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基于SLAF-seq测序的抗玉米穗粒腐病分子标记开发及候选基因预测

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
1 文献综述第11-20页
    1.1 玉米穗粒腐病第11-16页
        1.1.1 病原菌第11-12页
        1.1.2 传播途径及人工接菌方法第12页
        1.1.3 影响玉米穗粒腐病发病的因素第12-13页
        1.1.4 玉米穗粒腐病的危害第13-14页
        1.1.5 玉米穗粒腐病的分级标准第14-15页
        1.1.6 玉米穗粒腐病抗性QTL研究现状第15-16页
    1.2 染色体片段代换系第16-18页
        1.2.1 染色体片段代换系的构建第17页
        1.2.2 染色体片段代换系在QTL中的应用第17-18页
    1.3 简化基因组测序第18-20页
        1.3.1 基本技术原理第18-19页
        1.3.2 SLAF-seq技术的优势第19页
        1.3.3 SLAF-seq技术的应用第19-20页
2 立题依据第20-21页
    2.1 研究目的、意义及主要研究内容第20页
    2.2 技术路线第20-21页
3 材料与方法第21-26页
    3.1 材料第21页
        3.1.1 玉米种质材料第21页
        3.1.2 病原菌第21页
    3.2 方法第21-26页
        3.2.1 接菌菌液准备第21-22页
        3.2.2 人工接菌及田间病级鉴定第22-23页
        3.2.3 SLAF-seq测序第23页
        3.2.4 分子标记开发第23-25页
        3.2.5 抗病关联染色体区段内候选基因的挖掘及初步验证第25-26页
4 结果与分析第26-39页
    4.1 SLAF-seq测序结果第26-31页
        4.1.1 测序总数据量第26页
        4.1.2 SLAF标签定义和多态性分析第26-27页
        4.1.3 SLAF标签及Marker在各染色体上的分布第27-28页
        4.1.4 样品间多态性分析与统计第28页
        4.1.5 代换系基因型来源及抗病性状的关联性分析第28-31页
    4.2 特异性分子标记的开发与验证第31-34页
        4.2.1 候选区段内已知位点的收集第31-32页
        4.2.2 候选区段内新分子标记的开发第32-33页
        4.2.3 多态性分子标记的验证第33-34页
    4.3 抗病候选基因的挖掘与初步验证第34-39页
        4.3.1 候选区段内基因分析第34-35页
        4.3.2 候选基因初步验证第35-39页
5 讨论与结论第39-43页
    5.1 讨论第39-42页
        5.1.1 玉米穗粒腐病定位研究第39页
        5.1.2 SLAF-seq技术与染色体片段代换系的结合应用第39-40页
        5.1.3 分子标记辅助选择在品种选育中的应用第40-41页
        5.1.4 候选区段内抗病基因的成簇存在第41页
        5.1.5 候选基因的验证第41-42页
    5.2 结论第42-43页
参考文献第43-49页
致谢第49页

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