棉花nsLTP家族基因全基因组鉴定及其表达特征分析
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-28页 |
| 第一章 植物nsLTP基因家族研究进展 | 第12-28页 |
| 1 nsLTP基因的系统分类 | 第12-14页 |
| 2 nsLTP的结构特征 | 第14-16页 |
| 3 植物中nsLTP基因的克隆、鉴定概况 | 第16-19页 |
| 4 nsLTP基因的表达模式 | 第19-20页 |
| 4.1 nsLTP基因的时空表达特异性 | 第19页 |
| 4.2 nsLTP基因的逆境、激素诱导表达 | 第19-20页 |
| 5 nsLTP基因的亚细胞定位 | 第20-21页 |
| 6 nsLTP基因的生物学功能 | 第21-24页 |
| 6.1 nsLTP基因与非生物胁迫 | 第21-22页 |
| 6.2 nsLTP基因与生物胁迫 | 第22页 |
| 6.3 nsLTP基因与有性生殖 | 第22-23页 |
| 6.4 nsLTP基因与根瘤形成 | 第23页 |
| 6.5 nsLTP基因与信号转导 | 第23-24页 |
| 6.6 nsLTP基因与细胞生长 | 第24页 |
| 6.7 nsLTP基因与过敏反应 | 第24页 |
| 7 nsLTP家族基因的进化 | 第24-26页 |
| 8 棉花中nsLTP基因研究进展 | 第26-28页 |
| 本研究的目的和意义 | 第28-30页 |
| 第二部分 研究报告 | 第30-68页 |
| 第二章 棉花中nsLTP家族基因的鉴定和分析 | 第30-56页 |
| 1 材料与方法 | 第30-32页 |
| 1.1 基因组数据准备 | 第30页 |
| 1.2 棉花nsLTP家族基因鉴定流程 | 第30-31页 |
| 1.3 nsLTP序列分析 | 第31页 |
| 1.4 进化树重构 | 第31页 |
| 1.5 nsLTP重复基因分析 | 第31-32页 |
| 1.6 陆地棉nsLTP基因GO富集 | 第32页 |
| 1.7 陆地棉nsLTP基因启动子分析 | 第32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-53页 |
| 2.1 nsLTP基因系统分类统计 | 第32-33页 |
| 2.2 nsLTP基因分类ECM结构特征统计 | 第33-34页 |
| 2.3 棉花nsLTP同源命名 | 第34-43页 |
| 2.4 nsLTP基因家族重复基因分析 | 第43-46页 |
| 2.5 nsLTP家族基因进化树 | 第46-47页 |
| 2.6 已报道陆地棉nsLTP基因分析 | 第47-49页 |
| 2.7 陆地棉nsLTP基因GO富集分析 | 第49-52页 |
| 2.8 陆地棉顺式调控元件分析 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-56页 |
| 3.1 nsLTP家族基因的系统分类方法 | 第53-54页 |
| 3.2 nsLTP家族基因的进化组成 | 第54-56页 |
| 第三章 陆地棉nsLTP基因表达分析及其验证 | 第56-68页 |
| 1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 1.1 植物材料 | 第56页 |
| 1.2 RNA提取和第一链cDNA合成 | 第56-57页 |
| 1.3 定量引物设计验证 | 第57页 |
| 1.4 实时荧光定量qRT-PCR分析 | 第57-58页 |
| 1.5 转录组数据分析方法 | 第58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-66页 |
| 2.1 nsLTP在陆地棉组织中表达分析 | 第58-62页 |
| 2.2 nsLTP基因在纤维突变体中表达分析 | 第62-63页 |
| 2.3 nsLTP在干旱、高盐胁迫下表达分析 | 第63-66页 |
| 3 讨论 | 第66-68页 |
| 3.1 数据均一化方法选择 | 第66-67页 |
| 3.2 nsLTP基因系统分类和表达特征聚类 | 第67页 |
| 3.3 nsLTP基因表达特征分析验证 | 第67-68页 |
| 全文结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-84页 |
| 附录 | 第84-104页 |
| 致谢 | 第104页 |
