| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第9-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-11页 |
| 1.2 表观遗传学的简介 | 第11-12页 |
| 1.3 5-hmC简介 | 第12-16页 |
| 1.3.1 5-hmC概述 | 第12-13页 |
| 1.3.2 5-hmC在基因组的分布以其基因表达水平 | 第13页 |
| 1.3.3 5-hmC的生物学作用 | 第13-15页 |
| 1.3.4 5-hmC与癌症等疾病的相关研究 | 第15-16页 |
| 1.4 hMeDIP-chip技术的简介 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-26页 |
| 2.1 技术路线 | 第17-18页 |
| 2.2 研究对象 | 第18页 |
| 2.3 实验仪器与试剂 | 第18-19页 |
| 2.3.1 实验主要仪器 | 第18-19页 |
| 2.3.2 实验主要试剂 | 第19页 |
| 2.4 实验步骤 | 第19-25页 |
| 2.4.1 全基因组DNA的提取、消化 | 第19-21页 |
| 2.4.2 DNA免疫共沉淀 | 第21页 |
| 2.4.3 荧光标记与芯片杂交 | 第21页 |
| 2.4.4 图像采集和数据分析 | 第21-24页 |
| 2.4.5 实时定量PCR | 第24-25页 |
| 2.5 Signalmap软件的使用 | 第25-26页 |
| 3 结果 | 第26-50页 |
| 3.1 hMeDIP-chip芯片质量评估 | 第26页 |
| 3.2 总DNA质量检测结果 | 第26-28页 |
| 3.3 富集效率评估结果 | 第28-29页 |
| 3.4 hMeDIP-chip芯片结果 | 第29-30页 |
| 3.5 Signalmap软件分析结果 | 第30-32页 |
| 3.6 5-hmC差异位点及其对应基因的筛选 | 第32-37页 |
| 3.6.1 5-hmC差异基因在全基因组的分布 | 第32页 |
| 3.6.2 疾病组和对照组5-hmC状态的对比 | 第32-37页 |
| 3.7 5-hmC差异位点的层次聚类分析 | 第37-39页 |
| 3.8 5-hmC差异基因的功能分析 | 第39-49页 |
| 3.8.1 GO功能分析 | 第39-44页 |
| 3.8.2 pathway分析 | 第44-49页 |
| 3.9 实时定量PCR验证结果 | 第49-50页 |
| 4 讨论 | 第50-52页 |
| 5 结论与展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 附录 | 第58-70页 |
| 读硕期间学术研究情况 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |