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四链DNA与药物结合模式的研究

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
符号说明第12-13页
第一章 综述第13-23页
    §1.1 背景介绍第13-17页
        §1.1.1 四链DNA的研究进展第13-14页
        §1.1.2 四链DNA的分子识别第14-17页
    §1.2 研究方法第17-21页
        §1.2.1 分子动力学模拟第17-19页
        §1.2.2 常用分子动力学模拟软件第19-21页
    §1.3 分子动力学模拟在生物大分子研究中的应用第21-22页
    §1.4 本文的结构第22-23页
第二章 模拟方法和分析参量第23-29页
    §2.1 分子动力学模拟的基本步骤第23-25页
        §2.1.1 模拟系统介绍第23页
        §2.1.2 构造初始构型第23-24页
        §2.1.3 预优化过程第24-25页
        §2.1.4 生产相过程第25页
    §2.2 参数分析过程第25-29页
        §2.2.1 力场的稳定性分析第25-26页
        §2.2.2 集群分析第26-27页
        §2.2.3 时序分析第27-29页
第三章 四链DNA与药物结合过程的分子动力学模拟第29-51页
    §3.1 初始构型的构造第29-30页
    §3.2 分子动力学模拟过程第30-32页
    §3.3 模拟结果与分析第32-48页
        §3.3.1 平行四链DNA稳定性验证第32-35页
        §3.3.2 药物结合模式分析第35-44页
        §3.3.3 药物结合路径分析第44-48页
    §3.4 本章小结第48-51页
第四章 结论与展望第51-53页
    §4.1 结论第51-52页
    §4.2 展望第52-53页
参考文献第53-59页
致谢第59-61页
发表或将发表的文章第61-62页
学位论文评阅及答辩情况表第62页

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