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拟盘多毛孢属的分类及分子系统学和分子条形码研究

摘要第4-7页
Abstract第7-10页
缩写表第11-15页
1 前言第15-28页
    1.1 引言第15页
    1.2 拟盘多毛孢属的形态分类第15-17页
        1.2.1 分类发展及形态分类依据第15-16页
        1.2.2 形态分类学的局限性第16-17页
    1.3 植物病原拟盘多毛孢与内生拟盘多毛孢第17-23页
        1.3.1 植物病原拟盘多毛孢病害及其发生情况第17-18页
        1.3.2 植物内生拟盘多毛孢及其多样性第18-22页
        1.3.3 植物病原与内生拟盘多毛孢之间的关系第22-23页
    1.4 拟盘多毛孢属分子系统学第23-25页
    1.5 拟盘多毛孢属分子条形码研究第25-27页
    1.6 本研究的目标第27-28页
2 拟盘多毛孢种类鉴定和多样性分析第28-55页
    2.1 引言第28-29页
    2.2 材料与方法第29-33页
        2.2.1 样本的采集及菌株的来源第29-30页
        2.2.2 拟盘多毛孢的分离、纯化和形态鉴定第30-31页
        2.2.3 DNA提取、扩增、测序及数据处理第31-33页
        2.2.4 多样性分析方法第33页
    2.3 结果第33-52页
        2.3.1 拟盘多毛孢种类鉴定结果第33-48页
        2.3.2 内生拟盘多毛孢的多样性分析第48-52页
    2.4 讨论第52-55页
3 拟盘多毛孢属的分子系统学的研究第55-73页
    3.1 引言第55-56页
    3.2 材料与方法第56页
        3.2.1 样品采集第56页
        3.2.2 DNA提取、扩增、测序第56页
        3.2.3 拟盘多毛孢的分离、纯化和鉴定第56页
        3.2.4 系统学分析第56页
    3.3 结果第56-70页
        3.3.1 拟盘多毛孢属的ITS系统树发育关系第57页
        3.3.2 拟盘多毛孢属的β-tubulin系统树发育关系第57页
        3.3.3 拟盘多毛孢属的EF1-α系统树发育关系第57-58页
        3.3.4 拟盘多毛孢属的GPDH系统树发育关系第58-63页
        3.3.5 用β-tub和EF1-α双基因片段联合建树分析探讨拟盘多毛孢属的系统发育关系第63页
        3.3.6 用以ITS、β-tub和EF1-α片段联合建树分析探讨拟盘多毛孢属的系统树发育关系第63页
        3.3.7 用以上四个基因片段联合建树分析探讨拟盘多毛孢属的系统树发育关系第63-68页
        3.3.8 从形态学角度评估分子系统学第68-70页
    3.4 讨论第70-73页
        3.4.1 单个基因片段分析拟盘多毛孢分生孢子的形态特征分类地位第70-72页
        3.4.2 多基因片段分析拟盘多毛孢属系统进化关系第72-73页
4 拟盘多毛孢属的分子条形码的研究第73-102页
    4.1 引言第73-74页
    4.2 材料与方法第74页
        4.2.1 拟盘多毛孢菌株第74页
        4.2.2 DNA提取、扩增、测序第74页
        4.2.3 数据处理第74页
    4.3 结果第74-99页
        4.3.1 供试菌株4个备选DNA片段的PCR和测序成功率第80页
        4.3.2 供试菌株备选DNA片段的种间和种内相似率第80-84页
        4.3.3 备选DNA片段的聚类分析第84-99页
    4.4 讨论第99-102页
        4.4.1 备选DNA片段的分化阈值第99页
        4.4.2 备选DNA片段的聚类分析第99-102页
5 用分子系统学探讨杨梅的病原拟盘多毛孢与内生拟盘多毛孢之间关系第102-122页
    5.1 引言第102页
    5.2 材料与方法第102-103页
        5.2.1 菌株资源第102-103页
        5.2.2 DNA提取、扩增、测序第103页
        5.2.3 拟盘多毛孢的分离、纯化和鉴定第103页
        5.2.4 数据分析第103页
    5.3 结果第103-121页
        5.3.1 杨梅内生和病原拟盘多毛孢资源第103-111页
        5.3.2 不同系统发育树内生和病原拟盘多毛孢之间的关系第111页
        5.3.3 不同系统发育树杨梅拟盘多毛孢定殖与植物器官之间的关系第111-121页
    5.4 讨论第121-122页
6 结论第122-126页
    6.1 全文总结第122-125页
    6.2 论文创新点第125页
    6.3 问题与展望第125-126页
致谢第126-127页
参考文献第127-137页
附录第137-138页

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