| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 英文缩写词 | 第10-17页 |
| 第1章 绪论 | 第17-29页 |
| 1.1 甲胎蛋白的结构与功能 | 第17-18页 |
| 1.2 甲胎蛋白的诊断价值 | 第18页 |
| 1.3 甲胎蛋白异质体作为肝细胞癌的肿瘤标志物 | 第18-23页 |
| 1.3.1 凝集素亲和电泳 | 第19-20页 |
| 1.3.2 AFP-L3 的检测 | 第20-23页 |
| 1.4 MRM 技术的原理和特点 | 第23-27页 |
| 1.4.1 定量蛋白质组学简介 | 第23-24页 |
| 1.4.2 MRM 技术的原理 | 第24页 |
| 1.4.3 MRM 技术特点 | 第24-26页 |
| 1.4.4 MRM 技术在蛋白质翻译后修饰研究中的作用 | 第26-27页 |
| 1.5 本文主要研究内容 | 第27-29页 |
| 第2章 甲胎蛋白糖肽的鉴定 | 第29-37页 |
| 2.1 引言 | 第29-30页 |
| 2.2 材料和方法 | 第30-31页 |
| 2.2.1 主要试剂 | 第30页 |
| 2.2.2 仪器设备 | 第30页 |
| 2.2.3 实验方法 | 第30-31页 |
| 2.3 结果和讨论 | 第31-35页 |
| 2.3.1 AFP 完整糖肽在质谱中糖链特征离子的筛选 | 第31-33页 |
| 2.3.2 AFP 的 N 糖链糖型分析 | 第33-35页 |
| 2.4 小结 | 第35-37页 |
| 第3章 甲胎蛋白糖肽 MRM 测定方法的建立 | 第37-55页 |
| 3.1 前言 | 第37-39页 |
| 3.2 材料和方法 | 第39-40页 |
| 3.2.1 主要试剂 | 第39页 |
| 3.2.2 仪器设备 | 第39页 |
| 3.2.3 实验方法 | 第39-40页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第40-52页 |
| 3.3.1 还原-烷基化条件的优化 | 第40-41页 |
| 3.3.2 AFP 候选非糖肽的选择及其 MRM 检测条件优化 | 第41-42页 |
| 3.3.3 AFP 糖肽以及简易糖肽在三重四极杆质谱中的碎裂模式 | 第42-44页 |
| 3.3.4 AFP 糖肽碰撞能量的优化 | 第44-48页 |
| 3.3.5 用于最终定量分析的最适非糖肽的挑选 | 第48-50页 |
| 3.3.6 定量方法的检测限、线性范围和重现性 | 第50-51页 |
| 3.3.7 脐带血来源 AFP 的糖链 MRM 定量分析 | 第51-52页 |
| 3.4 小结 | 第52-55页 |
| 第4章 免疫亲和-MRM 定量分析策略的建立及在 HCC 患者血清 AFP 检测中的应用 | 第55-71页 |
| 4.1 前言 | 第55-56页 |
| 4.2 材料和方法 | 第56-59页 |
| 4.2.1 主要试剂 | 第56页 |
| 4.2.2 仪器设备 | 第56页 |
| 4.2.3 实验方法 | 第56-59页 |
| 4.3 结果和讨论 | 第59-69页 |
| 4.3.1 免疫亲和富集方法的优化 | 第59-61页 |
| 4.3.2 RapiGest 对 Endo F3 酶活性的影响 | 第61-62页 |
| 4.3.3 实际样本中糖肽 MRM 检测方法的重现性和检测限 | 第62-63页 |
| 4.3.4 肝癌和肝硬化患者中各种完整糖肽的变化 | 第63-68页 |
| 4.3.5 肝癌和肝硬化患者中简化糖肽的变化 | 第68-69页 |
| 4.4 小结 | 第69-71页 |
| 第5章 酶切过程中的肽段过烷基化影响蛋白质的定性和定量分析 | 第71-83页 |
| 5.1 引言 | 第71-72页 |
| 5.2 材料与方法 | 第72-73页 |
| 5.2.1 主要试剂 | 第72页 |
| 5.2.2 仪器设备 | 第72页 |
| 5.2.3 实验方法 | 第72-73页 |
| 5.3 结果和讨论 | 第73-81页 |
| 5.3.1 还原-烷基化对酶切效率的影响 | 第73-74页 |
| 5.3.2 烷基化肽段的质谱鉴定 | 第74-76页 |
| 5.3.3 不同氨基酸发生烷基化的趋势分析 | 第76-77页 |
| 5.3.4 氨基酸烷基化具有排他性和聚集性 | 第77-78页 |
| 5.3.5 烷基化对鉴定结果的影响 | 第78-80页 |
| 5.3.6 肽段烷基化的定量分析 | 第80-81页 |
| 5.4 小结 | 第81-83页 |
| 第6章 SILAC 技术定量分析 H5N1 病毒感染后肺癌细胞蛋白质组的变化 | 第83-95页 |
| 6.1 引言 | 第83页 |
| 6.2 材料和方法 | 第83-85页 |
| 6.2.1 主要试剂 | 第83-84页 |
| 6.2.2 仪器设备 | 第84页 |
| 6.2.3 实验方法 | 第84-85页 |
| 6.3 结果和讨论 | 第85-94页 |
| 6.3.1 蛋白质质谱鉴定和定量结果 | 第85-86页 |
| 6.3.2 H5N1 病毒感染引起表达量显著变化的蛋白质 | 第86-90页 |
| 6.3.3 差异表达蛋白质功能分析 | 第90-91页 |
| 6.3.4 讨论 | 第91-94页 |
| 6.4 小结 | 第94-95页 |
| 结论 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-105页 |
| 附录 | 第105-131页 |
| 攻读博士学位期间的主要成果 | 第131-133页 |
| 致谢 | 第133页 |
