四链DNA与药物结合模式的研究
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 符号说明 | 第12-13页 |
| 第一章 综述 | 第13-23页 |
| §1.1 背景介绍 | 第13-17页 |
| §1.1.1 四链DNA的研究进展 | 第13-14页 |
| §1.1.2 四链DNA的分子识别 | 第14-17页 |
| §1.2 研究方法 | 第17-21页 |
| §1.2.1 分子动力学模拟 | 第17-19页 |
| §1.2.2 常用分子动力学模拟软件 | 第19-21页 |
| §1.3 分子动力学模拟在生物大分子研究中的应用 | 第21-22页 |
| §1.4 本文的结构 | 第22-23页 |
| 第二章 模拟方法和分析参量 | 第23-29页 |
| §2.1 分子动力学模拟的基本步骤 | 第23-25页 |
| §2.1.1 模拟系统介绍 | 第23页 |
| §2.1.2 构造初始构型 | 第23-24页 |
| §2.1.3 预优化过程 | 第24-25页 |
| §2.1.4 生产相过程 | 第25页 |
| §2.2 参数分析过程 | 第25-29页 |
| §2.2.1 力场的稳定性分析 | 第25-26页 |
| §2.2.2 集群分析 | 第26-27页 |
| §2.2.3 时序分析 | 第27-29页 |
| 第三章 四链DNA与药物结合过程的分子动力学模拟 | 第29-51页 |
| §3.1 初始构型的构造 | 第29-30页 |
| §3.2 分子动力学模拟过程 | 第30-32页 |
| §3.3 模拟结果与分析 | 第32-48页 |
| §3.3.1 平行四链DNA稳定性验证 | 第32-35页 |
| §3.3.2 药物结合模式分析 | 第35-44页 |
| §3.3.3 药物结合路径分析 | 第44-48页 |
| §3.4 本章小结 | 第48-51页 |
| 第四章 结论与展望 | 第51-53页 |
| §4.1 结论 | 第51-52页 |
| §4.2 展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 致谢 | 第59-61页 |
| 发表或将发表的文章 | 第61-62页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第62页 |
