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曲霉潜在药靶PmmA、Erg10A和AkrA的生物学功能及其分子特征研究

缩略词第3-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-10页
第一章 绪论第14-36页
    1.1 威胁人类健康的致病菌-曲霉菌第14-17页
        1.1.1 真菌感染现状概述第14-15页
        1.1.2 曲霉病概述第15-16页
        1.1.3 曲霉病的诊断第16-17页
    1.2 临床抗真菌药物概述第17-20页
        1.2.1 多烯类药物第18-19页
        1.2.2 唑类药物第19页
        1.2.3 棘白菌素类药物第19-20页
    1.3 抗真菌药物的研究进展第20-23页
        1.3.1 抗真菌药物耐药性的产生第20-21页
        1.3.2 抗真菌药物的研发现状第21-23页
    1.4 药物靶点的筛选第23-24页
    1.5 基于分子片段的药物筛选技术第24-25页
    1.6 药物靶点的鉴定:结合遗传和化学手段第25-27页
    1.7 真菌细胞壁组分前体合成途径作为药物靶点的研究第27-29页
    1.8 真菌细胞膜组分麦角固醇合成通路作为药物靶点的研究第29-30页
    1.9 真菌钙信号通路作为药物靶点的研究第30-33页
    1.10 本文的研究内容和思路第33-36页
        1.10.1 研究内容第33-34页
        1.10.2 研究思路第34-36页
第二章 材料与方法第36-64页
    2.1 菌株及培养条件第36-40页
    2.2 曲霉基因组DNA提取第40-41页
    2.3 曲霉突变体的构建第41-51页
        2.3.1 曲霉原生质体的制备与转化第41-42页
        2.3.2 构巢曲霉akrA基因敲除菌株的构建第42-43页
        2.3.3 alcA(p)GFP-akrA酒精启动子条件菌株的构建第43-44页
        2.3.4 AkrA回补菌株、C端DHHC结构域敲除及点突变菌株构建第44-46页
        2.3.5 AkrA与CnaA、CchA、MidA、PmrA等钙信号系统成员的双敲菌株构建第46-47页
        2.3.6 高尔基体RFP标签菌株的构建第47页
        2.3.7 表达水母发光蛋白Aequorin菌株的构建第47-48页
        2.3.8 烟曲霉pmmA及erg10A酒精启动子菌株的构建第48-50页
        2.3.9 烟曲霉Erg10A C端GFP菌株的构建第50-51页
    2.4 突变株表型分析第51-53页
        2.4.1 菌丝生长及产孢第51页
        2.4.2 孢子萌发率第51页
        2.4.3 细胞壁破坏试剂敏感性第51-52页
        2.4.4 E-test与唑类药物敏感性检测第52页
        2.4.5 细胞壁组分测定第52页
        2.4.6 生物膜定量检测第52页
        2.4.7 胞内ROS定量第52-53页
    2.5 Western blotting第53页
    2.6 Real-time qPCR第53-54页
    2.7 荧光显微镜观察第54页
    2.8 酵母双杂交第54-55页
    2.9 胞内钙离子浓度测定第55页
    2.10 酰基生物素交换法(ABE)第55-56页
    2.11 液相色谱串联质谱(LS-MS/MS)第56-57页
    2.12 蛋白的表达与纯化第57-59页
        2.12.1 烟曲霉PmmA的表达载体构建及蛋白纯化第57-58页
        2.12.2 烟曲霉Erg10A表达载体构建及蛋白纯化第58-59页
    2.13 PmmA和Erg10A蛋白的酶活检测第59-60页
    2.14 蛋白的结构解析第60-61页
        2.14.1 蛋白晶体的生长与优化第60页
        2.14.2 晶体衍射数据的收集和处理第60-61页
    2.15 利用生物薄膜干涉技术(Biolayer interferometry,BLI)进行片段分子筛选第61-62页
    2.16 蛋白生物素化标记第62-64页
第三章 烟曲霉磷酸甘露糖变位酶PmmA作为潜在抗真菌药物靶点的研究第64-96页
    3.1 遗传学验证第66-75页
        3.1.1 pmmA的鉴定和酒精启动子条件菌株的构建第66-67页
        3.1.2 pmmA对烟曲霉生长发育的影响第67-71页
        3.1.3 pmmA对细胞壁破坏试剂敏感性影响的研究第71-72页
        3.1.4 pmmA对细胞壁组分影响的研究第72-74页
        3.1.5 pmmA对生物膜形成影响的研究第74-75页
    3.2 生化及结构生物学验证第75-95页
        3.2.1 PmmA蛋白的酶活动力学检测第75-79页
        3.2.2 PmmA蛋白的结构解析第79-85页
        3.2.3 利用小分子片段库筛选与PmmA蛋白结合的化合物第85-95页
    3.3 本章小结第95-96页
第四章 烟曲霉乙酰辅酶A酰基转移酶Erg10A作为潜在抗真菌药物靶点的研究第96-127页
    4.1 遗传学验证第98-107页
        4.1.1 erg10A的鉴定及酒精启动子条件菌株的构建第98-99页
        4.1.2 erg10A对菌丝生长影响的研究第99-102页
        4.1.3 Erg10A蛋白的定位第102-103页
        4.1.4 erg10A对细胞壁破坏试剂敏感性影响的研究第103-104页
        4.1.5 erg10A对细胞壁组分影响的研究第104-106页
        4.1.6 erg10A对氧化应激敏感性影响的研究第106-107页
    4.2 生化及结构生物学验证第107-126页
        4.2.1 Erg10A蛋白的酶活动力学检测第107-111页
        4.2.2 Erg10A蛋白的结构解析第111-118页
        4.2.3 利用小分子片段库筛选与Erg10A蛋白结合的化合物第118-126页
    4.3 本章小结第126-127页
第五章 棕榈酰转移酶AkrA参与维持胞内钙离子稳态及作为潜在药物靶点的研究第127-160页
    5.1 曲霉中NFAT同源蛋白的比对第129-130页
    5.2 AkrA的遗传表型及定位第130-137页
    5.3 棕榈酰转移酶AkrA蛋白中DHHC结构域的功能研究第137-140页
    5.4 AkrA与钙离子信号通路成员相互关系的研究第140-144页
    5.5 AkrA参与调节胞内钙离子动态平衡的研究第144-150页
    5.6 AkrA蛋白DHHC结构域中半胱氨酸的功能研究第150-154页
    5.7 构巢曲霉中可能被棕榈酰转移酶AkrA棕榈酰化修饰的蛋白初步研究第154-156页
    5.8 akrA基因缺失对唑类药物敏感性的改变第156-158页
    5.9 本章小结第158-160页
第六章 总结及展望第160-165页
    6.1 磷酸甘露糖变位酶PmmA第160-161页
    6.2 乙酰辅酶A酰基转移酶Erg10A第161-163页
    6.3 棕榈酰转移酶AkrA第163-164页
    6.4 展望第164-165页
参考文献第165-179页
在读期间发表的学术论文及研究成果第179-180页
致谢第180页

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