西门塔尔牛、雪龙黑牛两群体部分胴体性状全基因组关联分析
摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6页 |
英文缩略表 | 第9-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-16页 |
1.1 全基因组关联分析 | 第12页 |
1.2 全基因组关联分析研究的试验设计 | 第12-13页 |
1.3 GWAS的群体分层矫正 | 第13页 |
1.4 现阶段GWAS方法研究进展 | 第13-14页 |
1.5 GWAS在肉(奶)牛中的研究进展 | 第14-15页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第15-16页 |
第二章 材料与方法 | 第16-21页 |
2.1 实验材料 | 第16-18页 |
2.1.1 资源群体构建 | 第16页 |
2.1.2 表型数据采集 | 第16-17页 |
2.1.3 基因型数据获取 | 第17-18页 |
2.2 实验方法 | 第18-21页 |
2.2.1 表型数据矫正 | 第18页 |
2.2.2 SNP芯 片数据质量控制 | 第18页 |
2.2.3 主成分分析 | 第18-19页 |
2.2.4 全基因组关联分析 | 第19-21页 |
第三章 结果与分析 | 第21-29页 |
3.1 表型数据基本统计量 | 第21-22页 |
3.2 基因型数据质量控制 | 第22页 |
3.3 群体分层分析 | 第22-23页 |
3.4 单群体内GWAS分析 | 第23-26页 |
3.4.1 西门塔尔牛群体GWAS分 析 | 第23-25页 |
3.4.2 雪龙黑牛群体GWAS分 析 | 第25-26页 |
3.5 混合群体GWAS分析 | 第26-29页 |
第四章 讨论 | 第29-32页 |
4.1 单群体GWAS的应用 | 第29-30页 |
4.2 混合群体在GWAS中的应用 | 第30-32页 |
第五章 全文总结 | 第32-33页 |
5.1 结论 | 第32页 |
5.2 下一步工作 | 第32-33页 |
参考文献 | 第33-38页 |
附录 | 第38-50页 |
致谢 | 第50-51页 |
作者简历 | 第51页 |