| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 综述 | 第12-24页 |
| 引言 | 第12页 |
| 1 盐环境放线菌研究进展 | 第12-17页 |
| 1.1 盐环境放线菌研究意义 | 第12-13页 |
| 1.2 盐环境放线菌资源多样性 | 第13-17页 |
| 2 研究环境微生物群落结构的方法进展 | 第17-20页 |
| 2.1 免培养手段 | 第17-19页 |
| 2.2 纯培养手段 | 第19-20页 |
| 3 新疆艾丁湖盐湖概况 | 第20-21页 |
| 4 研究意义和研究方案 | 第21-24页 |
| 第二章 基于454测序技术对艾丁湖地区微生物群落组成的研究 | 第24-51页 |
| 1 材料与方法 | 第24-31页 |
| 1.1 样品来源及理化参数测定 | 第24-25页 |
| 1.2 环境样品DNA的提取 | 第25-26页 |
| 1.3 16S rRNA基因V4区扩增 | 第26-28页 |
| 1.4 454测序与数据处理 | 第28-29页 |
| 1.5 454测序数据多样性分析 | 第29-30页 |
| 1.5.1 OTU划分 | 第29页 |
| 1.5.2 多样性指数分析 | 第29页 |
| 1.5.3 稀薄曲线分析 | 第29-30页 |
| 1.5.4 分类学分析 | 第30页 |
| 1.6 盐湖和绿洲环境整体微生物类群与土壤理化因子相关性分析 | 第30页 |
| 1.7 盐湖和绿洲环境放线菌类群组成及差异比较 | 第30-31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-51页 |
| 2.1 土壤的理化参数 | 第31-33页 |
| 2.2 环境DNA的提取 | 第33页 |
| 2.3 16S rRNA基因V4高变区扩增 | 第33-34页 |
| 2.4 测序及数据预处理 | 第34页 |
| 2.5 454数据分析 | 第34-44页 |
| 2.5.1 OTU分析 | 第34-36页 |
| 2.5.2 多样性指数分析 | 第36-37页 |
| 2.5.3 稀薄曲线分析 | 第37-39页 |
| 2.5.4 分类学分析 | 第39-44页 |
| 2.6 盐湖和绿洲环境主要类群与理化因子的相关性分析 | 第44-46页 |
| 2.7 盐湖和绿洲环境放线菌群落组成及差异比较 | 第46-50页 |
| 2.7.1 OTU统计 | 第46页 |
| 2.7.2 分类学分析 | 第46-49页 |
| 2.7.3 盐湖和绿洲环境测序样点聚类分析 | 第49-50页 |
| 3 小结 | 第50-51页 |
| 第三章 利用BIOLOG板对可培养放线菌资源的挖掘 | 第51-81页 |
| 第一节 基于BIOLOG GP_2板的有效底物预测 | 第51-62页 |
| 1 材料和方法 | 第51-53页 |
| 1.1 样品采集 | 第51页 |
| 1.2 制备BIOLOG GP_2接种液 | 第51页 |
| 1.3 BIOLOG GP_2板培养及读数 | 第51页 |
| 1.4 数据分析 | 第51-53页 |
| 1.4.1 BIOLOG GP_2板底物分类 | 第51页 |
| 1.4.2 微生物群落ELISA反应整体表述 | 第51-52页 |
| 1.4.3 微生物群落ELISA反应底物分类表述 | 第52-53页 |
| 2 结果与讨论 | 第53-61页 |
| 2.1 BIOLOG GP_2板底物分类 | 第53-55页 |
| 2.2 群落代谢强度的变化及差异 | 第55-61页 |
| 3 小结 | 第61-62页 |
| 第二节 基于预测结果对25~ | 第62-81页 |
| 1 材料与方法 | 第62-66页 |
| 1.1 样品选择 | 第62页 |
| 1.2 分离培养基的配制 | 第62-63页 |
| 1.3 分离方法及培养条件 | 第63-64页 |
| 1.4 菌株的纯化及保藏 | 第64页 |
| 1.5 菌株基因组DNA的提取 | 第64页 |
| 1.6 16S rRNA基因的扩增和测序 | 第64-65页 |
| 1.6.1 试剂与仪器 | 第64-65页 |
| 1.6.2 16S rRNA基因扩增及测序 | 第65页 |
| 1.7 16S rRNA基因序列系统发育分析 | 第65-66页 |
| 2 结果与讨论 | 第66-79页 |
| 2.1 两样点可培养放线菌的群落组成及多样性 | 第66-74页 |
| 2.2 预测底物与实际分离效果比较 | 第74-76页 |
| 2.3 盐湖两样点放线菌类群与已报道类群及免培养数据比较 | 第76-79页 |
| 3 小结 | 第79-81页 |
| 总结与展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-86页 |
| 硕士期间成果目录 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87页 |
