宁夏野鸟携带病毒宏基因组分析
摘要 | 第8-9页 |
英文摘要 | 第9页 |
1 引言 | 第11-18页 |
1.1 新发传染病及其危害 | 第11-13页 |
1.1.1 禽流感病毒 | 第11-12页 |
1.1.2 西尼罗病毒(WNV) | 第12页 |
1.1.3 亨德拉病毒(HeV)和尼帕病毒 | 第12-13页 |
1.2 野鸟在新发传染病发生及流行中的作用 | 第13-16页 |
1.2.1 野鸟生活习性及携带病毒特征 | 第13-14页 |
1.2.2 由野鸟携带病原引起的新发传染病 | 第14页 |
1.2.3 野鸟传播新发病原的途径 | 第14-15页 |
1.2.4 影响野鸟携带病毒传播途径的因素 | 第15页 |
1.2.5 我国对野鸟携带病毒的调查进展 | 第15-16页 |
1.3 病毒宏基因组学研究进展 | 第16-17页 |
1.4 研究目的和意义 | 第17-18页 |
2 材料和方法 | 第18-25页 |
2.1 实验材料 | 第18-19页 |
2.1.1 病毒和细胞 | 第18页 |
2.1.2 样品采集 | 第18页 |
2.1.3 主要试剂 | 第18-19页 |
2.1.4 主要仪器 | 第19页 |
2.2 实验方法 | 第19-25页 |
2.2.1 样品前处理方法的建立 | 第19-21页 |
2.2.2 野鸟粪便处理 | 第21-22页 |
2.2.3 野鸟粪便核酸提取 | 第22页 |
2.2.4 Viral Meta反转录 | 第22页 |
2.2.5 Viral Meta随机PCR扩增 | 第22页 |
2.2.6 随机PCR产物纯化及电泳 | 第22-23页 |
2.2.7 Illumina高通量测序 | 第23页 |
2.2.8 宏基因组学注释 | 第23页 |
2.2.9 特定病毒PCR/RT-PCR检测 | 第23-25页 |
3 结果与分析 | 第25-37页 |
3.1 荧光定量PCR标准曲线 | 第25页 |
3.2 荧光定量PCR检测各组中病毒的载量结果 | 第25页 |
3.3 高通量测序DNA样品的制备 | 第25-26页 |
3.4 病毒宏基因组学测序结果 | 第26-33页 |
3.5 病毒特异性检测结果 | 第33-37页 |
3.5.1 禽流感病毒检测结果 | 第33-34页 |
3.5.2 圆环病毒的检测结果 | 第34-37页 |
4 讨论 | 第37-40页 |
5 结论 | 第40-41页 |
致谢 | 第41-42页 |
参考文献 | 第42-50页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第50页 |