四川烟区烤烟基因表达谱差异分析
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第10-24页 |
| 1.1 烟叶的质量 | 第10-11页 |
| 1.2 生态因素对烟叶品质形成的影响 | 第11-15页 |
| 1.2.1 温度对烟叶品质的影响 | 第11-12页 |
| 1.2.2 光照对烟叶品质的影响 | 第12-13页 |
| 1.2.3 降水对烟叶品质的影响 | 第13页 |
| 1.2.4 海拔对烟叶品质的影响 | 第13-14页 |
| 1.2.5 土壤对烟叶品质的影响 | 第14-15页 |
| 1.3 四川烤烟主产区生态条件及烟叶质量 | 第15-18页 |
| 1.3.1 四川烤烟主产区生态条件 | 第16-17页 |
| 1.3.2 四川烤烟主产区烟叶质量 | 第17-18页 |
| 1.4 基因表达谱的研究进展 | 第18-22页 |
| 1.4.1 基因表达谱的研究方法 | 第18-20页 |
| 1.4.2 植物基因表达谱研究进展 | 第20-22页 |
| 1.5 Real-time PCR技术 | 第22-23页 |
| 1.6 立题依据 | 第23-24页 |
| 2 研究内容与技术路线 | 第24-25页 |
| 2.1 研究内容 | 第24页 |
| 2.2 技术路线 | 第24-25页 |
| 3 材料与方法 | 第25-33页 |
| 3.1 试验材料 | 第25页 |
| 3.1.1 烟草样品 | 第25页 |
| 3.1.2 烟草基因表达谱芯片 | 第25页 |
| 3.1.3 基因芯片检测设备 | 第25页 |
| 3.2 试验方法 | 第25-33页 |
| 3.2.1 采样方法 | 第25-26页 |
| 3.2.2 RNA的提取及检测 | 第26-27页 |
| 3.2.3 芯片检测 | 第27-28页 |
| 3.2.4 数据的分析 | 第28-29页 |
| 3.2.5 芯片检测结果的RT-PCR验证 | 第29-33页 |
| 4 结果与分析 | 第33-96页 |
| 4.1 烟草总RNA提取与质量检验 | 第33-35页 |
| 4.2 烟草基因表达谱芯片数据的有效性 | 第35-41页 |
| 4.2.1 烟草基因表达谱芯片数据的统计分析 | 第35-39页 |
| 4.2.2 烟草基因表达谱芯片数据的聚类分析 | 第39页 |
| 4.2.3 Real-time PCR验证 | 第39-41页 |
| 4.3 差异表达基因总体特征 | 第41-42页 |
| 4.3.1 旺长期 | 第41页 |
| 4.3.2 打顶期 | 第41-42页 |
| 4.4 差异表达基因功能分类 | 第42-47页 |
| 4.5 差异表达基因代谢通路分析 | 第47-51页 |
| 4.6 光合作用中差异表达的基因分析 | 第51-56页 |
| 4.6.1 光反应中差异表达的基因 | 第51-54页 |
| 4.6.2 暗反应中差异表达的基因 | 第54-56页 |
| 4.7 类胡箩卜素代谢途径中差异表达的基因 | 第56-59页 |
| 4.8 淀粉和蔗糖代谢途径中差异表达的基因 | 第59-63页 |
| 4.9 信号传导途径中差异表达的基因 | 第63-71页 |
| 4.10 植物激素代谢途径中差异表达的基因 | 第71-77页 |
| 4.11 参与离子跨膜运输过程的差异表达基因 | 第77-90页 |
| 4.11.1 编码大量元素差异表达的基因 | 第77-84页 |
| 4.11.2 微量元素转运相关差异表达的基因 | 第84-87页 |
| 4.11.3 编码阳离子差异表达的基因 | 第87-90页 |
| 4.12 参与形态解剖结构形成的差异表达基因 | 第90-96页 |
| 5 讨论 | 第96-102页 |
| 5.1 基因芯片技术的可靠性 | 第96页 |
| 5.2 基因芯片数据的有效性 | 第96页 |
| 5.3 GO功能分析 | 第96-100页 |
| 5.3.1 光合作用光反应中差异表达的基因 | 第97页 |
| 5.3.2 碳固定中差异表达的基因 | 第97-98页 |
| 5.3.3 信号传导及植物激素中差异表达的基因 | 第98-99页 |
| 5.3.4 离子跨膜转运中差异表达的基因 | 第99页 |
| 5.3.5 解剖结构中差异表达的基因 | 第99-100页 |
| 5.4 差异表达基因富集的Pathway分析 | 第100-102页 |
| 5.4.1 类胡萝卜素代谢途径 | 第100-101页 |
| 5.4.2 淀粉和蔗糖代谢途径中差异表达的基因 | 第101-102页 |
| 6 结论 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
