| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩写词表 | 第18-21页 |
| 第一章 绪论 | 第21-31页 |
| 1.1 氮元素和氮循环的失衡 | 第21-22页 |
| 1.2 氮循环的关键微生物及功能基因 | 第22-24页 |
| 1.3 土壤中古菌的潜在作用 | 第24-25页 |
| 1.4 农田土壤中固氮及硝化作用及其影响因素 | 第25-28页 |
| 1.4.1 氮素 | 第26页 |
| 1.4.2 土壤种类和质地 | 第26-27页 |
| 1.4.3 pH值 | 第27页 |
| 1.4.4 根际效应(植物类型) | 第27-28页 |
| 1.4.5 氧气浓度 | 第28页 |
| 1.5 研究思路、研究目标和研究内容 | 第28-31页 |
| 第二章 材料和方法 | 第31-37页 |
| 2.1 材料 | 第31-32页 |
| 2.1.1 供试土壤和水稻品种 | 第31页 |
| 2.1.2 实验装备与仪器 | 第31页 |
| 2.1.3 实验试剂与试剂盒 | 第31-32页 |
| 2.2 方法 | 第32-35页 |
| 2.2.1 实验布置 | 第32页 |
| 2.2.2 ~(15)N同位素稀释方法 | 第32页 |
| 2.2.3 土壤铵离子、亚硝酸盐和硝酸盐浓度的测定 | 第32页 |
| 2.2.4 氧气浓度的测定 | 第32页 |
| 2.2.5 土壤含水量的测定 | 第32页 |
| 2.2.6 氨氧化潜力和亚硝酸盐氧化潜力的测定 | 第32-33页 |
| 2.2.7 扫描电镜 | 第33页 |
| 2.2.8 平板计数 | 第33页 |
| 2.2.9 土壤DNA样品的提取 | 第33页 |
| 2.2.10 土壤RNA样品的提取和纯化 | 第33页 |
| 2.2.11 RT-PCR | 第33页 |
| 2.2.12 PCR-T-RFLP | 第33-34页 |
| 2.2.13 建立克隆文库和测序 | 第34页 |
| 2.2.14 绝对定量PCR | 第34页 |
| 2.2.15 Illumina Miseq高通量测序及数据分析 | 第34页 |
| 2.2.16 统计分析 | 第34-35页 |
| 附表 | 第35-37页 |
| 第三章 固氮菌Pseudomonas stutzeri A1501接种对玉米生物固氮的贡献 | 第37-43页 |
| 3.1 前言 | 第37页 |
| 3.2 方法 | 第37-38页 |
| 3.2.1 玉米盆栽实验及~(15)N同位素稀释法的应用 | 第37-38页 |
| 3.2.2 土壤和根系的取样 | 第38页 |
| 3.2.3 接种固氮菌后玉米生物固氮量的计算 | 第38页 |
| 3.2.4 固氮菌在玉米根际的定殖效率及电镜观察 | 第38页 |
| 3.3 结果 | 第38-42页 |
| 3.3.1 接种固氮菌和水分管理对玉米生长量的影响 | 第38-39页 |
| 3.3.2 接种固氮菌对玉米生物固氮量的影响 | 第39页 |
| 3.3.3 固氮菌在玉米根际的定殖效率 | 第39-42页 |
| 3.4 小结 | 第42-43页 |
| 第四章 不同水分管理措施下接种固氮菌Pseudomonas stutzeri A1501对玉米根际微生物群落及活性的影响 | 第43-59页 |
| 4.1 前言 | 第43页 |
| 4.2 方法 | 第43-45页 |
| 4.2.1 盆栽实验和取样 | 第43-44页 |
| 4.2.2 DNA和RNA提取 | 第44页 |
| 4.2.3 qPCR和RT-qPCR | 第44页 |
| 4.2.4 微生物多样性测序及分析 | 第44页 |
| 4.2.5 数据处理及统计分析 | 第44-45页 |
| 4.3 结果和讨论 | 第45-58页 |
| 4.3.1 接种固氮菌和水分管理对玉米生长量的影响 | 第45页 |
| 4.3.2 固氮菌、氨氧化细菌(AOB)和古菌(AOA)的种群数量 | 第45-51页 |
| 4.3.3 固氮菌、氨氧化细菌(AOB)和古菌(AOA)的转录活性 | 第51-53页 |
| 4.3.4 玉米根际微生物群落结构 | 第53-58页 |
| 4.4 小结 | 第58-59页 |
| 第五章 不同氧气浓度下的硝化过程及其相关微生物的群落结构和活性的变化 | 第59-69页 |
| 5.1 前言 | 第59页 |
| 5.2 方法 | 第59-60页 |
| 5.2.1 培养条件和取样 | 第59-60页 |
| 5.2.2 分子实验 | 第60页 |
| 5.3 结果和讨论 | 第60-68页 |
| 5.3.1 不同氧气浓度下的硝化速率 | 第60页 |
| 5.3.2 不同氧气浓度下的硝化反应微生物群落结构变化 | 第60-62页 |
| 5.3.3 不同氧气浓度下的硝化反应微生物种群数量和转录活性变化 | 第62-67页 |
| 5.3.4 不同氧气浓度下的氨氧化细菌和古菌的数量和活性 | 第67-68页 |
| 5.4 小结 | 第68-69页 |
| 第六章 结论与展望 | 第69-71页 |
| 6.1 结论 | 第69-70页 |
| 6.2 研究展望 | 第70-71页 |
| 第七章 其他工作 | 第71-94页 |
| 7.1 前言 | 第71-74页 |
| 7.2 方法 | 第74-76页 |
| 7.2.1 培养条件和取样 | 第74-75页 |
| 7.2.2 N_2O气体测定 | 第75页 |
| 7.2.3 核酸提取 | 第75页 |
| 7.2.4 引物测试 | 第75页 |
| 7.2.5 qPCR和RT-qPCR | 第75页 |
| 7.2.6 微生物多样性分析 | 第75-76页 |
| 7.2.7 数据处理及统计分析 | 第76页 |
| 7.3 初步结果 | 第76-77页 |
| 附图表 | 第77-94页 |
| 参考文献 | 第94-103页 |
| 个人简历 | 第103-104页 |
