| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-22页 |
| 1.1 TMEM16A 通道的研究背景与意义 | 第9-13页 |
| 1.2 TMEM16A 通道的研究现状 | 第13-20页 |
| 1.2.1 TMEM16A 通道的通透性 | 第13页 |
| 1.2.2 TMEM16A 通道的门控性 | 第13-16页 |
| 1.2.3 TMEM16A 通道的结构 | 第16-20页 |
| 1.3 本论文的主要内容 | 第20-22页 |
| 第二章 TMEM16A 通道研究的理论和实验方法 | 第22-35页 |
| 2.1 同源模建 | 第22-25页 |
| 2.1.1 模建过程的基本步骤 | 第23-24页 |
| 2.1.2 同源模建的局限性 | 第24-25页 |
| 2.1.3 同源模建工具 Modeller | 第25页 |
| 2.2 分子动力学模拟 | 第25-30页 |
| 2.2.1 分子动力学的基本思想 | 第26-27页 |
| 2.2.2 力场函数 | 第27-28页 |
| 2.2.3 牛顿动力学方程的数值求解 | 第28-29页 |
| 2.2.4 能量最小化和能量平衡 | 第29-30页 |
| 2.3 膜片钳和定点突变方法 | 第30-34页 |
| 2.3.1 膜片钳方法 | 第30-32页 |
| 2.3.2 膜片钳的基本记录模式 | 第32-33页 |
| 2.3.3 定点突变方法 | 第33-34页 |
| 2.4 讨论与小结 | 第34-35页 |
| 第三章 钙离子结合位点形成基础的分析 | 第35-45页 |
| 3.1 钙离子结合型蛋白 | 第35-39页 |
| 3.1.1 钙调蛋白 | 第36-37页 |
| 3.1.2 大电导钙激活的钾离子通道 | 第37-39页 |
| 3.2 典型钙结合位点的结构及识别 | 第39-43页 |
| 3.2.1 EF-hand 的结构特征 | 第39-40页 |
| 3.2.2 C2-domain 的结构特征 | 第40-41页 |
| 3.2.3 dockerin-domain 的结构特征 | 第41页 |
| 3.2.4 钙碗的结构特征 | 第41-42页 |
| 3.2.5 基于结晶结构和典型序列的识别方法 | 第42-43页 |
| 3.3 钙离子氨基酸亲和性的统计性分析 | 第43-44页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第44-45页 |
| 第四章 分子模拟预测蛋白质钙结合位点 | 第45-63页 |
| 4.1 识别钙结合位点分子模拟方法的确立 | 第45-46页 |
| 4.2 分子模拟预测已知结构 CaBPs 中钙结合位点的可行性分析 | 第46-56页 |
| 4.2.1 已知结构蛋白分子模拟的方法和步骤 | 第46-47页 |
| 4.2.2 模拟结果 | 第47-56页 |
| 4.3 分子模拟预测未知结构 CaBPs 中钙结合位点的可行性分析 | 第56-61页 |
| 4.3.1 未知结构蛋白分子模拟的方法和步骤 | 第57-58页 |
| 4.3.2 模拟结果 | 第58-61页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第61-63页 |
| 第五章 TMEM16A 通道钙离子结合位点的研究 | 第63-77页 |
| 5.1 同源模建和分子动力学相结合预测 TMEM16A 通道的结合位点 | 第63-66页 |
| 5.1.1 TMEM16A 通道片段结构的建立 | 第63-65页 |
| 5.1.2 分子动力学预测 TMEM16A 通道片段的结合位点 | 第65-66页 |
| 5.2 电生理学实验验证理论预测的结合位点 | 第66-71页 |
| 5.2.1 定点突变改变了 TMEM16A 通道的 I-V 关系 | 第67-68页 |
| 5.2.2 定点突变改变了 TMEM16A 通道的钙离子浓度依赖关系 | 第68-70页 |
| 5.2.3 E447 的多种定点突变对 TMEM16A 通道钙离子依赖性的影响 | 第70-71页 |
| 5.3 钙离子结合机制的能量解释 | 第71-75页 |
| 5.3.1 能量分析的原理与方法 | 第71-72页 |
| 5.3.2 能量分析的计算结果 | 第72-75页 |
| 5.4 讨论与小结 | 第75-77页 |
| 第六章 结论与展望 | 第77-80页 |
| 参考文献 | 第80-87页 |
| 攻读博士学位期间所取得的相关科研成果 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88-90页 |
