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EV71全病毒灭活疫苗免疫机制的系统生物学研究

中文摘要第4-7页
Abstract第7-10页
第一章 前言第16-36页
    1.1 EV71概述第16-23页
        1.1.1 EV71病毒结构第16-17页
        1.1.2 EV71发病机制与疾病负担第17-19页
        1.1.3 EV71分子流行特征第19-21页
        1.1.4 EV71疫苗研究进展第21-23页
    1.2 系统生物学与疫苗第23-27页
        1.2.1 系统生物学技术简介第23-24页
        1.2.2 系统疫苗学第24-27页
    1.3 对系统疫苗学研究数据的Meta分析第27-29页
        1.3.1 Meta分析简介第27-28页
        1.3.2 Meta分析与疫苗评价第28-29页
    1.4 EV71疫苗诱导的初次免疫应答与再次应答比较第29-30页
        1.4.1 初次应答与再次应答第29-30页
        1.4.2 再次应答与疫苗保护第30页
    1.5 小片段DNA激活TLR9促进EV71疫苗体液应答第30-33页
        1.5.1 TLRs简介第30-31页
        1.5.2 TLRs与疫苗免疫第31-32页
        1.5.3 Vero细胞与Vero DNA第32-33页
    1.6 本论文立题依据第33-36页
第二章 Meta分析探讨疫苗接种早期共同应答机制第36-58页
    2.1 实验材料第36-40页
        2.1.1 Meta分析数据集第36-37页
        2.1.2 EV71疫苗受试者PBMC与血清样本第37-39页
        2.1.3 主要溶液配制第39页
        2.1.4 相关引物合成第39-40页
    2.2 实验方法第40-47页
        2.2.1 表达谱原始数据的预处理第40页
        2.2.2 单个数据样本合并分析第40页
        2.2.3 数据运算与统计分析 5第40-41页
        2.2.4 GO数据库对DEG进行功能富集第41页
        2.2.5 免疫后 3d与 7d亚组分析第41页
        2.2.6 Meta分析结果在EV71疫苗受试者中的验证第41-47页
    2.3 结果第47-54页
        2.3.1 入组数据信息第47-48页
        2.3.2 疫苗早期免疫应答DEGs第48-49页
        2.3.3 DEG功能富集与Pathway分析第49-50页
        2.3.4 免后 3d与 7d DEGs亚组分析第50-53页
        2.3.5 I型干扰素相关基因在EV71疫苗受试者中的验证第53-54页
    2.4 讨论第54-56页
    2.5 小结第56-58页
第三章 EV71疫苗诱导的初次应答与再次应答比较研究第58-76页
    3.1 实验材料第58-62页
        3.1.1 EV71灭活疫苗与疫苗原液第58页
        3.1.2 EV71疫苗受试者PBMC与血浆样本第58页
        3.1.3 主要试剂和仪器第58-60页
        3.1.4 主要溶液配制第60页
        3.1.5 相关引物合成第60-62页
    3.2 实验方法第62-64页
        3.2.1 疫苗接种与样本采集第62页
        3.2.2 PBMC体外EV71疫苗原液刺激第62-63页
        3.2.3 PBMC总RNA提取第63页
        3.2.4 转录组芯片检测第63页
        3.2.5 q-PCR方法对芯片数据的验证第63-64页
        3.2.6 蛋白芯片对细胞因子表达谱的检测第64页
        3.2.7 EV71中和抗体检测第64页
    3.3 结果第64-73页
        3.3.1 EV71疫苗接种后中和抗体应答第64-65页
        3.3.2 EV71疫苗初次应答与再次应答基因表达谱比较第65-71页
        3.3.3 q-PCR对部分DEGs的验证第71-72页
        3.3.4 初次应答与再次应答细胞因子谱第72-73页
    3.4 讨论第73-75页
    3.5 小结第75-76页
第四章 Vero小片段DNA激活TLR9促进EV71疫苗体液应答第76-96页
    4.1 实验材料第76-78页
        4.1.1 EV71灭活疫苗原液与细胞系第76页
        4.1.2 小鼠第76页
        4.1.3 伦理声明第76-77页
        4.1.4 主要试剂和仪器第77页
        4.1.5 引物探针的设计与合成第77-78页
    4.2 实验方法第78-82页
        4.2.1 疫苗接种与血清采集第78页
        4.2.2 脾淋巴细胞的分离与体外刺激第78-79页
        4.2.3 小鼠血清EV71中和抗体水平的检测第79页
        4.2.4 脾淋巴细胞总RNA提取第79页
        4.2.5 TLR4与TLR9基因表达水平的q-PCR检测第79-81页
        4.2.6 Vero细胞sf-DNA的制备第81-82页
    4.3 结果第82-91页
        4.3.1 EV71疫苗原液接种后中和抗体水平动态变化第82-83页
        4.3.2 体外EV71原液刺激后TLR4与TLR9基因表达水平第83-85页
        4.3.3 体内接种EV71原液后TLR4与TLR9基因表达水平第85-86页
        4.3.4 体外EV71原液刺激后细胞因子分泌水平第86-87页
        4.3.5 TLR4与TLR9基因敲除鼠对EV71原液中和抗体应答第87-88页
        4.3.6 Vero细胞sf-DNA体外刺激后TLR9基因表达水平第88-90页
        4.3.7 EV71原液定量添加sf-DNA后中和抗体应答水平第90-91页
    4.4 讨论第91-93页
    4.5 小结第93-96页
结论第96-98页
参考文献第98-110页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第110-112页
致谢第112页

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