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拟南芥与油菜GDSL类脂肪酶基因的in silico分析及其对种子油脂积累影响的研究

致谢第9-10页
缩略词表第10-11页
图表一览第11-17页
摘要第17-19页
ABSTRACT第19-20页
第一章 导言第21-26页
    1.1 十字花科油料作物(油菜)的生产及其在国民经济中的意义第21-23页
    1.2 提高油菜含油量的策略第23-25页
    1.3 本研究需要回答与解决的主要科学问题第25-26页
第二章 文献综述第26-58页
    2.1 脂肪酸与油脂合成的生化机制第26-28页
    2.2 种子含油量性状的基因调控网络及操纵第28-37页
        2.2.1 含油量QTL定位第28-33页
        2.2.2 油脂合成重要基因的调控及操纵第33-37页
    2.3 重组近交系与近等基因系第37-38页
    2.4 种子油脂的消减与GDSL类脂酶基因第38-58页
        2.4.1 GDSL脂酶家族成员的种类第40-43页
        2.4.2 GDSL脂酶家族基因的系统发育和进化第43-44页
        2.4.3 GDSL脂酶家族基因的内含子特征第44-45页
        2.4.4 GDSL脂酶基因表达特征第45-47页
        2.4.5 GDSL脂酶蛋白亚细胞定位第47-48页
        2.4.6 GDSL脂酶生化结构特征第48-50页
        2.4.7 GDSL脂酶的生化功能第50-51页
        2.4.8 植物GDSL脂酶家族的生物学功能第51-58页
第三章 油菜与拟南芥GDSL酯酶基因家族比较分析第58-76页
    3.1 引言第58-59页
    3.2 材料与方法第59-60页
        3.2.1 数据获取第59页
        3.2.2 序列分析第59页
        3.2.3 系统进化分析第59-60页
    3.3 结果与分析第60-70页
        3.3.1 油菜A基因组和拟南芥GDSL基因的获取第60-61页
        3.3.2 油菜A基因组和拟南芥GDSL基因的结构分析第61页
        3.3.3 油菜A基因组GDSL基因内保守序列的识别第61页
        3.3.4 油菜A基因组GDSL基因家族的系统进化分析第61-65页
        3.3.5 油菜A基因组和拟南芥GDSL基因同源簇分析第65-67页
        3.3.6 油菜A基因组和拟南芥GDSL同源基因的系统进化分析第67-68页
        3.3.7 油菜A基因组和拟南芥GDSL基因基因组定位分析第68页
        3.3.8 油菜A基因组GDSL基因的亚细胞定位分析第68-70页
    3.4 讨论第70-73页
        3.4.1 油菜A基因组和拟南芥GDSL基因鉴定与序列分析第70-71页
        3.4.2 油菜A基因组和拟南芥GDSL基因系统进化关系第71-72页
        3.4.3 油菜A基因组GDSL基因亚细胞定位分析第72-73页
    3.5 展望第73-76页
第四章 GDSL类基因的组织表达特异性以及种子油脂消减效应第76-106页
    4.1 引言第76-77页
    4.2 材料与方法第77-86页
        4.2.1 拟南芥突变体订购与种植第77-78页
        4.2.2 CTAB法提取DNA第78页
        4.2.3 拟南芥突变体T-DNA插入位置的分子鉴定第78-82页
        4.2.4 RNA提取和Reverse Transcript-PCR第82页
        4.2.5 拟南芥GDSL基因的电子表达谱分析第82-84页
        4.2.6 脂肪酸测定第84-85页
        4.2.7 拟南芥gdsl突变体种子的千粒重、显微成像及油体电镜观察第85-86页
    4.3 结果与分析第86-100页
        4.3.1 拟南芥杂合性鉴定第86-88页
        4.3.2 拟南芥GDSL基因在不同组织中的电子表达特征第88-90页
        4.3.3 拟南芥GDSL基因在组织中的半定量表达(RT-PCR)特征第90-93页
        4.3.4 拟南芥gdsl突变体种子千粒重及形态比较第93-95页
        4.3.5 拟南芥GDSL基因突变对种子含油量的影响第95-97页
        4.3.6 拟南芥gdsl突变体种子的超微结构第97-98页
        4.3.7 拟南芥GDSL基因突变对种子脂肪酸组分的影响第98-100页
    4.4 讨论第100-106页
第五章 油菜种子含油量差异的重组自交系与近等基因系GDSL类基因的表达模式第106-138页
    5.1 引言第106-107页
    5.2 材料与方法第107-115页
        5.2.1 油菜重组自交系材料的获得及田间种植第107-108页
        5.2.2 油菜RIL-hoc与RIL-loc种粒干重、电镜观察及含油量测定第108页
        5.2.3 油菜重组近交材料种粒RNA的提取与基因表达分析第108-110页
        5.2.4 油菜近等基因系材料的获得第110-111页
        5.2.5 响应高温的含油量QTL(goC.C2.2)的鉴定第111-112页
        5.2.6 荚果发育期不同温度处理NIL-1与NIL-9后种子GDSL基因表达谱第112-115页
    5.3 结果与分析第115-134页
        5.3.1 RIL-hoc与RIL-loc含油量及脂肪酸组分的差异第115-117页
        5.3.2 RIL-hoc与RIL-loc种子细胞超微结构的差异第117-118页
        5.3.3 RIL-hoc与RIL-loc种子中GDSL基因表达模式与强度的差异第118-122页
        5.3.4 油菜A基因组GDSL基因在种子中表达的表达强度第122-126页
        5.3.5 基因型差异对油菜种子脂肪酸含量以及GDSL基因表达的影响第126-129页
        5.3.6 温度差异对油菜种子脂肪酸含量以及A基因组GDSL基因表达的影响第129-132页
        5.3.7 温度与基因型的互作对油菜A基因组GDSL基因表达的影响第132-134页
    5.4 讨论第134-138页
总结与展望第138-142页
参考文献第142-159页
攻读博士期间发表的文章第159页

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