| 缩写符号 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-31页 |
| 1.1 甘蔗的分类及特征 | 第13页 |
| 1.2 甘蔗基因组学研究 | 第13-14页 |
| 1.3 植物着丝粒结构 | 第14-15页 |
| 1.4 植物着丝粒DNA序列 | 第15-21页 |
| 1.4.1 卫星重复序列 | 第16-19页 |
| 1.4.2 反转录转座子序列 | 第19-21页 |
| 1.4.3 功能基因 | 第21页 |
| 1.5 着丝粒序列研究方法 | 第21-22页 |
| 1.6 着丝粒DNA进化机制 | 第22-29页 |
| 1.6.1 卫星序列和反转录转座子关系 | 第22-24页 |
| 1.6.2 新着丝粒 | 第24-25页 |
| 1.6.3 含重复序列和不含重复序列着丝粒 | 第25-27页 |
| 1.6.4 端着丝粒和双着丝粒 | 第27-29页 |
| 1.7 本研究的主要内容 | 第29-30页 |
| 1.8 本研究的目的和意义 | 第30-31页 |
| 第二章 材料与方法 | 第31-36页 |
| 2.1 实验材料 | 第31页 |
| 2.2 实验方法 | 第31-32页 |
| 2.2.1 染色质免疫共沉淀 | 第31页 |
| 2.2.2 染色质免疫共沉淀并高通量测序 | 第31页 |
| 2.2.3 染色体免疫荧光实验 | 第31-32页 |
| 2.2.4 荧光原位杂交 | 第32页 |
| 2.3 实验数据 | 第32页 |
| 2.4 数据分析 | 第32-36页 |
| 2.4.1 分析平台 | 第33页 |
| 2.4.2 分析软件 | 第33-34页 |
| 2.4.3 分析流程 | 第34-36页 |
| 第三章 结果与分析 | 第36-55页 |
| 3.1 细胞学验证CenH3抗体特异性及ChIP实验 | 第36-38页 |
| 3.2 甘蔗割手密SES208基因组重复序列组成分析 | 第38-40页 |
| 3.3 甘蔗割手密SES208着丝粒DNA序列的计算鉴定 | 第40-42页 |
| 3.4 细胞学验证甘蔗割手密SES208着丝粒DNA序列 | 第42-46页 |
| 3.5 甘蔗着丝粒包含卫星重复和反转录转座子序列 | 第46-48页 |
| 3.6 甘蔗着丝粒重复序列的结构组成 | 第48-51页 |
| 3.7 甘蔗着丝粒卫星序列的染色体特异性富集 | 第51-53页 |
| 3.8 甘蔗着丝粒卫星序列单体的分歧 | 第53-55页 |
| 第四章 讨论与展望 | 第55-58页 |
| 4.1 讨论 | 第55-57页 |
| 4.1.1 甘蔗基因组含有大量重复序列 | 第55页 |
| 4.1.2 甘蔗着丝粒具有经典着丝粒特征 | 第55-56页 |
| 4.1.3 甘蔗卫星重复序列Ss1占据着丝粒 | 第56页 |
| 4.1.4 甘蔗着丝粒卫星重复序列的特异性富集 | 第56-57页 |
| 4.2 展望 | 第57-58页 |
| 全文结论与创新点 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-70页 |
| 附录A 甘蔗基因组重复序列组成信息 | 第70-77页 |
| 附录B 甘蔗着丝粒DNA序列信息 | 第77-82页 |
| 附录C 甘蔗着丝粒卫星序列单体比对信息 | 第82-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
