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宁夏野鸟携带病毒宏基因组分析

摘要第8-9页
英文摘要第9页
1 引言第11-18页
    1.1 新发传染病及其危害第11-13页
        1.1.1 禽流感病毒第11-12页
        1.1.2 西尼罗病毒(WNV)第12页
        1.1.3 亨德拉病毒(HeV)和尼帕病毒第12-13页
    1.2 野鸟在新发传染病发生及流行中的作用第13-16页
        1.2.1 野鸟生活习性及携带病毒特征第13-14页
        1.2.2 由野鸟携带病原引起的新发传染病第14页
        1.2.3 野鸟传播新发病原的途径第14-15页
        1.2.4 影响野鸟携带病毒传播途径的因素第15页
        1.2.5 我国对野鸟携带病毒的调查进展第15-16页
    1.3 病毒宏基因组学研究进展第16-17页
    1.4 研究目的和意义第17-18页
2 材料和方法第18-25页
    2.1 实验材料第18-19页
        2.1.1 病毒和细胞第18页
        2.1.2 样品采集第18页
        2.1.3 主要试剂第18-19页
        2.1.4 主要仪器第19页
    2.2 实验方法第19-25页
        2.2.1 样品前处理方法的建立第19-21页
        2.2.2 野鸟粪便处理第21-22页
        2.2.3 野鸟粪便核酸提取第22页
        2.2.4 Viral Meta反转录第22页
        2.2.5 Viral Meta随机PCR扩增第22页
        2.2.6 随机PCR产物纯化及电泳第22-23页
        2.2.7 Illumina高通量测序第23页
        2.2.8 宏基因组学注释第23页
        2.2.9 特定病毒PCR/RT-PCR检测第23-25页
3 结果与分析第25-37页
    3.1 荧光定量PCR标准曲线第25页
    3.2 荧光定量PCR检测各组中病毒的载量结果第25页
    3.3 高通量测序DNA样品的制备第25-26页
    3.4 病毒宏基因组学测序结果第26-33页
    3.5 病毒特异性检测结果第33-37页
        3.5.1 禽流感病毒检测结果第33-34页
        3.5.2 圆环病毒的检测结果第34-37页
4 讨论第37-40页
5 结论第40-41页
致谢第41-42页
参考文献第42-50页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第50页

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