| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第一章 CSFV 基因组及ORF 编码蛋白的结构和功能 | 第13-17页 |
| ·非编码区的结构和功能 | 第13-14页 |
| ·5'端非编码区（5' UTR） | 第13页 |
| ·3'端非编码区（3' UTR） | 第13-14页 |
| ·结构蛋白结构和功能 | 第14-15页 |
| ·C 基因和蛋白 | 第14页 |
| ·E0 基因和蛋白 | 第14页 |
| ·E1 基因和蛋白 | 第14页 |
| ·E2 基因和蛋白 | 第14-15页 |
| ·非结构蛋白结构和功能 | 第15-16页 |
| ·N~(pro) 基因和蛋白 | 第15页 |
| ·P7 基因和蛋白 | 第15页 |
| ·NS2、NS3 基因和蛋白 | 第15-16页 |
| ·NS4A、NS4B 基因和蛋白 | 第16页 |
| ·NS5A、NS5B 基因和蛋白 | 第16页 |
| ·小结 | 第16-17页 |
| 第二章 CSFV 分子流行病学研究进展 | 第17-24页 |
| ·CSFV 全基因组研究进展 | 第17-18页 |
| ·CSFV 基因分群研究进展 | 第18-19页 |
| ·基因分群标准的确立 | 第18页 |
| ·我国CSFV 基因分群研究 | 第18-19页 |
| ·CSFV 抗原表位研究进展 | 第19-21页 |
| ·抗原性相关蛋白的确认 | 第19-20页 |
| ·抗原表位区域划分 | 第20页 |
| ·抗原表位的精确定位 | 第20-21页 |
| ·我国CSFV E0、E2 研究概况 | 第21-23页 |
| ·我国CSFV E0 研究概况 | 第21-22页 |
| ·我国CSFV E2 研究概况 | 第22-23页 |
| ·小结 | 第23-24页 |
| 第三章 我国部分省区CSFV E2 基因遗传变异分析 | 第24-36页 |
| ·材料 | 第24-25页 |
| ·样品来源 | 第24页 |
| ·主要试剂 | 第24-25页 |
| ·主要仪器 | 第25页 |
| ·主要溶液配方 | 第25页 |
| ·方法 | 第25-30页 |
| ·引物合成 | 第25页 |
| ·病料的处理 | 第25-26页 |
| ·病料中总RNA 的提取 | 第26页 |
| ·反转录 | 第26-27页 |
| ·套式PCR 扩增E2 主要抗原区 | 第27页 |
| ·PCR 扩增产物的凝胶电泳 | 第27页 |
| ·胶回收纯化PCR 产物 | 第27-28页 |
| ·目的基因片段与pGEM-T easy 载体的连接 | 第28页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第28页 |
| ·转化实验 | 第28-29页 |
| ·质粒提取 | 第29页 |
| ·酶切鉴定重组质粒 | 第29页 |
| ·序列测定及结果分析 | 第29-30页 |
| ·结果与分析 | 第30-32页 |
| ·扩增及测序结果分析 | 第30页 |
| ·2008~2009 年流行株同源性比较 | 第30-31页 |
| ·E2 主要抗原区基因系统进化树分析 | 第31-32页 |
| ·2005~2009 年流行毒株与HCLV 同源性比较 | 第32页 |
| ·讨论 | 第32-35页 |
| ·E2 基因主要抗原区氨基酸变异特点 | 第32-34页 |
| ·流行株基因分群特点 | 第34-35页 |
| ·流行毒株变异的趋势 | 第35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第四章 我国部分省区CSFV E0 基因遗传变异分析 | 第36-42页 |
| ·材料 | 第36-37页 |
| ·病料来源 | 第36页 |
| ·主要试剂 | 第36页 |
| ·主要仪器 | 第36-37页 |
| ·方法 | 第37-38页 |
| ·引物合成 | 第37页 |
| ·病料处理与总RNA 提取 | 第37页 |
| ·反转录与PCR 扩增 | 第37页 |
| ·PCR 产物纯化回收及与T 载体连接 | 第37页 |
| ·转化、提取质粒和酶切鉴定 | 第37页 |
| ·序列测定及结果分析 | 第37-38页 |
| ·结果与分析 | 第38-40页 |
| ·PCR 扩增及测序结果分析 | 第38页 |
| ·流行毒株E0 与参考毒株同源性 | 第38页 |
| ·流行毒株E0 基因系统进化树 | 第38-40页 |
| ·讨论 | 第40-41页 |
| ·流行毒株遗传变异分析 | 第40-41页 |
| ·流行毒株基因分型 | 第41页 |
| ·流行毒株与HCLV 同源性分析 | 第41页 |
| ·小结 | 第41-42页 |
| 第五章 2009 年我国2 株CSFV 流行株全基因组测定与分析 | 第42-53页 |
| ·材料 | 第42-43页 |
| ·病料来源 | 第42-43页 |
| ·主要仪器 | 第43页 |
| ·试剂和菌种 | 第43页 |
| ·主要溶液配方 | 第43页 |
| ·方法 | 第43-46页 |
| ·引物合成 | 第43-44页 |
| ·CSFV 流行毒株病毒的分离 | 第44-45页 |
| ·细胞毒总RNA 的提取与反转录 | 第45页 |
| ·各片段的PCR 扩增 | 第45页 |
| ·PCR 产物纯化回收及与T 载体连接 | 第45页 |
| ·转化，提取质粒和酶切鉴定 | 第45-46页 |
| ·序列测定拼接及结果分析 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-51页 |
| ·全基因11 个片段RT-PCR 扩增结果 | 第46-47页 |
| ·序列测定拼接结果 | 第47页 |
| ·核苷酸与氨基酸同源性分析 | 第47-49页 |
| ·SXCDK、HEBZ 细胞表位变异分析 | 第49-50页 |
| ·系统发生树的绘制 | 第50-51页 |
| ·讨论 | 第51-52页 |
| ·全基因组扩增策略 | 第51页 |
| ·SXCDK 和HEBZ 与参考毒株的同源性 | 第51-52页 |
| ·SXCDK 和HEBZ 所在亚群毒株流行态势 | 第52页 |
| ·小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 附录 | 第59-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 作者简介 | 第62页 |
