| 摘要 | 第3-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 1 文献综述 | 第9-25页 |
| 1.1 代谢工程简介 | 第9页 |
| 1.2 代谢网络研究进展 | 第9-13页 |
| 1.2.1 代谢网络概述 | 第9-10页 |
| 1.2.2 基因组尺度代谢网络的构建 | 第10-12页 |
| 1.2.3 克雷伯氏杆菌基因组尺度代谢网络的介绍 | 第12-13页 |
| 1.3 代谢网络分析方法 | 第13-17页 |
| 1.3.1 代谢控制分析 | 第13页 |
| 1.3.2 代谢通量分析 | 第13-14页 |
| 1.3.3 代谢路径分析 | 第14-15页 |
| 1.3.4 通量平衡分析 | 第15-17页 |
| 1.4 微生物发酵产1,3-丙二醇研究进展 | 第17-22页 |
| 1.4.1 1 ,3-丙二醇的物化性质和主要用途 | 第17-18页 |
| 1.4.2 微生物发酵生产1,3-丙二醇的优点 | 第18-19页 |
| 1.4.3 甘油生物转化为1,3-丙二醇的菌株 | 第19-20页 |
| 1.4.4 克雷伯氏杆菌生产1,3-丙二醇代谢工程的研究进展 | 第20-22页 |
| 1.5 本课题研究的目的、意义和内容 | 第22-25页 |
| 1.5.1 本课题研究的目的和意义 | 第22页 |
| 1.5.2 本课题研究的内容 | 第22-25页 |
| 2 混合整数线性规划算法的改进 | 第25-35页 |
| 2.1 引言 | 第25页 |
| 2.2 算法的介绍 | 第25-30页 |
| 2.2.1 线性规划最优值的求解 | 第25-26页 |
| 2.2.2 混合整数线性规划(MILP) | 第26-28页 |
| 2.2.3 改进的混合整数线性规划 | 第28-30页 |
| 2.3 改进混合整数线性规划算法的应用 | 第30-33页 |
| 2.4 本章小结 | 第33-35页 |
| 3 克雷伯氏杆菌碳中心代谢网络最优可行代谢路径的分析 | 第35-51页 |
| 3.1 引言 | 第35页 |
| 3.2 微氧下最优可行代谢路径分析 | 第35-45页 |
| 3.2.1 微氧代谢网络模型的构建 | 第35-37页 |
| 3.2.2 微氧代谢网络通量平衡模型的建立 | 第37-38页 |
| 3.2.3 微氧下最优可行代谢路径分析 | 第38-45页 |
| 3.3 厌氧下最优可行代谢路径分析 | 第45-49页 |
| 3.3.1 厌氧代谢网络模型的构建 | 第45-46页 |
| 3.3.2 厌氧代谢网络通量平衡模型的建立 | 第46-48页 |
| 3.3.3 厌氧下最优可行代谢路径分析 | 第48-49页 |
| 3.4 本章小结 | 第49-51页 |
| 4 克雷伯氏杆菌基因组代谢网络的最优可行代谢路径分析 | 第51-62页 |
| 4.1 引言 | 第51-52页 |
| 4.2 基因组尺度代谢网络模型的简化与算法 | 第52-54页 |
| 4.3 基因组代谢网络的最优可行代谢路径分析 | 第54-60页 |
| 4.3.1 生物量对最优可行代谢路径的影响 | 第54-55页 |
| 4.3.2 最优可行代谢路径的节点分析 | 第55-58页 |
| 4.3.3 最优可行代谢路径的ATP分析 | 第58-60页 |
| 4.3.4 氧气对最优可行代谢路径的影响 | 第60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-62页 |
| 5 结论与展望 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 附录 | 第71-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第76-77页 |
