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家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)休眠孢子和发芽孢子转录组、蛋白质组定量差异分析及NbRBL蛋白功能的初步研究

致谢第7-11页
中文摘要第11-14页
Abstract第14-16页
第1章 文献综述第17-34页
    1.1 微孢子虫的研究意义第17-19页
    1.2 微孢子虫的生活史第19-22页
    1.3 微孢子虫的侵染方式研究第22-24页
    1.4 生物信息学方法对微孢子虫研究的帮助第24-26页
    1.5 蓖麻毒素及其B链凝集素生物学特性研究第26-30页
        1.5.1 蓖麻毒素的结构、功能及生物学特点第26-28页
        1.5.2 凝集素及Ricin-B-Lectin蛋白的功能研究第28-30页
    1.6 研究目的与意义第30-32页
    1.7 研究内容和技术路线第32-34页
        1.7.1 研究内容第32页
        1.7.2 技术路线第32-34页
第2章 家蚕微孢子虫发芽孢子和休眠孢子转录组学差异分析第34-60页
    2.1 实验材料第34-39页
        2.1.1 生物材料第34页
        2.1.2 主要仪器与设备第34-35页
        2.1.3 主要试剂及配制第35-39页
    2.2 实验方法第39-47页
        2.2.1 家蚕微孢子虫繁殖和纯化第39页
        2.2.2 家蚕微孢子虫人工发芽处理第39页
        2.2.3 家蚕微孢子虫NGS和GS处理组总RNA的提取第39-40页
        2.2.4 家蚕微孢子虫NGS和GS处理组转录组测序及序列拼接第40-41页
        2.2.5 家蚕微孢子虫NGS和GS处理组基因功能注释和转录组分析第41页
        2.2.6 家蚕微孢子虫NGS和GS处理组差异表达基因分析第41页
        2.2.7 实时荧光定量PCR验证第41-45页
        2.2.8 总蛋白的提取及Western Blotting验证第45-47页
    2.3 结果第47-57页
        2.3.1 家蚕微孢子虫休眠孢子和发芽孢子比较观察第47-48页
        2.3.2 家蚕微孢子虫转录组序列拼接和分析第48-49页
        2.3.3 基因注释和差异基因表达分析第49-52页
        2.3.4 差异表达基因聚类分析和功能富集性分析第52-55页
        2.3.5 家蚕微孢子虫发芽相关候选基因的预测第55-57页
    2.4 讨论第57-60页
第3章 家蚕微孢子虫发芽孢子和休眠孢子蛋白质组学Label-free定量分析第60-87页
    3.1 实验材料第60-65页
        3.1.1 生物材料第60页
        3.1.2 主要仪器与设备第60-61页
        3.1.3 主要试剂及配制第61-65页
    3.2 实验方法第65-72页
        3.2.1 家蚕微孢子虫繁殖和纯化第65页
        3.2.2 家蚕微孢子虫人工发芽处理第65页
        3.2.3 家蚕微孢子虫NGS组和GS组总蛋白提取及FASP法酶解处理第65-67页
        3.2.4 家蚕微孢子虫NGS组和GS组总蛋白液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析第67-68页
        3.2.5 数据的采集与分析第68页
        3.2.6 实时荧光定量PCR验证第68-71页
        3.2.7 Western Blotting检测第71-72页
    3.3 结果第72-82页
        3.3.1 家蚕微孢子虫NGS和GS处理组的比较观察及总蛋白SDS-PAGE电泳检测第72-74页
        3.3.2 家蚕微孢子虫NGS和GS处理组的蛋白质组学Label-free定量分析第74-77页
        3.3.3 家蚕微孢子虫NGS和GS组鉴定蛋白的GO、KEGG和酶分类分析第77-82页
    3.4 讨论第82-87页
第4章 NbRBL蛋白的表达、定位及其在家蚕微孢子虫侵染过程中的作用研究第87-112页
    4.1 实验材料第87-92页
        4.1.1 生物材料第87页
        4.1.2 主要仪器与设备第87-88页
        4.1.3 主要试剂及配制第88-92页
    4.2 实验方法第92-101页
        4.2.1 NbRBL蛋白序列分析第92页
        4.2.2 NbRBL基因在不同N.bombycis孢子发育过程的表达差异第92-93页
        4.2.3 表达质粒的构建第93-96页
        4.2.4 重组菌的诱导表达及SDS-PAGE分析第96-98页
        4.2.5 Anti-NbRBL多克隆抗体的制备第98页
        4.2.6 Western blotting验证第98页
        4.2.7 间接免疫荧光试验(IFA)第98-99页
        4.2.8 NbRBL蛋白对N.bombycis孢子侵染BmN细胞的作用研究第99-101页
    4.3 结果第101-109页
        4.3.1 NbRBL蛋白序列分析第101-102页
        4.3.2 NbRBL基因在不同Nb孢子发育过程的表达差异第102-103页
        4.3.3 NbRBL基因的克隆、原核表达及抗体验证第103-105页
        4.3.4 激光共聚焦显微镜对NbRBL蛋白在家蚕微孢子虫中的定位第105-106页
        4.3.5 NbRBL蛋白在家蚕微孢子虫侵染过程中的作用第106-109页
    4.4 讨论第109-112页
第5章 研究创新点与展望第112-113页
    5.1 研究创新点第112页
    5.2 研究展望第112-113页
参考文献第113-122页
博士期间发表论文第122-123页
附录第123-132页

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