| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-23页 |
| 1.1 沼泽型水牛和黄牛简介 | 第12-13页 |
| 1.2 哺乳动物骨骼肌的结构与运动 | 第13-15页 |
| 1.2.1 哺乳动物骨骼肌结构 | 第13-14页 |
| 1.2.2 哺乳动物骨骼肌的运动 | 第14-15页 |
| 1.3 肉质和肌肉力量性状的研究进展 | 第15-19页 |
| 1.4 转录组测序(RNA-Seq)技术 | 第19-23页 |
| 1.4.1 RNA-Seq原理 | 第19-22页 |
| 1.4.2 RNA-Seq的应用 | 第22-23页 |
| 第二章 沼泽型水牛与黄牛背最长肌生理生化指标检测 | 第23-45页 |
| 摘要 | 第23-24页 |
| 前言 | 第24-25页 |
| 1 材料与方法 | 第25-33页 |
| 1.1 材料 | 第25-26页 |
| 1.1.1 实验动物 | 第25页 |
| 1.1.2 主要仪器和试剂 | 第25-26页 |
| 1.2 试验方法 | 第26-33页 |
| 1.2.1 肌肉样品pH测定 | 第26页 |
| 1.2.2 肌肉样品粗脂肪含量(IMF)测定 | 第26-27页 |
| 1.2.3 肌肉样品水分的测定 | 第27-28页 |
| 1.2.4 肌肉样品剪切力的测定 | 第28页 |
| 1.2.5 肌肉样品灰分的测定 | 第28-29页 |
| 1.2.6 肌肉样品组织学测定 | 第29-30页 |
| 1.2.7 肌肉样品氨基酸成分测定 | 第30页 |
| 1.2.8 qRT-PCR验证候选基因 | 第30-33页 |
| 2 结果和分析 | 第33-42页 |
| 2.1 沼泽型水牛和黄牛背最长肌生理生化指标检测结果 | 第33-34页 |
| 2.2 背最长肌组织学检测结果 | 第34-37页 |
| 2.3 氨基酸分析结果 | 第37-41页 |
| 2.4 qRT-PCR检测结果 | 第41-42页 |
| 3 讨论 | 第42-44页 |
| 4 小结 | 第44-45页 |
| 第三章: 沼泽型水牛和广西本地黄牛背最长肌转录组测序与分析 | 第45-75页 |
| 摘要 | 第45-46页 |
| 前言 | 第46-50页 |
| 1 材料和方法 | 第50-55页 |
| 1.1 材料 | 第50页 |
| 1.1.1 实验动物 | 第50页 |
| 1.1.2 主要仪器和试剂 | 第50页 |
| 1.2 试验方法 | 第50-55页 |
| 1.2.1 肌肉样品RNA的提取和质控 | 第50-51页 |
| 1.2.2 测序cDNA文库构建 | 第51-52页 |
| 1.2.3 RNA-Seq文库质检 | 第52页 |
| 1.2.4 上机mRNA-Seq和原始数据预处理 | 第52-53页 |
| 1.2.5 转录组测序reads全基因比对与注释 | 第53页 |
| 1.2.6 转录本表达量及标准化 | 第53页 |
| 1.2.7 转录组合并 | 第53-54页 |
| 1.2.8 差异基因分析 | 第54页 |
| 1.2.9 差异基因功能分析 | 第54-55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-72页 |
| 2.1 总RNA提取与质量检测 | 第55-57页 |
| 2.2 cDNA文库构建结果与评估 | 第57-59页 |
| 2.3 转录组原始数据统计与计算 | 第59-72页 |
| 2.3.1 原始数据 | 第59-60页 |
| 2.3.2 碱基类型分布 | 第60-61页 |
| 2.3.4 转录组数据及比对结果 | 第61-62页 |
| 2.3.5 差异表达基因分析 | 第62-69页 |
| 2.3.6 差异基因功能分析 | 第69-72页 |
| 3 讨论 | 第72-74页 |
| 4 小结 | 第74-75页 |
| 结论 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 硕士期间发表的文章 | 第88页 |