蛋白质三维结构的四元数建模与分析
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-13页 |
| 1.2.1 蛋白质二级结构检测的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.2.2 蛋白质空间结构比对的研究现状 | 第12-13页 |
| 1.3 论文结构安排 | 第13-15页 |
| 第2章 蛋白质结构及四元数理论 | 第15-30页 |
| 2.1 蛋白质结构 | 第15-18页 |
| 2.1.1 蛋白质的基本结构 | 第15-16页 |
| 2.1.2 蛋白质三维结构的直接获取 | 第16-17页 |
| 2.1.3 蛋白质三维结构表示法 | 第17-18页 |
| 2.2 蛋白质数据库 | 第18-21页 |
| 2.3 四元数基础概述 | 第21-28页 |
| 2.3.1 四元数的定义与运算法则 | 第21-23页 |
| 2.3.2 四元数表示旋转 | 第23-24页 |
| 2.3.3 四元数与旋转矩阵之间的相互转换 | 第24-25页 |
| 2.3.4 四元数的可视化方法 | 第25-28页 |
| 2.4 本章小结 | 第28-30页 |
| 第3章 蛋白质 α 螺旋检测的四元数方法 | 第30-45页 |
| 3.1 蛋白质二级结构检测传统算法 | 第30-31页 |
| 3.2 蛋白质 α 螺旋检测的四元数方法 | 第31-36页 |
| 3.2.1 Cα 坐标系的构建 | 第31-34页 |
| 3.2.2 四元数螺旋轴球面距离的计算 | 第34-36页 |
| 3.3 数据仿真实验 | 第36-37页 |
| 3.4 实验及结果分析 | 第37-43页 |
| 3.4.1 实例 1（1C94） | 第38-40页 |
| 3.4.2 实例 2（1A6G） | 第40-42页 |
| 3.4.3 检测结果与精度比较 | 第42-43页 |
| 3.5 本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 基于四元数黎曼度量的蛋白质空间结构比对 | 第45-65页 |
| 4.1 蛋白质结构比对传统方法 | 第45-47页 |
| 4.2 黎曼流形与四元数黎曼度量 | 第47-50页 |
| 4.2.1 黎曼流形与黎曼度量 | 第47-49页 |
| 4.2.2 蛋白质结构与四元数黎曼度量 | 第49-50页 |
| 4.3 蛋白质结构的曲线表示与结构特征矩阵的构建 | 第50-55页 |
| 4.3.1 三次样条插值 | 第50-52页 |
| 4.3.2 蛋白质结构形状匹配 | 第52-54页 |
| 4.3.3 基于蛋白质几何特征构建对称正定矩阵 | 第54-55页 |
| 4.4 基于四元数求取黎曼度量并进行比较分析 | 第55-57页 |
| 4.4.1 求取黎曼度量的两种方法 | 第55-56页 |
| 4.4.2 设定黎曼距离的阈值并比较分析 | 第56-57页 |
| 4.5 实验结果与分析 | 第57-64页 |
| 4.5.1 不同相似度的蛋白质数据集 | 第57-59页 |
| 4.5.2 与QHASD-Corr参数比较 | 第59-62页 |
| 4.5.3 较难识别蛋白质结构数据集 | 第62-63页 |
| 4.5.4 基于HOMSTRAD数据库的验证 | 第63-64页 |
| 4.6 本章小结 | 第64-65页 |
| 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第72-73页 |
| 作者简介 | 第73页 |
