1.16 Western blot检测FgVps35-GFP的表达第111页
        1.17 酵母双杂交分析retromer复合体互作关系第111页
    2 结果与分析第111-133页
        2.1 FgVPS35的鉴定与进化分析第111-113页
        2.2 FgVps35以小点状定位于细胞质第113-115页
        2.3 FgVps35能够从液泡膜转运至TGN第115-116页
        2.4 FgVps35以依赖微管的方式在细胞内转运第116-117页
        2.5 药物阻碍FgVps35的转运导致生长发育缺陷第117-118页
        2.6 FgVps35的功能分析第118-133页
            2.6.1 FgVPS35基因的敲除第118-120页
            2.6.2 FgVps35调控菌丝的生长第120-121页
            2.6.3 FgVps35调控分生孢子的形态和产量第121-122页
            2.6.4 △Fgvps35突变体无法产生子囊和子囊孢子第122-124页
            2.6.5 △Fgvps35突变体致病性减弱第124-126页
            2.6.6 镰刀菌中retromer各个亚基间的互作关系第126-128页
            2.6.7 Retromer复合体各个亚基的生物学功能相似第128-133页
    3 小结和讨论第133-136页
    参考文献第136-142页
附录1 Retromer在稻瘟病菌研究中使用的引物第142-146页
附录2 Retromer在禾谷镰刀菌研究中使用的引物第146-149页
附录3 Vps35同源序列的比对分析第149-155页
附录4 攻读博士学位期间发表的研究论文第155-156页
致谢第156-157页

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