| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-20页 |
| 第二章 荸荠携带DNA病毒的鉴定及其分子特性分析 | 第20-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-26页 |
| 2.1.1 采集荸荠样品信息 | 第20页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.3 小RNA测序及其生物信息学分析 | 第21-22页 |
| 2.1.4 CTAB法提取荸荠基因组总DNA | 第22页 |
| 2.1.5 WCSV-1的PCR检测田间样品感染率 | 第22-23页 |
| 2.1.6 PCR及其产物回收、克隆和测序 | 第23-24页 |
| 2.1.7 Southern Blot | 第24-26页 |
| 2.2 结果与分析 | 第26-44页 |
| 2.2.1 小RNA测序的clean reads数据分析 | 第26-27页 |
| 2.2.2 WCSV-1全基因组序列扩增结果 | 第27-29页 |
| 2.2.3 WCSV-1基因组结构及其序列分析 | 第29-35页 |
| 2.2.4 来源于病毒的sRNAs的分析 | 第35-37页 |
| 2.2.5 荸荠样品潜带WCSV-1的检测 | 第37-40页 |
| 2.2.6 Southern Blot分析 | 第40-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-47页 |
| 第三章 荸荠携带两种RNA病毒的基因组克隆及分子特性分析 | 第47-69页 |
| 3.1 材料与方法 | 第47-51页 |
| 3.1.1 植物材料与主要试剂 | 第47页 |
| 3.1.2 小RNA测序及生物信息学分析 | 第47-48页 |
| 3.1.3 引物设计与合成 | 第48页 |
| 3.1.4 荸荠样品总RNA的提取 | 第48页 |
| 3.1.5 cDNA的合成 | 第48-49页 |
| 3.1.6 RT-PCR | 第49-51页 |
| 3.1.7 RT-PCR产物回收、克隆及测序 | 第51页 |
| 3.1.8 WCV-1和WCV-2的检测引物 | 第51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-67页 |
| 3.2.1 小RNA测序的数据分析 | 第51页 |
| 3.2.2 荸荠WCV-1序列扩增及其分析 | 第51-58页 |
| 3.2.3 荸荠WCV-2序列扩增及其分析 | 第58-65页 |
| 3.2.4 田间荸荠样品潜带WCV-1和WCV-2的RT-PCR检测 | 第65-67页 |
| 3.3 讨论 | 第67-69页 |
| 第四章 结论与展望 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-80页 |
| 附录1 常用试剂和培养基配方 | 第80-82页 |
| 附录2 pMD18-T & pMD19-T克隆载体图谱 | 第82-83页 |
| 附录3 WCSV-1全基因组序列(7535 nt) | 第83-86页 |
| 附录4 研究生期间发表的研究论文和会议摘要 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87页 |
